Effektiv snabb blodperfusion i Xenopus

Xenopus har varit kraftfulla modellorganismer för att förstå ryggradsdjurens utveckling och sjukdom i över 100 år. Här definieras ett snabbt blodperfusionsprotokoll i Xenopus, som syftar till en konsekvent och drastisk minskning av blod i alla vävnader. Perfusion utförs genom att sätta in en nål direkt i hjärtkammaren och pumpa hepariniserad fosfatbuffrad saltlösning (PBS) genom kärlsystemet. Proceduren kan slutföras på cirka 10 minuter per djur. Blodet domineras av några mycket rikliga proteiner och celltyper, vilket skapar många problem eftersom dessa proteiner maskerar de flesta andra molekyler och celltyper av intresse. Den reproducerbara karakteriseringen av vuxna Xenopus-vävnader med kvantitativ proteomik och encellstranskriptomik kommer att dra nytta av att tillämpa detta protokoll före organprovtagning. Protokollen för vävnadsprovtagning definieras i kompletterande papper. Dessa procedurer syftar till standardisering av praxis över Xenopus av olika kön, ålder och hälsotillstånd, särskilt X. laevis och X. tropicalis.