腫瘍微小環境の臨床的および生物学的評価のための空間画像解析と組み合わせたマルチプレックス免疫蛍光法

腫瘍微小環境(TME)は、細胞傷害性免疫細胞や免疫調節細胞など、さまざまな種類の細胞で構成されています。TMEは、その組成および癌細胞と腫瘍周囲細胞との間の相互作用に応じて、癌の進行に影響を与える可能性があります。腫瘍とその複雑な微小環境の特性評価は、がん疾患の理解を深める可能性があり、科学者や臨床医が新しいバイオマーカーを発見するのに役立つ可能性があります。

私たちは最近、結腸直腸癌、頭頸部扁平上皮癌、黒色腫、および肺癌におけるTMEの特性評価のために、チラミドシグナル増幅(TSA)に基づくいくつかのマルチプレックス免疫蛍光(mIF)パネルを開発しました。対応するパネルの染色とスキャンが完了すると、サンプルは画像分析ソフトウェアで分析されます。次に、各細胞の空間位置と染色が、この定量ソフトウェアからRにエクスポートされます。私たちは、いくつかの腫瘍コンパートメント(腫瘍の中心、腫瘍の縁、間質など)の各細胞タイプの密度を分析するだけでなく、異なる細胞タイプ間の距離ベースの分析も実行できるRスクリプトを開発しました。

この特定のワークフローは、いくつかのマーカーに対してすでに日常的に実行されている古典的な密度解析に空間次元を追加します。mIF解析により、科学者はがん細胞とTMEの複雑な相互作用をよりよく理解し、免疫チェックポイント阻害剤や標的療法などの治療に対する反応の新しい予測バイオマーカーを発見することができます。