सहसंबंध कैलक्यूलेटर और फिलीग्री: मेटाबोलॉमिक्स डेटा के डेटा-संचालित नेटवर्क विश्लेषण के लिए उपकरण

ओमिक्स डेटा के विश्लेषण में एक महत्वपूर्ण चुनौती कार्रवाई योग्य जैविक ज्ञान निकाल रही है। मेटाबोलॉमिक्स कोई अपवाद नहीं है। विशिष्ट जैविक प्रक्रियाओं के लिए व्यक्तिगत मेटाबोलाइट्स के स्तर में परिवर्तन से संबंधित सामान्य समस्या अलक्षित तरल क्रोमैटोग्राफी-मास स्पेक्ट्रोमेट्री (एलसी-एमएस) अध्ययनों में मौजूद अज्ञात मेटाबोलाइट्स की बड़ी संख्या से जटिल है। इसके अलावा, मौजूदा मार्ग डेटाबेस में माध्यमिक चयापचय और लिपिड चयापचय का खराब प्रतिनिधित्व किया जाता है। इन सीमाओं को दूर करने के लिए, हमारे समूह ने डेटा-संचालित नेटवर्क निर्माण और विश्लेषण के लिए कई उपकरण विकसित किए हैं। इनमें सहसंबंध कैलकुलेटर और फिलीग्री शामिल हैं। दोनों उपकरण उपयोगकर्ताओं को प्रयोगात्मक मेटाबोलॉमिक्स डेटा से आंशिक सहसंबंध-आधारित नेटवर्क बनाने की अनुमति देते हैं जब मेटाबोलाइट्स की संख्या नमूनों की संख्या से अधिक होती है। सहसंबंध कैलक्यूलेटर एक एकल नेटवर्क के निर्माण का समर्थन करता है, जबकि फिलीग्री नमूनों के दो समूहों से डेटा का उपयोग करके एक अंतर नेटवर्क बनाने की अनुमति देता है, इसके बाद नेटवर्क क्लस्टरिंग और संवर्धन विश्लेषण होता है। हम वास्तविक जीवन मेटाबोलॉमिक्स डेटा के विश्लेषण के लिए दोनों उपकरणों की उपयोगिता और अनुप्रयोग का वर्णन करेंगे।