Una preparazione del campione di intrappolamento della sospensione proteica per la proteomica lacrimale mediante cromatografia liquida-spettrometria di massa tandem

Il liquido lacrimale è uno dei biofluidi facilmente accessibili che possono essere raccolti in modo non invasivo. La proteomica lacrimale ha il potenziale per scoprire biomarcatori per diverse malattie e condizioni oculari. La colonna di intrappolamento in sospensione è stata segnalata per essere un flusso di lavoro efficiente e facile da usare per la preparazione dei campioni per l'ampia applicazione dell'analisi proteomica a valle. Tuttavia, questa strategia non è stata ben studiata nell'analisi del proteoma lacrimale umano. Il presente protocollo descrive un flusso di lavoro integrato da campioni clinici di lacrime umane a peptidi purificati per la ricerca non invasiva di biomarcatori di proteine lacrimali utilizzando la spettrometria di massa, che fornisce approfondimenti sui biomarcatori di malattia e sul monitoraggio in combinazione con l'analisi bioinformatica. È stata applicata una preparazione del campione per l'intrappolamento delle sospensioni proteiche che ha dimostrato la scoperta del proteoma lacrimale con procedure rapide, riproducibili e di facile utilizzo, come preparazione del campione universale e ottimizzata per l'analisi del liquido lacrimale umano. In particolare, la procedura di intrappolamento in sospensione ha superato la preparazione del campione in soluzione in termini di recupero dei peptidi, identificazione delle proteine e tempi di preparazione del campione più brevi.