Burada, optik tabanlı bir platform kullanarak insan kaynaklı pluripotent kök hücre kaynaklı kardiyomiyositlerde kontraktilite ve kalsiyum ölçümleri yapmak için yerleşik bir yöntem açıklanmaktadır. Bu platform, araştırmacıların mutasyonların etkisini ve çeşitli uyaranlara verilen tepkiyi hızlı ve tekrarlanabilir bir şekilde incelemelerini sağlar.
İnsan kaynaklı pluripotent kök hücre kaynaklı kardiyomiyositler (hiPSC-CM'ler), kardiyomiyosit fonksiyonundaki mutasyon aracılı değişiklikleri incelemek ve stresörlerin ve ilaç müdahalelerinin etkilerini tanımlamak için güçlü bir araçtır. Bu çalışmada, bu optik tabanlı sistemin, hiPSC-CM'lerin fonksiyonel parametrelerini 2D olarak değerlendirmek için güçlü bir araç olduğu gösterilmiştir. Bu platformu kullanarak, farklı plaka düzenlerinde iyi korunmuş bir sıcaklık ortamında eşleştirilmiş ölçümler yapmak mümkündür. Üstelik bu sistem, araştırmacılara anlık veri analizi imkanı sağlıyor.
Bu makale, modifiye edilmemiş hiPSC-CM'lerin kontraktilitesini ölçmek için bir yöntemi açıklamaktadır. Büzülme kinetiği, 250 Hz örnekleme frekansında gevşeme sırasında alınan bir referans çerçevesine göre piksel korelasyon değişikliklerine dayalı olarak 37 °C'de ölçülür. Ek olarak, hücreye Fura-2 gibi kalsiyuma duyarlı bir florofor yüklenerek hücre içi kalsiyum geçişlerinin eşzamanlı ölçümleri elde edilebilir. Bir hiperswitch kullanılarak, kasılma ölçümlerinin alanına karşılık gelen 50 μm çapında bir aydınlatma noktasında oransal kalsiyum ölçümleri gerçekleştirilebilir.
Kalp yetmezliği dünya çapında önde gelen ölüm nedenidir. 2019'da kardiyovasküler hastalık dünya çapında 18,6 milyon ölüme neden oldu ve bu da son on yılda %17,1'lik bir artışı yansıtıyor1. Araştırmacıların kalp yetmezliğini önlemek ve tedavi etmek için ilaç hedeflerini belirleme çabalarına rağmen, hasta sonuçları hala kötüdür2. Hayvan modellerinin patofizyolojisindeki insanlara göre farklılık, kalp yetmezliği tedavisinin optimizasyonu için sınırlı başarının altında yatan faktörlerden biri olabilir3. Hastalığı modellemek ve yeni ilaç bileşiklerinin toksisitesini ve etkinliğini test etmek için ek insan benzeri modeller garanti edilir.
İnsan kaynaklı pluripotent kök hücre kaynaklı kardiyomiyositler (hiPSC-CM'ler), stresörler, iskemi, değişmiş metabolizma veya patojenik gen varyantları tarafından indüklenen hücresel patomekanizmaları ve ilaç müdahalelerinin etkinliğini ve toksisitesini tanımlamak için güçlü bir araçtır4. HiPSC-CM'lerin fonksiyonel özellikleri üzerindeki etkileri tanımlamak için, hücresel kasılmaların sistolik ve diyastolik özelliklerini tarafsız ve tekrarlanabilir bir şekilde ölçen yüksek hızlı bir sistem garanti edilir. Bu çalışmanın genel amacı, optik tabanlı bir sistemin, hiPSC-CM'lerin fonksiyonel parametrelerinin gerçek zamanlı analizlerini gerçekleştirmek için güçlü bir araç olduğunu göstermektir.
Şu anda, hiPSC-CM'lerin kontraktilitesini değerlendirmek için birden fazla platform vardır. Bununla birlikte, mevcut sistemler ya yavaş bir okuma sunar ya da gerekli sayıda hücre zor olabilir. Etiketsiz video ölçüm sistemleri5,6, çok fazla depolama alanı gerektiren ve video alımı sırasında doğrudan geri bildirimden yoksun olan videoların post-hoc analizine dayanır. Ek olarak, yeterli zamansal ve uzamsal çözünürlüğün elde edilmesi zordur ve yetersiz örneklemeye neden olabilir. Floresan raportörlerle kümelenmiş düzenli aralıklı kısa palindromik tekrarlar (CRISPR) / Cas9 ile düzenlenmiş hiPSC-CM'ler7 gibi kardiyomiyosit özelliklerini belirlemeye yönelik diğer yöntemler, hücrelerin gen stabilitesine müdahale edebilir ve özel laboratuvar uzmanlığı gerektirebilir.
Yukarıda belirtilen sınırlamaların üstesinden gelmek için, bu çalışmada benzersiz bir optik tabanlı ölçüm sistemi geliştirilmiş ve tanıtılmıştır. Bu platform, modifiye edilmemiş hiPSC-CM'leri plaka boyutunda herhangi bir sınırlama olmaksızın, gerekli herhangi bir plaka formatında yeniden kaplayarak kontraktilite ölçümlerini mümkün kılar. Ayrıca, gerçek zamanlı ölçümler, hiPSC-CM'lerin fonksiyonel parametrelerinin doğrudan gözlemlenmesine ve analizine olanak tanır ve böylece protokolleri anında ayarlamak ve optimize etmek için deneysel bir ayar sağlar. Ayrıca, her ölçümün konumu saklanır, bu da aynı numune üzerinde eşleştirilmiş ölçümleri mümkün kılar ve böylece deneylerin gücünü artırır.
Optik tabanlı sistemi göstermek için, bir kontrol hiPSC-CM hattında kontraktilite ölçümleri yapıldı. Bu kontrol hiPSC hattı, normal karyotip8'e sahip sağlıklı bir erkek donörün dermal fibroblastından üretildi. Büzülme kinetiği, 250 Hz örnekleme frekansında gevşeme sırasında alınan bir referans çerçevesine göre piksel korelasyon değişikliklerine dayalı olarak 37 °C'de ölçüldü. Kasılmanın kesin başlangıcı her zaman kesin olarak belirlenemediğinden, tepe yüksekliğinin %20'sine ulaşılan zaman noktası (%20'si) zirveye kadar geçen sürenin ölçümleri için başlangıç noktası olarak alınmıştır. Bunu yaparak, bir örneklem içinde bu parametre için daha az değişkenlik bulundu. Benzer şekilde, sinyalin taban çizgisine döndüğü kesin anı değerlendirmek zor olduğundan, zirveden taban çizgisine dönüşün %80'ine ulaşmak için geçen süre (taban çizgisine %80'e kadar geçen süre) gevşeme süresini tanımlamak için kullanılmıştır.
Genel kasılma ölçümleri, istirahat atım frekanslarını,% 20 pikten pik kasılmaya kadar geçen süreyi (TP. Con) ve pik kasılmadan taban çizgisinin% 80'ine kadar geçen süre (TB. Con80) (Şekil 1B). Bir stres etkeninin etkisini test etmek için, hücreler izoprenaline (ISO) ile inkübe edildi. Ek olarak, kasılma ölçümleri ile tesadüfen, hücrelere 250 Hz'lik bir örnekleme frekansında Fura-2-asetoksimetil ester (Fura-2) yüklenerek Ca2+ geçici akımları ölçüldü. Ca 2+ ölçüm verileri, Ca2+ geçici (TP.Ca) içinde %20 tepeden tepeye kadar geçen süre ve taban çizgisinin (TB.Ca 80) tepeden %80'ine kadar geçen süre olarak gösterilir (Şekil 1C). Her alan için ortalama kasılma ve kalsiyum kinetik parametreleri elde etmek için hızlı, otomatik bir veri analiz aracı kullanıldı.
1. Hücre kültürü ortamının ve reaktiflerinin hazırlanması
2. hiPSC-CM'lerin kültürlenmesi
3. Kasılma ölçümleri
4. Kalsiyum geçici ölçümleri
5. Veri analizi
Bu protokolü takiben, kontraktilite, Ca2+ geçici akımları ve hiPSC-CM'lerde bir bileşiğe yanıt ölçümleri yapıldı. Bu optik tabanlı ölçüm sistemi kullanılarak, hiPSC-CM'ler gerekli plakalar üzerine kolayca yeniden kaplanabilir ve kontraktilite ölçümleri gerçekleştirilebilir. Kasılma, 100 μm x 100 μm'lik bir ilgi bölgesinde (ROI) saniyede 250 karede, bir referans kareye göre piksel korelasyonu hesaplanarak ölçülür. Referans çerçevesi, diyastol sonunda sistem tarafından otomatik olarak algılanır. Kasılma ölçümleri ile eş zamanlı olarak, bir oransal kalsiyum geçişi kaydedilir.
Bu çalışmada, üç biyolojik kopya olarak üç farklı farklılaşma turu kullanılmıştır. Her bir farklılaşma partisi için, üç kuyu teknik kopya olarak ölçüldü. Bu çalışma 24 kuyulu plakalar kullanılarak gerçekleştirilmiş ve her kuyu içindeki 10 alan ölçülmüştür. Ölçümlerden sonra, verileri hemen analiz etmek için CytoSolver programı kullanıldı. Aşağıdaki parametreler rapor edildi: dinlenme atma frekansı, TP. Con ve TB. Kontrol hiPSC-CM'lerinCon 80'i (Şekil 2A-C). Bahsedilen her parametre için verilerin değişkenliğini görselleştirmek için, her bir kuyu içindeki ölçümler ve her bir farklılaşma turu için üç kuyunun ortalama değerleri üst parseller10 olarak sunulur. Her bir farklılaşma turu için ve üç tur arasındaki verilerin değişkenliğini daha iyi değerlendirmek için, her parametre için varyans katsayısı (Şekil 2D) hesaplanmıştır. Şekil 2D'de gösterildiği gibi, bir biyolojik kopyaya karşılık gelen teknik kopyaların değerleri, bu yöntemin sağlamlığını gösteren birbirine çok yakın bir aralıkta (yani düşük varyans katsayısı) yer almaktadır.
Bu uygulama, ilaç etkilerini test etmek için çok uygundur. Burada, seçici olmayan bir β-adrenerjik reseptör agonisti olan 500 nM ISO'nun kontrol hiPSC-CM'lerinin kontraktilitesi üzerindeki etkisi test edildi. Bu bileşiğin kalp atış hızını arttırdığı ve pozitif bir lusitropik etki gösterdiği bilinmektedir. Şekil 3A'da gösterildiği gibi, ISO tüm kuyucuklarda atma frekansını önemli ölçüde artırdı. ISO ayrıca, TP'deki bir düşüşte belirgin olan kinetiği de artırdı. Con ve TB. Con80 (Şekil 3B,C). Genel olarak, ISO ile inkübasyon üzerine, tüm kuyucuklarda dayak frekansı önemli ölçüde artmış, kasılma ve gevşeme süresinde bir azalma olmuştur, bu da bu bileşiğe beklenen yanıtın bu platform tarafından kaydedildiğini göstermiştir.
Kontraktilite ölçümlerine paralel olarak kalsiyum ölçümleri de yapıldı. Kasılma verileriyle aynı şekilde (Şekil 2), hiPSC-CM'lerin kalsiyum ölçüm verileri Şekil 4'te gösterilmektedir. TB.Ca80 , izole sıçan veya fare kardiyomiyositlerinden önemli ölçüde daha yavaştır, bu da kısmen türler ve kalp atış hızı farklılıkları11 ile ve ayrıca sarkoplazmik retikulum içindeki daha düşük kalsiyum dinamikleri ve birincil hücrelere kıyasla kalsiyum işleme proteinlerinin daha düşük ekspresyonu nedeniyle hiPSC-CM'lerde olgunlaşmamış kalsiyum kullanımıile açıklanmaktadır 12. Kasılma verilerine benzer şekilde, kalsiyum ölçümleri için varyans katsayısı hesaplanmıştır ve teknik ve biyolojik kopyalar içinde düşük değişkenlik göstermektedir (Şekil 4C).
Şekil 1: Verileri analiz etmek için deneyden sonra CytoSolver geçici analiz aracının hemen kullanımı. (A) Bir kuyu içinde ölçülen bir alanın kabul edilen geçici akımlarına (tümü mavi renkte) bir örnek. Panel A1, kasılma geçişlerini göstermektedir. Panel A2, kalsiyum geçişlerini temsil eder. (B) Bir tur diferansiyasyonun üç kuyusundaki ölçümlerden elde edilen ortalama kasılma geçicisi. Her bir tek veya ortalama geçici olaydan, farklı zaman noktalarından zirveye kadar olan veriler (TP. Con) ve taban çizgisine kadar geçen süre (TB. Con) geçici kasılma çıkarılabilir. Daralmanın kesin başlangıcı her zaman kesin olarak belirlenemediğinden, zirveye ulaşma süresinin ölçümleri için başlangıç noktası olarak %20'lik zirveye kadar geçen süre alınır. Benzer şekilde, sinyalin taban çizgisine döndüğü tam anı değerlendirmek zordur. Bu nedenle, gevşeme süresini tanımlamak için %80'e kadar geçen süre kullanılır. İşte, TP. Con (zirveye kadar geçen süre - zirveye ulaşma süresi% 20) ve TB. Con80 (taban çizgisine kadar geçen süre %80 - zirveye kadar geçen süre) kullanılır. (C) Bir tur farklılaşmanın üç kuyusundaki ölçümlerden elde edilen ortalama kalsiyum geçici verileri. Her bir tek veya ortalama kalsiyum geçişinden, kalsiyum geçişlerinin zirvesine (TP.Ca) ve başlangıç noktasına (TB.Ca) kadar geçen farklı zaman noktalarından veriler çıkarılabilir. Zirveye kadar geçen süre ölçümleri için başlangıç noktası %20'ye kadar olan süre ve taban çizgisine kadar geçen süre için bitiş noktası %80'e kadar olan zamandır. Bu çalışmada TP.Ca (zirveye kadar geçen süre - zirveye kadar geçen süre %20) ve TB.Ca 80 (başlangıç süresi %80 - zirveye kadar geçen süre) kullanılmıştır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 2: Üç farklı farklılaşma turunda gerçekleştirilen temel kasılma ölçümleri. Her farklılaşma turu için üç biyolojik kopya ve üç kuyu (yani, üç teknik kopya). Her bir farklılaşma turu için üç ana sembol, her bir kuyucuk içindeki ölçülen alanların (soluk renklerdeki arka plan sembolleri) ortalama değerini temsil eder. Veriler ortalama ± SEM olarak gösterilir. Dinlenme atma frekansı ile ilgili veriler Hertz cinsinden ve TP için temsil edilir. Con ve TB. Con80, veriler saniye cinsindendir. (A) Dinlenme vuruş frekansı. (B) Zirveye kadar geçen süre (TP. Con). (C) Başlangıç süresi% 80 (TB. Con80). (D) Her bir turda ve her üç farklılaşma turunda elde edilen veriler arasındaki değişimi değerlendirmek için, her bir kuyucuğun ortalama değerleri kullanılarak varyans katsayısı yüzdesi hesaplanmıştır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 3: Başlangıçta (-) ve üç diferansiyasyon turundan üç kuyucukta ISO (+) ile inkübasyondan sonra kontraktilite ölçümleri. (A) Dinlenme vuruş frekansı (-) ve 500 nM ISO (+) ile inkübasyondan sonra atma frekansı. (B) Zirveye kadar geçen süre (TP. Con) başlangıçta ve ISO ile inkübasyondan sonra ölçümler. (C) Başlangıç süresi% 80 (TB. Con80) başlangıçta ve ISO ile inkübasyondan sonra ölçümler. ISO'nun kontraktilite parametreleri üzerindeki etkisini değerlendirmek için, Bonferroni düzeltmeli iki yönlü bir Anova gerçekleştirildi. Veriler ortalama ± SEM olarak gösterilir. Dinlenme vuruş frekansı ile ilgili veriler Hertz cinsinden ve TP için temsil edilir. Con ve TB. Con80, veriler saniye cinsinden temsil edilir. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Şekil 4: Üç tur farklılaşmadan üç kuyucuk üzerinde gerçekleştirilen temel kalsiyum geçici ölçümleri. (A) Kalsiyum geçişlerinin %80'inin (TB.Ca80) zirveye ulaşma süresi (TP.Ca) ve (B) başlangıç süresi. Veriler ortalama ± SEM olarak gösterilir. TP.Ca veTB.Ca 80 veri saniye cinsinden temsil edilir. (C) Her bir turda ve her üç farklılaşma turunda elde edilen veriler arasındaki değişimi değerlendirmek için, her bir kuyucuğun ortalama değeri kullanılarak varyans katsayısı yüzdesi hesaplanmıştır. Bu rakamın daha büyük bir sürümünü görüntülemek için lütfen buraya tıklayın.
Bu çalışmada, hiPSC-CM'ler üzerinde kontraktilite ve kalsiyum geçici ölçümleri yapmak ve stresörlerin/ilaçların bu hücreler üzerindeki etkisini incelemek için bir yöntem tanımlanmıştır. Kontraktilite ölçümleri, oransal kalsiyum ölçümleri ve ISO'ya yanıt, biyolojik kopyalar olarak üç farklı farklılaşma turunda gerçekleştirildi. Her biyolojik kopya için, teknik kopyalar olarak üç kuyuda ölçümler yapıldı. Ölçümlerin bu şekilde yapılmasının nedeni, numunenin ve platformun biyolojik değişkenliğinin ve teknik değişkenliğinin değerlendirilebilmesini sağlamaktı. Uygun sayıda biyolojik ve teknik kopyayı göz önünde bulundurmanın yanı sıra, hiPSC-CM kültür koşulu, sürekli ve sağlam sonuçlar elde etmek için önemli bir rol oynayabilir. Ölçümler sırasında hiPSC-CM'lerin yaşı, ortamın bileşimi, yeniden kaplama koşulları ve bileşik inkübasyon süresi gibi kriterlerle tutarlı olmak önemlidir. Bu çalışmada, bir kuyuda 10 sn boyunca 11 alanı iki kez ölçmek ortalama 568 ± 24 sn sürmüştür. Bu, 79 ± 11 s'lik bir ISO inkübasyon süresini içerir. Bu, kuyu başına kabaca 10 dakikaya iner ve bu da araştırmacıların ~ 4 saatte tam bir 24 kuyulu plakayı ölçmelerini sağlamalıdır. İklim kontrolü, sabit CO2'yi korumak için kullanılır. Bu, bileşiklerin/stresörlerin hiPSC-CM'ler üzerindeki etkisinin yüksek hızlı bir şekilde ölçülmesine olanak tanır.
iPSC-CM'lerin kasılma fonksiyonunu ölçmek için, optogenetik13 veya etiketsiz video tabanlı mikroskopi 5,6'ya dayanan birkaç mevcut sistem vardır. Optogenetik sistemler oldukça karmaşıktır ve elektrofiziksel ve/veya kontraktilite verilerini elde etmek için özel teknikler gerektirir. Diğer sistemler, çok fazla depolama alanı gerektiren ve video alımı sırasında doğrudan geri bildirimden yoksun olan videoların post-hoc analizine dayanır. Ek olarak, yeterli zamansal ve uzamsal çözünürlüğün elde edilmesi zordur ve bu da yetersiz örneklemeye neden olabilir. Benzer şekilde, floresan raportörler7 ile CRISPR/CAS-9 ile düzenlenmiş hiPSC-CM'ler, kardiyomiyosit davranışı üzerinde istenmeyen etkilere neden olabilir. Büzülme-gevşeme ölçümleri için floresan boyaların kullanılması da zarif bir yaklaşımdır, ancak aynı numune üzerinde daha uzun bir süre boyunca deney yapılmasını sınırlar14.
Bununla birlikte, bu optik tabanlı ölçüm platformu, herhangi bir floresan boya veya invaziv yöntem kullanmadan kasılma-gevşeme sürelerini ölçmek için kullanılabilir. Bununla birlikte, piksel korelasyonu uzamsal bilgi sağlamadığından, bu yöntem kasılmanın gücünü ölçmek için kullanılamaz, bunun yerine yalnızca kasılma ve gevşeme hızındaki değişiklikleri güvenilir bir şekilde tespit edebilir. Tanıtılan ölçüm sistemi sıcaklık kontrollüdür ve saniyede >200 kare çözünürlükte gerçek zamanlı olarak kalsiyum ve kasılma verilerini alabilir. Ek olarak, her ölçümün konumu saklanır, bu da eşleştirilmiş ölçümleri mümkün kılar ve böylece deneylerin gücünü artırır. Ayrıca bu platform, araştırmacılara deneyden hemen sonra veri depolama ve analiz etme olanağı sağlar. Genel olarak, bu optik tabanlı ölçüm sistemi, hücresel patomekanizmaları incelemek için umut verici bir yöntem olduğunu, bileşiklerin hiPSC-CM'lerin işlevselliği üzerindeki etkisini değerlendirebildiğini ve ilaç taramasında klinik öncesi süreçte yardımcı olabileceğini göstermektedir.
Bu araştırma kısmen Eurostars hibesi Estars2 113937 CARDIOMYO (EM & DK) ve NWO-VICI hibe 91818602 (JV) tarafından finanse edilmiştir.
Name | Company | Catalog Number | Comments |
µ-Plate 24 Well Black ID 14 mm | ibidi | 82421 | |
B-27 Supplement (50x) | Thermo Fisher | 17504044 | |
CytoSolver transient analysis tool | CytoCypher | A fast automatic data analysis tool | |
DMEM/F-12 | Thermo Fisher | 11320033 | |
Fura-2, AM | Thermo Fisher | F1221 | |
Isoprenaline hydrochloride | Merck | 15627 | |
KnockOut™ Serum Replacement | Thermo Fisher | 10828010 | |
Matrigel | Merck | CLS3542C | Basement membrane |
MultiCell CytoCypher with Nikon 20x Super Fluor objective and 730 nm LED light source and Ionwizard software | CytoCypher | Optics-based measurement system | |
ROCK inhibitor Y-27632 | Tocris | 1254 | |
RPMI 1640 | Thermo Fisher | 11875119 | |
Tyrode | Self-made solution with final concentration of the following components: NaCl 134 mM, KCl 5 mM, Hepes 12 mM, MgSO4 1.2 mM, NaH2PO4 H2O 1.2 mM, Glucose 11 mM, Sodium Pyrovate 5 mM, 1 mM CaCl2 |
This article has been published
Video Coming Soon
ABOUT JoVE
Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved