Optimering av prestandaparametrar för TAGGG-telomerlängdanalysen

Telomerer är repetitiva sekvenser som är närvarande vid kromosomala ändar; Deras förkortning är ett karakteristiskt drag hos humana somatiska celler. Förkortning uppstår på grund av ett problem med slutreplikation och frånvaron av telomerasenzymet, som är ansvarigt för att upprätthålla telomerlängden. Intressant nog förkortas telomerer också som svar på olika interna fysiologiska processer, som oxidativ stress och inflammation, som kan påverkas på grund av extracellulära medel som föroreningar, smittämnen, näringsämnen eller strålning. Således tjänar telomerlängden som en utmärkt biomarkör för åldrande och olika fysiologiska hälsoparametrar. TAGGG-telomerlängdanalyssatsen används för att kvantifiera genomsnittliga telomerlängder med hjälp av telomerbegränsningsfragmentet (TRF) och är mycket reproducerbar. Det är dock en dyr metod, och på grund av detta används den inte rutinmässigt för stora provnummer. Här beskriver vi ett detaljerat protokoll för en optimerad och kostnadseffektiv mätning av telomerlängd med hjälp av Southern blots eller TRF-analys och icke-radioaktiv kemiluminiscensbaserad detektion.