היעילות ומנגנוני המסלול הבסיסיים של טיפול ShiDuGao לאקזמה בפי הטבעת בהתבסס על מערכי נתונים של GEO ופרמקולוגיה של רשת

Summary

מאמץ חקירה זה ביקש להבהיר את המנגנון של מתן תרופות אקטואלי באמצעות שילוב סינרגטי של פרמקולוגיה רשתית ומערכי נתונים של ביטוי גנים (GEO). מאמר זה העריך את ההיתכנות, המטרה והמנגנון של ShiDuGao (SDG) בטיפול באקזמה של פי הטבעת.

Abstract

אקזמה של פי הטבעת היא מחלת עור דלקתית כרונית וחוזרת המשפיעה על האזור סביב פי הטבעת. בעוד הנגעים מופיעים בעיקר בעור פי הטבעת והפריאנאלי, הם יכולים גם להתרחב לפרינאום או לאיברי המין. ShiDuGao (SDG) נמצא כבעל תכונות תיקון משמעותיות נגד גרד אנאלי, בקרת הפרשה, הפחתת לחות ותיקון העור. עם זאת, המטרות הגנטיות והמנגנונים הפרמקולוגיים של SDG על אקזמה אנאלית טרם הובהרו ונדונו באופן מקיף. כתוצאה מכך, מחקר זה השתמש בגישה פרמקולוגית רשתית והשתמש במערכי נתונים של ביטוי גנים אומניבוס (GEO) כדי לחקור מטרות גנים. בנוסף, הוקמה רשת אינטראקציה חלבון-חלבון (PPI), שהביאה לזיהוי של 149 מטרות, מתוכן 59 הוגדרו כגני רכזת, בתוך רשת האינטראקציה "תרופה-מטרה-מחלה".

תפקוד הגנים של SDG בטיפול באקזמה פריאנאלית הוערך באמצעות שימוש באנציקלופדיה קיוטו לגנים וגנומים (KEGG) וניתוח אונטולוגיה גנטית (GO). לאחר מכן, פונקציית האקזמה האנטי-פריאנאלית והמסלול הפוטנציאלי של SDG, כפי שזוהו בניתוח פרמקולוגי רשת, אומתו באמצעות מתודולוגיית עגינה מולקולרית. התהליכים הביולוגיים הקשורים לגנים וחלבונים ממוקדי SDG בטיפול באקזמה של פי הטבעת כוללים בעיקר תגובות בתיווך ציטוקינים, תגובות דלקתיות ותגובות לליפופוליסכרידים, בין היתר. תוצאות העשרת המסלול וניתוחי הביאור הפונקציונלי מצביעות על כך של-SDG תפקיד מכריע במניעה וניהול של אקזמה אנאלית על ידי ויסות מסלולי ההדבקה של נגיף שיגלוזיס והרפס סימפלקס 1. פרמקולוגיה של רשת וניתוח מסדי נתונים של GEO מאשרים את האופי הרב-תכליתי של SDG בטיפול באקזמה אנאלית, במיוחד על ידי אפנון TNF, MAPK14 ו- CASP3, שהם יעדי רכזת חיוניים במסלולי האיתות TNF ו- MAPK. ממצאים אלה מספקים כיוון ברור לחקירה נוספת של המנגנון הטיפולי של SDG לאקזמה אנאלית, תוך הדגשת הפוטנציאל שלו כגישה טיפולית יעילה למצב מתיש זה.

Introduction

אקזמה אנאלית היא מחלת עור אלרגית המשפיעה על האזור הפריאנאלי והרירית, המציגה ביטויים קליניים שונים¹. הסימפטומים האופייניים כוללים אריתמה אנאלית, papules, שלפוחיות, שחיקה, exudates, ו crusting. תסמינים אלה מתעוררים בעיקר עקב גירוד, עיבוי וחספוס של האזור הפגוע².

אקזמה אנאלית, המאופיינת במשך ממושך של המחלה, התקפים חוזרים ונשנים וטיפול מאתגר, עלולה להשפיע לרעה על בריאותם הגופנית והנפשית של החולים³. הפתוגנזה של אקזמה אנאלית עדיין אינה ברורה, והרפואה המודרנית מציעה כי היא עשויה להיות קשורה לנגעים אנאליים מקומיים, תזונה, סביבה, גנטיקה וגורמים אחרים⁴. בנו....

Protocol

מחקר זה אינו מתייחס לאישור אתי ולהסכמה להשתתף. הנתונים ששימשו במחקר זה התקבלו ממאגרי גנים.

1. חיזוי מטרות המחלה

1. גש למסד הנתונים GeneCards (https://www.genecards.org) ולמסד הנתונים המקוון של תורשה מנדליאנית באדם (OMIM, https://www.omim.org), תוך שימוש ב"אקזמה של פי הטבעת" כמונח החיפוש ליעדי ?.......

Discussion

אטופיק דרמטיטיס היא צורה ספציפית של אקזמה החולקת מנגנונים בסיסיים עם אקזמה. גנים מרכזיים שמאמינים כי הם קשורים למצב זה הם TNF, MAPK14 ו-CASP3. ההשפעות הטיפוליות של SDG על אקזמה אנאלית מיוחסות בעיקר לפעולתו על מסלולי האיתות TNF ו- MAPK באמצעות שלושת הגנים הללו¹⁷.

SDG כוללת חמש ת.......

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
AutoDockTools	AutoDock	https://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1	Cytoscape	https://cytoscape.org/
GeneCards database	GeneCards	https://www.genecards.org
GEO database	National Center for Biotechnology Information	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool	National Center for Biotechnology Information	https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
Metascape	Metascape	https://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man database	OMIM	https://www.omim.org
RCSB protein database	RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)	http://www.pdb.org/
STRING database	STRING	https://string-db.org/
Swiss ADME database	Swiss Institute of Bioinformatics	http://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)	Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform	http://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1	BioinfoGP	https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html