Detektion av SARS-CoV-2-virus genom omvänd transkription-loopmedierad isotermisk amplifiering

Viruset SARS-CoV-2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) har dramatiskt påverkat människors hälsa. Det fortsätter att vara ett hot mot det moderna samhället eftersom många människor dör till följd av infektion. Sjukdomen diagnostiseras med hjälp av serologiska och molekylära tester, såsom guldstandarden för polymeraskedjereaktion i realtid (RT-PCR). Det sista har flera nackdelar eftersom det kräver specialiserad infrastruktur, dyr utrustning och utbildad personal. Här presenterar vi ett protokoll som beskriver de steg som krävs för att detektera SARS-CoV-2-viruset med hjälp av omvänd transkription-loopmedierad isotermisk amplifiering (RT-LAMP) i mänskliga prover. Protokollet innehåller instruktioner för att designa primers in silico, förbereda reagenser, amplifiering och visualisering. När den väl är standardiserad kan denna metod enkelt implementeras och anpassas till alla laboratorier eller vårdplatser inom 60 minuter till en låg kostnad och med hjälp av billig utrustning. Den är anpassningsbar för att upptäcka olika patogener. Således kan den potentiellt användas på fältet och på vårdcentraler för att utföra epidemiologisk övervakning i tid.