Få en A med 3Cs: Kromosomkonformasjonsfangst for studenter

Kromosomkonformasjonsfangst (3C) er et kraftig verktøy som har skapt en familie av lignende teknikker (f.eks. Hi-C, 4C og 5C, referert til her som 3C-teknikker) som gir detaljert informasjon om den tredimensjonale organisasjonen av kromatin. 3C-teknikkene har blitt brukt i et bredt spekter av studier, fra overvåking av endringene i kromatinorganisasjonen i kreftceller til å identifisere forsterkerkontakter laget med genpromotorer. Mens mange av studiene som bruker disse teknikkene, stiller store genombrede spørsmål med intrikate prøvetyper (dvs. enkeltcelleanalyse), går det ofte tapt at 3C-teknikkene er forankret i grunnleggende molekylærbiologiske metoder som gjelder for et bredt spekter av studier. Ved å ta opp tett fokuserte spørsmål om kromatinorganisasjon, kan denne banebrytende teknikken brukes til å forbedre grunnforsknings- og undervisningslaboratorieopplevelsen. Dette papiret presenterer en 3C-protokoll og gir tilpasninger og vektpunkter for implementering ved primært lavere institusjoner i grunnforskning og undervisningserfaringer.