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Biochemistry

タンパク質結晶構造解析のためのクリスタルヒットを得るためのハイスループットスクリーニング(英語)

Published: March 10th, 2023

DOI:

10.3791/65211

1National High-Throughput Crystallization Center, Hauptman-Woodward Medical Research Institute, 2Department of Biochemistry, Jacobs School of Medicine and Biomedical Sciences, The State University of New York

Abstract

X線結晶構造解析は、高分子構造を識別するために最も一般的に使用される技術ですが、タンパク質を回折に適した規則格子に結晶化するという重要なステップは依然として困難です。生体分子の結晶化は大部分が実験的に定義されており、このプロセスは労働集約的であり、資源の限られた機関の研究者にとっては法外なものになる可能性があります。国立ハイスループット結晶化(HTX)センターでは、幅広い結晶化パラメータをサンプリングするように設計された自動化されたハイスループット1,536ウェルマイクロバッチアンダーオイルプレートセットアップなど、結晶成長を促進するための再現性の高い方法が実装されています。プレートは、最先端のイメージングモダリティを使用して6週間にわたって監視され、結晶成長に関する洞察を提供し、貴重な結晶ヒットを正確に区別します。さらに、結晶ヒットを識別するためのトレーニングされた人工知能スコアリングアルゴリズムの実装と、実験画像を表示するためのオープンソースのユーザーフレンドリーなインターフェイスを組み合わせることで、結晶成長画像の分析プロセスを合理化します。ここでは、カクテルと結晶化プレートの調製、プレートのイメージング、再現性を確保し、結晶化の成功の可能性を高める方法でのヒットの識別のための主要な手順と機器について説明します。

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