Een monstervoorbereiding voor het vangen van eiwitten voor traanproteomics door middel van vloeistofchromatografie-tandem massaspectrometrie

Traanvocht is een van de gemakkelijk toegankelijke biovloeistoffen die niet-invasief kunnen worden verzameld. Traanproteomics heeft het potentieel om biomarkers te ontdekken voor verschillende oogziekten en aandoeningen. Naar verluidt is de suspensievangkolom een efficiënte en gebruiksvriendelijke workflow voor monstervoorbereiding voor de brede toepassing van stroomafwaartse proteomische analyse. Toch is deze strategie niet goed bestudeerd in de analyse van menselijk traanproteoom. Het huidige protocol beschrijft een geïntegreerde workflow van klinische menselijke traanmonsters tot gezuiverde peptiden voor niet-invasief onderzoek naar traaneiwitbiomarkers met behulp van massaspectrometrie, dat inzicht geeft in ziektebiomarkers en monitoring in combinatie met bioinformatica-analyse. Een monstervoorbereiding voor het vangen van eiwitsuspensie werd toegepast en demonstreerde de ontdekking van traanproteoom met snelle, reproduceerbare en gebruiksvriendelijke procedures, als een universele, geoptimaliseerde monstervoorbereiding voor menselijke traanvloeistofanalyse. Met name de procedure voor het vangen van suspensie presteerde beter dan de monstervoorbereiding in de oplossing in termen van peptideherstel, eiwitidentificatie en kortere monstervoorbereidingstijd.