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Medicine

तरल क्रोमैटोग्राफी-टेंडम मास स्पेक्ट्रोमेट्री द्वारा आंसू प्रोटिओमिक्स के लिए एक प्रोटीन सस्पेंशन-ट्रैपिंग नमूना तैयारी

Published: December 1st, 2023

DOI:

10.3791/64617

1Centre for Myopia Research, School of Optometry, The Hong Kong Polytechnic University, 2Centre for Eye and Vision Research (CEVR), 3Research Centre for SHARP Vision (RCSV), The Hong Kong Polytechnic University, 4Research Centre for Chinese Medicine Innovation (RCMI), The Hong Kong Polytechnic University

* These authors contributed equally

Abstract

आंसू द्रव आसानी से सुलभ बायोफ्लुइड्स में से एक है जिसे गैर-आक्रामक रूप से एकत्र किया जा सकता है। आंसू प्रोटिओमिक्स में कई ओकुलर रोगों और स्थितियों के लिए बायोमार्कर की खोज करने की क्षमता है। सस्पेंशन ट्रैपिंग कॉलम को डाउनस्ट्रीम प्रोटिओमिक विश्लेषण के व्यापक अनुप्रयोग के लिए एक कुशल और उपयोगकर्ता के अनुकूल नमूना तैयारी वर्कफ़्लो बताया गया है। फिर भी, मानव आंसू प्रोटिओम के विश्लेषण में इस रणनीति का अच्छी तरह से अध्ययन नहीं किया गया है। वर्तमान प्रोटोकॉल मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग करके गैर-इनवेसिव टियर प्रोटीन बायोमार्कर अनुसंधान के लिए नैदानिक मानव आंसू नमूनों से शुद्ध पेप्टाइड्स तक एक एकीकृत वर्कफ़्लो का वर्णन करता है, जो जैव सूचना विज्ञान विश्लेषण के साथ संयुक्त होने पर रोग बायोमार्कर और निगरानी में अंतर्दृष्टि प्रदान करता है। एक प्रोटीन सस्पेंशन ट्रैपिंग नमूना तैयारी लागू की गई थी और मानव आंसू द्रव विश्लेषण के लिए एक सार्वभौमिक, अनुकूलित नमूना तैयारी के रूप में तेज, प्रतिलिपि प्रस्तुत करने योग्य और उपयोगकर्ता के अनुकूल प्रक्रियाओं के साथ आंसू प्रोटिओम की खोज का प्रदर्शन किया गया था। विशेष रूप से, सस्पेंशन ट्रैपिंग प्रक्रिया ने पेप्टाइड रिकवरी, प्रोटीन पहचान और कम नमूना तैयारी समय के मामले में समाधान नमूना तैयारी से बेहतर प्रदर्शन किया।

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