Imunofluorescência Multiplex Combinada com Análise Espacial de Imagens para Avaliação Clínica e Biológica do Microambiente Tumoral

O microambiente tumoral (TME) é composto por uma infinidade de diferentes tipos celulares, como células imunes citotóxicas e células imunomoduladoras. Dependendo de sua composição e das interações entre células cancerosas e células peritumorais, a TME pode afetar a progressão do câncer. A caracterização de tumores e seu microambiente complexo pode melhorar a compreensão das doenças oncológicas e pode ajudar cientistas e clínicos a descobrir novos biomarcadores.

Recentemente, desenvolvemos vários painéis de imunofluorescência multiplex (mIF) baseados em amplificação de sinal de tiramida (TSA) para a caracterização da ETM em câncer colorretal, carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço, melanoma e câncer de pulmão. Uma vez concluída a coloração e digitalização dos painéis correspondentes, as amostras são analisadas em um software de análise de imagens. A posição espacial e a coloração de cada célula são então exportadas deste software de quantificação para R. Desenvolvemos scripts R que nos permitem não apenas analisar a densidade de cada tipo celular em vários compartimentos tumorais (por exemplo, o centro do tumor, a margem do tumor e o estroma), mas também realizar análises baseadas na distância entre diferentes tipos celulares.

Esse fluxo de trabalho em particular adiciona uma dimensão espacial à análise clássica de densidade já realizada rotineiramente para vários marcadores. A análise do mIF pode permitir que os cientistas tenham uma melhor compreensão da interação complexa entre as células cancerosas e a TME e descubram novos biomarcadores preditivos de resposta a tratamentos, como inibidores de checkpoints imunológicos e terapias-alvo.