Multipleks İmmünofloresan, Tümör Mikroçevresinin Klinik ve Biyolojik Değerlendirmesi için Uzamsal Görüntü Analizi ile Kombine Edildi

Tümör mikroçevresi (TME), sitotoksik bağışıklık hücreleri ve immünomodülatör hücreler gibi farklı hücre tiplerinin bolluğundan oluşur. Bileşimine ve kanser hücreleri ile peri-tümöral hücreler arasındaki etkileşimlere bağlı olarak, TME kanser ilerlemesini etkileyebilir. Tümörlerin ve karmaşık mikro çevrelerinin karakterizasyonu, kanser hastalıklarının anlaşılmasını geliştirebilir ve bilim adamlarının ve klinisyenlerin yeni biyobelirteçler keşfetmelerine yardımcı olabilir.

Son zamanlarda, kolorektal kanser, baş boyun skuamöz hücreli karsinom, melanom ve akciğer kanserinde TME'nin karakterizasyonu için tiramid sinyal amplifikasyonuna (TSA) dayanan birkaç multipleks immünofloresan (mIF) paneli geliştirdik. İlgili panellerin boyanması ve taranması tamamlandıktan sonra, numuneler bir görüntü analiz yazılımı üzerinde analiz edilir. Her hücrenin uzamsal konumu ve boyanması daha sonra bu niceleme yazılımından R'ye aktarılır. Sadece birkaç tümör bölmesindeki (örneğin tümörün merkezi, tümörün marjı ve stroma) her hücre tipinin yoğunluğunu analiz etmemize değil, aynı zamanda farklı hücre tipleri arasında mesafeye dayalı analizler yapmamıza izin veren R komut dosyaları geliştirdik.

Bu özel iş akışı, birkaç işaretleyici için rutin olarak gerçekleştirilen klasik yoğunluk analizine uzamsal bir boyut ekler. mIF analizi, bilim adamlarının kanser hücreleri ve TME arasındaki karmaşık etkileşimi daha iyi anlamalarını ve bağışıklık kontrol noktası inhibitörleri ve hedefli tedaviler gibi tedavilere yanıtın yeni prediktif biyobelirteçlerini keşfetmelerini sağlayabilir.