Obtener una A con las 3C: Captura de conformación cromosómica para estudiantes universitarios

La captura de conformación cromosómica (3C) es una herramienta poderosa que ha generado una familia de técnicas similares (por ejemplo, Hi-C, 4C y 5C, denominadas aquí técnicas 3C) que proporcionan información detallada de la organización tridimensional de la cromatina. Las técnicas 3C se han utilizado en una amplia gama de estudios, desde el monitoreo de los cambios en la organización de la cromatina en las células cancerosas hasta la identificación de contactos potenciadores realizados con promotores de genes. Si bien muchos de los estudios que utilizan estas técnicas están haciendo grandes preguntas sobre todo el genoma con tipos de muestras intrincadas (es decir, análisis de células individuales), lo que a menudo se pierde es que las técnicas 3C se basan en métodos básicos de biología molecular que son aplicables a una amplia gama de estudios. Al abordar preguntas estrechamente enfocadas de la organización de la cromatina, esta técnica de vanguardia se puede utilizar para mejorar la investigación de pregrado y la experiencia de laboratorio de enseñanza. Este documento presenta un protocolo 3C y proporciona adaptaciones y puntos de énfasis para la implementación en instituciones principalmente de pregrado en investigación de pregrado y experiencias docentes.