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ここでは、糖尿病性腎症の治療におけるJiawei Shengjiang San(JWSJS)の作用機序を探求するためのネットワーク薬理学と分子ドッキング技術を説明するプロトコルを紹介します。
私たちは、糖尿病性腎症の治療とネットワーク薬理学の展開におけるJiawei Shengjiang San(JWSJS)の作用を支えるメカニズムを掘り下げることを目指しました。ネットワーク薬理学と分子ドッキング技術を用いて、JWSJSの活性成分と標的を予測し、緻密な「薬物-成分-標的」ネットワークを構築しました。Gene Ontology(GO)とKyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)のエンリッチメント解析を利用して、JWSJSの治療経路と標的を特定しました。分子ドッキング検証のためにAutodock Vina 1.2.0をデプロイし、ドッキング結果を確認するために100nsの分子動力学シミュレーションを実施し、続いて in vivo 動物検証を行いました。その結果、JWSJSは糖尿病性腎症と227の交差する標的を共有し、タンパク質間相互作用ネットワークトポロジーを構築していることが明らかになった。KEGGの濃縮解析では、JWSJSは、脂質とアテローム性動脈硬化症、PI3K-Aktシグナル伝達経路、アポトーシス、HIF-1シグナル伝達経路を調節することにより、糖尿病性腎症を緩和し、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ1(MAPK1)、MAPK3、上皮成長因子受容体(EGFR)、およびセリン/スレオニンプロテインキナーゼ1(AKT1)を複数の経路の集合的標的として同定したことが示されました。分子ドッキングは、JWSJSのコア成分(ケルセチン、パルミトレイン酸、ルテオリン)が水素結合を通じて3つの重要なターゲット(MAPK1、MAPK3、EGFR)とのコンフォメーションを安定させることができると主張しました。 In vivo 試験では、JWSJSによる体重の顕著な増加と、糖化血清タンパク質(GSP)、低密度リポタンパク質コレステロール(LDL-C)、ウリジン三リン酸(UTP)、空腹時血糖値(FBG)の低下が示されました。ヘマトキシリンとエオシン(HE)および過ヨウ素酸シッフ(PAS)染色と組み合わせた電子顕微鏡法は、p-EGFR、p-MAPK3/1、およびBAXのさまざまな減少を示し、治療されたラットの腎臓組織におけるBCL-2発現の増加を示す、さまざまな程度の腎臓障害を軽減する各治療群の可能性を強調しました。結論として、これらの洞察は、糖尿病性腎症に対するJWSJSの保護効果が、EGFR/MAPK3/1シグナル伝達経路の活性化の抑制と腎細胞アポトーシスの緩和に関連している可能性があることを示唆しています。
糖尿病(DM)は、糖尿病性腎症(DN)、網膜症、神経障害など、複数のシステムに影響を及ぼし、継続的な高血糖によるさまざまな合併症を引き起こす可能性のある慢性疾患です1。DNはDMの重篤な合併症であり、末期腎疾患(ESRD)の約30%〜50%を占めています2。その臨床症状は微量アルブミン尿症であり、糸球体容積の増加、中双眼間質過形成、および肥厚した糸球体基底膜を特徴とするESRDに進行する可能性があります3。DNの病因は複雑で、完全には解明されていません。血糖値を下げる、血圧を調節する、タンパク尿を減らすなどの臨床方法は、主にその進行を遅らせるために使用されますが、その効果は一般的です。
現在、DN4を治療する特定の薬剤は見つかっていません。しかし、何世紀にもわたって、漢方薬は糖尿病とその合併症の治療に広く使用されており5、 患者の臨床症状を改善し、疾患の進行を遅らせてきました。多成分、多標的、および多経路効果の利点により、漢方薬はDN6の治療のための革新的な薬物源になると期待されています。
すべての動物は、米国国立研究評議会実験動物の世話と使用に関するガイド、第8版に従って維持および使用され、ARRIVEガイドライン16,17で推奨されているように報告されました。この研究は、China National Research Council Guide for the Care and Use of Laboratory Animals(中国国家研究評議会実験動物の世話と使用に関するガイド)に?.......
プロトコールに従い、OBとDLの設定された基準に従ったスクリーニングと重複排除後の分析から、JWSJSの90の有効成分が最終的に得られました。これらには、20種類の Hedysarum Multijugum Maxim、23種類の Epimrdii Herba、15種類の Smilacis Glabrae Rhixoma、16種類の Radix Rhei et Rhizome、4種類の Curcumaelongae Rhizoma、15種類の Cicadae Periostracum、および6種.......
私たちの研究では、ネットワーク薬理学、分子ドッキング、および in vivo 動物モデルの組み合わせを採用しました。重要なステップは、「薬物-成分-標的」ネットワークの確立であり、これはDNの治療におけるJWSJSの潜在的なメカニズムを特定するために重要であり、特にEGFR/MAPK3/1シグナル伝達経路との相互作用に焦点を当てていました。
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本研究は、中国河北省自然科学基金会(第H2019423037号)の一般プロジェクトの支援を受けて行われました。
....Name | Company | Catalog Number | Comments |
2×SYBR Green qPCR Master Mix | Servicebio, Wuhan, China | G3320-05 | |
24-h urine protein quantification (UTP) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
3,3'-Diaminobenzidine | Shanghai Huzheng Biotech, China | 91-95-2 | |
Automatic biochemical analysis instrument | Hitachi, Japan | 7170A | |
Anhydrous Ethanol | Biosharp, Tianjin, China | N/A | |
BAX Primary antibodies | Affinity, USA | AF0120 | Rat |
BCL-2 Primary antibodies | Affinity, USA | AF6139 | Rat |
BX53 microscope | Olympus, Japan | BX53 | |
Chloroform Substitute | ECOTOP, Guangzhou, China | ES-8522 | |
Desmond software | New York, NY, USA | Release 2019-1 | |
Digital Constant Temperature Water Bath | Changzhou Jintan Liangyou Instrument, China | DK-8D | |
EGFR Primary antibodies | Affinity, USA | AF6043 | Rat |
Embed-812 RESIN | Shell Chemical, USA | 14900 | |
Fasting blood glucose (FBG) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
FC-type full-wavelength enzyme label analyser | Multiskan; Thermo, USA | N/A | |
GAPDH Primary antibodies | Affinity, USA | AF7021 | Rat |
Glycated serum protein (GSP) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
Transmission electron microscope | Hitachi, Japan | H-7650 | |
Haematoxylin/eosin (HE) staining solution | Servicebio, USA | G1003 | |
Image-Pro Plus | MEDIA CYBERNETICS, USA | N/A | |
Real-Time PCR Amplification Instrument | Applied Biosystems, USA | iQ5 | |
Irbesartan tablets | Hangzhou Sanofi Pharmaceuticals | N/A | |
Isopropanol | Biosharp, Tianjin, China | N/A | |
JWSJS granules | Guangdong Yifang Pharmaceutical | N/A | |
Kodak Image Station 2000 MM imaging system | Kodak, USA | IS2000 | |
Low-density cholesterol (LDL-C) | Nanjing Jiancheng Institute of Biological Engineering | N/A | |
MAPK3/1Primary antibodies | Affinity, USA | AF0155 | Rat |
Medical Centrifuge | Hunan Xiangyi Laboratory Instrument Development, China | TGL-16K | |
Mini trans-blot transfer system | Bio-Rad, USA | N/A | |
Mini-PROTEAN electrophoresis system | Bio-Rad, USA | N/A | |
NanoVue Plus Spectrophotometer | Healthcare Bio-Sciences AB, Sweden | 111765 | |
p-EGFR Primary antibodies | Affinity, USA | AF3044 | Rat |
Periodic acid-Schiff (PAS) staining solution | Servicebio, USA | G1008 | |
p-MAPK3/1 Primary antibodies | Affinity, USA | AF1015 | Rat |
Secondary antibodies | Santa Cruz, USA | sc-2357 | Rabbit |
Streptozotocin | Sigma, USA | S0130 | |
SureScript First-Strand cDNA Synthesis Kit | GeneCopeia, USA | QP056T | |
TriQuick Reagent | Solarbio, Beijing, China | R1100 | |
Ultra-Clean Workbench | Suzhou Purification Equipment, China | SW-CJ-1F |
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