Få ett A med 3Cs: Kromosomkonformationsfångst för studenter

Kromosomkonformationsfångst (3C) är ett kraftfullt verktyg som har gett upphov till en familj av liknande tekniker (t.ex. Hi-C, 4C och 5C, här kallade 3C-tekniker) som ger detaljerad information om den tredimensionella organisationen av kromatin. 3C-teknikerna har använts i ett brett spektrum av studier, från att övervaka förändringarna i kromatinorganisationen i cancerceller till att identifiera förstärkare som gjorts med genpromotorer. Medan många av studierna som använder dessa tekniker ställer stora genomomfattande frågor med invecklade provtyper (dvs. encellsanalys), är det ofta förlorat att 3C-teknikerna är grundade i grundläggande molekylärbiologiska metoder som är tillämpliga på ett brett spektrum av studier. Genom att ta itu med tätt fokuserade frågor om kromatinorganisation kan denna banbrytande teknik användas för att förbättra grundforskningen och undervisningslaboratorieupplevelsen. Detta dokument presenterar ett 3C-protokoll och ger anpassningar och tyngdpunkter för implementering vid främst grundutbildningsinstitutioner i grundforskning och undervisningserfarenheter.