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Biology

一种简单、快速、部分自动化的方案,用于从冷冻哺乳动物组织中分离单细胞核,用于单细胞核测序

Published: July 28th, 2023

DOI:

10.3791/65611

1Roche Pharma Research and Early Development, Pharmaceutical Sciences, Roche Innovation Centre Basel

Abstract

单细胞和单核RNA测序由于提供了丰富的转录组学信息,已成为常见的实验室应用。特别是单核RNA测序,可用于研究难以解离组织中的基因表达。此外,这种方法还与冷冻(存档)材料兼容。在这里,我们描述了一种从冷冻哺乳动物组织中分离高质量单核的方案,用于使用市售仪器和试剂以部分自动化方式进行下游单核RNA测序。具体来说,机器人解离器用于自动化和标准化组织均质化,然后优化化学梯度过滤细胞核。最后,我们使用自动荧光细胞计数仪准确、自动地对细胞核进行计数。该方案的性能在小鼠脑,大鼠肾脏和食蟹猴肝脏和脾脏组织上得到证明。该方案简单、快速且易于适应各种哺乳动物组织,无需大量优化,并为下游单核 RNA 测序提供高质量的细胞核。

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