Oppdage SARS-CoV-2-virus ved omvendt transkripsjonssløyfemediert isotermisk amplifikasjon

Det alvorlige akutte respiratoriske syndromet coronavirus 2 (SARS-CoV-2)-viruset har dramatisk påvirket menneskers helse. Det fortsetter å være en trussel mot det moderne samfunnet fordi mange mennesker dør som følge av infeksjon. Sykdommen diagnostiseres ved hjelp av serologiske og molekylære tester, for eksempel gullstandarden sanntids polymerasekjedereaksjon (RT-PCR). Den siste har flere ulemper fordi den krever spesialisert infrastruktur, kostbart utstyr og opplært personell. Her presenterer vi en protokoll som skisserer trinnene som kreves for å oppdage SARS-CoV-2-viruset ved bruk av omvendt transkripsjonssløyfemediert isotermisk amplifikasjon (RT-LAMP) i humane prøver. Protokollen inkluderer instruksjoner for design av primere i silico, klargjøring av reagenser, amplifikasjon og visualisering. Når den er standardisert, kan denne metoden enkelt implementeres og tilpasses ethvert laboratorium eller behandlingssted innen 60 minutter til en lav pris og ved hjelp av billig utstyr. Den kan tilpasses til å oppdage forskjellige patogener. Dermed kan den potensielt brukes i felten og i helsesentre for å utføre rettidig epidemiologisk overvåking.