液体クロマトグラフィータンデム質量分析による涙液プロテオミクスのためのタンパク質懸濁液トラップサンプル調製

涙液は、非侵襲的に採取できる簡単にアクセスできる生体液の1つです。涙液プロテオミクスは、いくつかの眼疾患や状態のバイオマーカーを発見する可能性を秘めています。懸濁液トラップカラムは、ダウンストリームのプロテオミクス解析の幅広いアプリケーションのための効率的でユーザーフレンドリーなサンプル前処理ワークフローであることが報告されています。しかし、この戦略は、ヒト涙液プロテオームの解析では十分に研究されていません。本プロトコルは、バイオインフォマティクス分析と組み合わせた場合に疾患バイオマーカーとモニタリングに関する洞察を提供する質量分析を使用した非侵襲的涙液タンパク質バイオマーカー研究のための臨床ヒト涙液サンプルから精製ペプチドへの統合ワークフローを説明しています。タンパク質懸濁液トラップサンプル調製を適用し、ヒト涙液分析用の汎用的で最適化されたサンプル調製として、迅速で再現性が高く、ユーザーフレンドリーな手順で涙液プロテオームを発見したことを実証しました。特に、懸濁液トラップ法は、ペプチド回収率、タンパク質同定、およびサンプル調製時間の短縮の点で、溶液中のサンプル前処理よりも優れていました。