多重免疫荧光结合空间图像分析，用于肿瘤微环境的临床和生物学评估

肿瘤微环境（TME）由大量不同的细胞类型组成，例如细胞毒性免疫细胞和免疫调节细胞。根据其组成以及癌细胞与肿瘤周围细胞之间的相互作用，TME可能会影响癌症进展。肿瘤及其复杂微环境的表征可以提高对癌症疾病的理解，并可能有助于科学家和临床医生发现新的生物标志物。

我们最近开发了几种基于酪胺信号放大（TSA）的多重免疫荧光（mIF）组合，用于表征结直肠癌、头颈部鳞状细胞癌、黑色素瘤和肺癌中的TME。完成相应面板的染色和扫描后，在图像分析软件上分析样品。然后将每个细胞的空间位置和染色从该定量软件导出到R中。我们开发了R脚本，不仅可以分析几种肿瘤区室（例如肿瘤中心，肿瘤边缘和基质）中每种细胞类型的密度，还可以在不同细胞类型之间进行基于距离的分析。

此特定工作流为已针对多个标记例行执行的经典密度分析增加了空间维度。mIF分析可以使科学家更好地了解癌细胞与TME之间的复杂相互作用，并发现对治疗反应的新预测生物标志物，例如免疫检查点抑制剂和靶向治疗。