종양 미세 환경의 임상 및 생물학적 평가를 위한 공간 이미지 분석과 결합된 Multiplex Immunofluorescence

종양 미세환경(TME)은 세포독성 면역 세포 및 면역 조절 세포와 같은 다양한 세포 유형으로 구성됩니다. TME의 구성과 암세포와 종양주위 세포 사이의 상호 작용에 따라 TME는 암 진행에 영향을 미칠 수 있습니다. 종양과 복잡한 미세 환경의 특성화는 암 질환에 대한 이해를 향상시킬 수 있으며 과학자와 임상의가 새로운 바이오마커를 발견하는 데 도움이 될 수 있습니다.

우리는 최근 결장직장암, 두경부 편평 세포 암종, 흑색종 및 폐암에서 TME의 특성화를 위해 티라마이드 신호 증폭(TSA)을 기반으로 하는 여러 다중 면역형광(mIF) 패널을 개발했습니다. 해당 패널의 염색 및 스캔이 완료되면 이미지 분석 소프트웨어에서 샘플을 분석합니다. 그런 다음 각 세포의 공간적 위치와 염색을 이 정량화 소프트웨어에서 R로 내보냅니다. 우리는 여러 종양 구획(예: 종양의 중심, 종양의 가장자리 및 간질)에서 각 세포 유형의 밀도를 분석할 수 있을 뿐만 아니라 서로 다른 세포 유형 간의 거리 기반 분석을 수행할 수 있는 R 스크립트를 개발했습니다.

이 특정 워크플로우는 여러 마커에 대해 이미 일상적으로 수행되는 고전적인 밀도 분석에 공간적 차원을 추가합니다. mIF 분석을 통해 과학자들은 암세포와 TME 간의 복잡한 상호 작용을 더 잘 이해하고 면역 체크포인트 억제제 및 표적 요법과 같은 치료에 대한 반응의 새로운 예측 바이오마커를 발견할 수 있습니다.