Получение пятерки с 3C: захват хромосомной конформации для студентов

Захват конформации хромосом (3C) является мощным инструментом, который породил семейство подобных методов (например, Hi-C, 4C и 5C, называемых здесь методами 3C), которые предоставляют подробную информацию о трехмерной организации хроматина. Методы 3C использовались в широком спектре исследований, от мониторинга изменений в организации хроматина в раковых клетках до выявления контактов энхансеров с промоторами генов. В то время как многие исследования, использующие эти методы, задают большие вопросы по всему геному со сложными типами образцов (например, анализ отдельных клеток), что часто упускается из виду, так это то, что методы 3C основаны на основных методах молекулярной биологии, которые применимы к широкому кругу исследований. Решая узконаправленные вопросы организации хроматина, этот передовой метод может быть использован для улучшения исследовательской и преподавательской лабораторной работы студентов. В этом документе представлен протокол 3C и представлены адаптации и акценты для реализации в первую очередь в учебных заведениях бакалавриата в области исследований и преподавания в бакалавриате.