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In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • Representative Results
  • Discussion
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

Hier stellen wir ein Protokoll vor, das die Netzwerkpharmakologie und molekulare Docking-Techniken beschreibt, um den Wirkmechanismus von Jiawei Shengjiang San (JWSJS) bei der Behandlung der diabetischen Nephropathie zu untersuchen.

Abstract

Unser Ziel war es, die Mechanismen zu untersuchen, die der Aktion von Jiawei Shengjiang San (JWSJS) bei der Behandlung der diabetischen Nephropathie und dem Einsatz von Netzwerkpharmakologie zugrunde liegen. Mit Hilfe von Netzwerkpharmakologie und molekularen Docking-Techniken haben wir die Wirkstoffe und Ziele von JWSJS vorhergesagt und ein akribisches "Wirkstoff-Komponenten-Ziel"-Netzwerk konstruiert. Die Anreicherungsanalysen der Genontologie (GO) und der Kyoto-Enzyklopädie der Gene und Genome (KEGG) wurden verwendet, um die therapeutischen Wege und Ziele von JWSJS zu ermitteln. Autodock Vina 1.2.0 wurde für die Verifizierung des molekularen Dockings eingesetzt, und es wurde eine 100-ns-Molekulardynamiksimulation durchgeführt, um die Andockergebnisse zu bestätigen, gefolgt von einer In-vivo-Verifizierung an Tieren. Die Ergebnisse zeigten, dass JWSJS 227 sich überschneidende Ziele mit der diabetischen Nephropathie teilte und eine Protein-Protein-Interaktionsnetzwerk-Topologie konstruierte. Die KEGG-Anreicherungsanalyse zeigte, dass JWSJS die diabetische Nephropathie durch Modulation von Lipiden und Atherosklerose, dem PI3K-Akt-Signalweg, der Apoptose und dem HIF-1-Signalweg abschwächt, wobei die Mitogen-aktivierte Proteinkinase 1 (MAPK1), MAPK3, der epidermale Wachstumsfaktor-Rezeptor (EGFR) und die Serin/Threonin-Proteinkinase 1 (AKT1) als kollektive Ziele mehrerer Signalwege identifiziert wurden. Molecular docking behauptete, dass die Kernkomponenten von JWSJS (Quercetin, Palmitoleinsäure und Luteolin) die Konformation mit drei zentralen Zielen (MAPK1, MAPK3 und EGFR) durch Wasserstoffbrückenbindungen stabilisieren können. In-vivo-Untersuchungen zeigten eine bemerkenswerte Zunahme des Körpergewichts und eine Verringerung des glykierten Serumproteins (GSP), des Low-Density-Lipoprotein-Cholesterins (LDL-C), des Uridintriphosphats (UTP) und des Nüchternblutzuckerspiegels (FBG) aufgrund von JWSJS. Die Elektronenmikroskopie in Verbindung mit Hämatoxylin und Eosin (HE) und die Periodensäure-Schiff-Färbung (PAS) zeigten das Potenzial jeder Behandlungsgruppe bei der Linderung von Nierenschäden in unterschiedlichem Ausmaß, wobei sie unterschiedliche Rückgänge von p-EGFR, p-MAPK3/1 und BAX sowie Zuwächse der BCL-2-Expression im Nierengewebe der behandelten Ratten zeigten. Zusammenfassend deuten diese Erkenntnisse darauf hin, dass die schützende Wirksamkeit von JWSJS bei diabetischer Nephropathie mit der Unterdrückung der Aktivierung des EGFR/MAPK3/1-Signalwegs und der Linderung der Apoptose der Nierenzellen verbunden sein könnte.

Introduction

Diabetes mellitus (DM) ist eine chronische Krankheit, die mehrere Systeme betrifft und aufgrund einer kontinuierlichen Hyperglykämie verschiedene Komplikationen verursachen kann, wie z. B. diabetische Nephropathie (DN), Retinopathie und Neuropathie1. DN ist eine schwerwiegende Komplikation der DM und macht etwa 30 % bis 50 % der Nierenerkrankungen im Endstadium (ESRD) aus2. Ihre klinische Manifestation ist die Mikroalbuminurie, die zu einer ESRD fortschreiten kann, die durch ein erhöhtes glomeruläres Volumen, eine mesangiale Stromahyperplasie und eine verdickte glomeruläre Basalmembran

Protocol

Alle Tiere wurden in Übereinstimmung mit dem US National Research Council Guide for the Care and Use of Laboratory Animals, 8. Auflage, gehalten und verwendet und gemäß den ARRIVE-Richtlinien16,17 berichtet. Die Studie wurde in Übereinstimmung mit dem China National Research Council Guide for the Care and Use of Laboratory Animals durchgeführt und von der Tierethikkommission der Universität für Chinesische Mediz.......

Representative Results

Dem Protokoll folgend wurden schließlich 90 Wirkstoffe von JWSJS aus der Analyse nach Screening und Deduplizierung nach den festgelegten Standards von OB und DL gewonnen. Dazu gehörten 20 Arten von Hedysarum Multijugum Maxim, 23 Arten von Epimrdii Herba, 15 Arten von Smilacis Glabrae Rhixoma, 16 Arten von Radix Rhei et Rhizome, vier Arten von Curcumaelongae Rhizoma, 15 Arten von Cicadae Periostracum und sechs Arten von Bombyx Ba.......

Discussion

Unsere Studie verwendete eine Kombination aus Netzwerkpharmakologie, molekularem Docking und in vivo Tiermodellen. Ein entscheidender Schritt war die Etablierung des "drug-component-target"-Netzwerks, das entscheidend für die Identifizierung der potenziellen Mechanismen von JWSJS bei der Behandlung von DN war, wobei der Schwerpunkt auf seiner Interaktion mit dem EGFR/MAPK3/1-Signalweg lag.

Während dieser Studie haben wir mehrere Modifikationen vorge.......

Acknowledgements

Diese Studie wurde durch das allgemeine Projekt der Naturwissenschaftlichen Stiftung der Provinz Hebei, China (Nr. H2019423037) unterstützt.

....

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
2×SYBR Green qPCR Master Mix Servicebio, Wuhan, ChinaG3320-05
24-h urine protein quantification (UTP)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
3,3'-DiaminobenzidineShanghai Huzheng Biotech, China91-95-2
Automatic biochemical analysis instrumentHitachi, Japan7170A
Anhydrous EthanolBiosharp, Tianjin, ChinaN/A
BAX Primary antibodies Affinity, USAAF0120Rat
BCL-2 Primary antibodies Affinity, USAAF6139Rat
BX53 microscopeOlympus, JapanBX53
Chloroform SubstituteECOTOP, Guangzhou, ChinaES-8522
Desmond software New York, NY, USARelease 2019-1
Digital Constant Temperature Water BathChangzhou Jintan Liangyou Instrument, ChinaDK-8D
EGFR Primary antibodies Affinity, USAAF6043Rat
Embed-812 RESINShell Chemical, USA14900
Fasting blood glucose (FBG)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
FC-type full-wavelength enzyme label analyserMultiskan; Thermo, USAN/A
GAPDH  Primary antibodies Affinity, USAAF7021Rat
Glycated serum protein (GSP)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
Transmission electron microscopeHitachi, JapanH-7650
Haematoxylin/eosin (HE) staining solutionServicebio, USAG1003
Image-Pro PlusMEDIA CYBERNETICS, USAN/A
Real-Time PCR Amplification InstrumentApplied Biosystems, USAiQ5 
Irbesartan tabletsHangzhou Sanofi PharmaceuticalsN/A
IsopropanolBiosharp, Tianjin, ChinaN/A
 JWSJS granulesGuangdong Yifang PharmaceuticalN/A
Kodak Image Station 2000 MM imaging systemKodak, USAIS2000
Low-density cholesterol (LDL-C)Nanjing Jiancheng Institute of Biological EngineeringN/A
MAPK3/1Primary antibodies Affinity, USAAF0155Rat
Medical CentrifugeHunan Xiangyi Laboratory Instrument Development, China TGL-16K
Mini trans-blot transfer systemBio-Rad, USAN/A
Mini-PROTEAN electrophoresis systemBio-Rad, USAN/A
NanoVue Plus SpectrophotometerHealthcare Bio-Sciences AB, Sweden111765
p-EGFR Primary antibodies Affinity, USAAF3044Rat
Periodic acid-Schiff (PAS) staining solutionServicebio, USAG1008
p-MAPK3/1 Primary antibodies Affinity, USAAF1015Rat
Secondary antibodies Santa Cruz, USAsc-2357Rabbit
StreptozotocinSigma, USAS0130
SureScript First-Strand cDNA Synthesis KitGeneCopeia, USAQP056T
TriQuick ReagentSolarbio, Beijing, ChinaR1100
Ultra-Clean WorkbenchSuzhou Purification Equipment, ChinaSW-CJ-1F 

References

  1. Viigimaa, M., Sachinidis, A., Toumpourleka, M., Koutsampasopoulos, K., Alliksoo, S., Titma, T. Macrovascular complications of Type 2 diabetes mellitus. Curr Vasc Pharmacol. 18 (2), 110-116 (2020).
  2. Umanath, K., Lewis, J. B. Update on diabetic ne....

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