Preparação de amostra de suspensão de proteínas para proteômica lacrimal por cromatografia líquida-espectrometria de massas em tandem

O fluido lacrimal é um dos biofluidos de fácil acesso que pode ser coletado de forma não invasiva. A proteômica lacrimal tem o potencial de descobrir biomarcadores para diversas doenças e condições oculares. A coluna de aprisionamento de suspensão tem sido relatada como um fluxo de trabalho de preparação de amostras eficiente e fácil de usar para a ampla aplicação da análise proteômica a jusante. No entanto, essa estratégia ainda não foi bem estudada na análise do proteoma lacrimal humano. O presente protocolo descreve um fluxo de trabalho integrado de amostras lacrimais humanas clínicas a peptídeos purificados para pesquisa não invasiva de biomarcadores de proteína lacrimal usando espectrometria de massa, que fornece informações sobre biomarcadores e monitoramento de doenças quando combinado com análise de bioinformática. Uma preparação de amostra de aprisionamento de suspensão de proteínas foi aplicada e demonstrou a descoberta do proteoma lacrimal com procedimentos rápidos, reprodutíveis e fáceis de usar, como uma preparação universal e otimizada de amostras para análise de fluido lacrimal humano. Em particular, o procedimento de aprisionamento em suspensão superou a preparação de amostras em solução em termos de recuperação de peptídeos, identificação de proteínas e menor tempo de preparação da amostra.