ファージとロボット工学によるほぼ連続的な進化の実践ガイド

ロボティクスアクセラレーテッドエボリューション技術は、フィードバック制御を使用して進化の信頼性と速度を向上させ、タンパク質と生物の進化実験の結果を改善します。本稿では、ファージおよびロボティクス支援による近連続進化(PRANCE)の実装に必要なハードウェアとソフトウェアのセットアップガイドを紹介します。PRANCEは、ファージベースの高速分子進化と、何百もの独立したフィードバック制御進化実験を同時に実行する能力を兼ね備えています。このホワイトペーパーでは、リキッドハンドリング機器、プレートリーダー、補助ポンプ、ヒーター、3Dプリント容器など、PRANCEのハードウェア要件とセットアップについて説明します。Pythonベースのオープンソースソフトウェアと互換性を持つようにリキッドハンドリングロボットを構成する方法について説明します。最後に、新たに構築したPRANCEシステムを用いて、その能力を発揮し、多重進化を行う準備が整ったことを検証する最初の2つの実験について提案する。このガイドは、ロボット工学によって加速された進化の実施に関連する重要な機器のセットアップをナビゲートするためのハンドブックとして役立つことを目的としています。