Diagnostic rapide quantitatif par réaction en chaîne par polymérase (qPCR) de l’infection à Helicobacter pylori et de la résistance aux antibiotiques

Helicobacter pylori est un agent pathogène humain majeur qui infecte environ la moitié de la population mondiale et devient une menace sérieuse pour la santé en raison de sa résistance croissante aux antibiotiques. C’est l’agent causal de la gastrite chronique active, de l’ulcère gastroduodénal et du cancer gastrique et a été classé comme cancérogène du groupe I par le Centre international de recherche sur le cancer. Par conséquent, le diagnostic rapide et précis de H. pylori et la détermination de sa résistance aux antibiotiques sont importants pour l’éradication efficace de ce pathogène bactérien. Actuellement, les méthodes de diagnostic de H. pylori comprennent principalement le test respiratoire à l’urée (UBT), le test antigénique, le test d’anticorps sériques, la gastroscopie, le test rapide d’uréase (RUT) et la culture bactérienne. Parmi elles, les trois premières méthodes de détection sont non invasives, ce qui signifie qu’elles sont faciles à effectuer. Cependant, les bactéries ne peuvent pas être récupérées par ces techniques; Par conséquent, les tests de résistance aux médicaments ne peuvent pas être effectués. Les trois derniers sont des examens invasifs, mais ils sont coûteux, nécessitent des compétences élevées et ont le potentiel de causer des dommages aux patients. Par conséquent, une méthode non invasive, rapide et simultanée pour la détection de H. pylori et les tests de résistance aux médicaments est très importante pour éradiquer efficacement H. pylori dans la pratique clinique. Ce protocole vise à présenter une procédure spécifique impliquant le test de corde en combinaison avec la réaction en chaîne de la polymérase quantitative (qPCR) pour la détection rapide de l’infection à H. pylori et de la résistance aux antibiotiques. Contrairement aux cultures bactériennes, cette méthode permet un diagnostic facile, rapide et non invasif de l’état d’infection à H. pylori et de la résistance aux médicaments. Plus précisément, nous avons utilisé la qPCR pour détecter rea pour l’infection à H. pylori et les mutations dans les gènes de l’ARNr 23S et du gyrA, qui codent respectivement pour la résistance à la clarithromycine et à la lévofloxacine. Comparé aux techniques de culture couramment utilisées, ce protocole fournit une technique non invasive, peu coûteuse et rapide pour détecter l’infection à H. pylori et déterminer sa résistance aux antibiotiques à l’aide de la qPCR.