Få et A med 3C'erne: Kromosom Conformation Capture for studerende

Kromosom konformation capture (3C) er et kraftfuldt værktøj, der har skabt en familie af lignende teknikker (fx Hi-C, 4C og 5C, her benævnt 3C teknikker), der giver detaljerede oplysninger om den tredimensionelle organisation af kromatin. 3C-teknikkerne er blevet brugt i en lang række undersøgelser, fra overvågning af ændringer i kromatinorganisation i kræftceller til identifikation af forstærkerkontakter foretaget med genpromotorer. Mens mange af de undersøgelser, der bruger disse teknikker, stiller store genom-dækkende spørgsmål med indviklede prøvetyper (dvs. enkeltcelleanalyse), er det, der ofte går tabt, at 3C-teknikkerne er baseret på grundlæggende molekylærbiologiske metoder, der kan anvendes til en bred vifte af undersøgelser. Ved at behandle tæt fokuserede spørgsmål om kromatinorganisation kan denne banebrydende teknik bruges til at forbedre bachelorforsknings- og undervisningslaboratorieoplevelsen. Dette papir præsenterer en 3C-protokol og giver tilpasninger og fokuspunkter til implementering på primært bachelorinstitutioner i bachelorforskning og undervisningserfaringer.