アイソフォーム特異的レチノイン酸受容体による生きた神経細胞ミトコンドリアの恒常性調節の最適化された自動解析(英語)

ミトコンドリアネットワークが複雑なため、生細胞のセグメント化、追跡、解析が非常に困難です。MATLAB ツールを使用すると、タイムラプス ファイル内のミトコンドリアを解析できるため、画像処理のプロセスが大幅に簡素化され、高速化されます。それにもかかわらず、既存のツールは大量の出力を生成するため、個々の手作業による注意が必要であり、基本的な実験セットアップでは数千のファイルが出力され、それぞれが広範で時間のかかる処理を必要とします。

これらの問題に対処するために、MATLAB コードとライブ スクリプト形式の両方でルーチン最適化が開発され、迅速なファイル解析が可能になり、ドキュメントの読み取りとデータ処理が大幅に削減されました。100ファイル/分の速度で、最適化により全体的に迅速な分析が可能になります。最適化では、個々のミトコンドリアのフレーム固有のデータを時間枠全体で平均化し、既存のツールからの出力と一致する定義された方法でデータを分析することにより、結果出力を達成します。色素テトラメチルローダミンメチルエステルを使用してライブ共焦点イメージングを行い、神経細胞をレチノイン酸受容体(RAR)アゴニストで処理することにより、ルーチンの最適化を検証しました。結果は文献と一致しており、アイソフォーム特異的RAR調節に応答するミトコンドリアネットワークの挙動をさらに特徴付けることができました。

この新しい方法論により、ニューロン全体のミトコンドリアネットワークの迅速で検証済みの特性評価が可能になりましたが、神経科学分野に適用するために不可欠な機能である軸索と細胞体ミトコンドリアの分化も可能になりました。また、速効性治療を用いた実験にも適用でき、治療前後で同じ細胞のイメージングが可能で、神経科学の分野を超越しています。