A eficácia e os mecanismos de via subjacentes do tratamento com ShiDuGao para eczema de ânus com base em conjuntos de dados GEO e farmacologia de rede

Summary

Este esforço investigativo buscou elucidar o mecanismo de administração tópica de fármacos utilizando uma integração sinérgica de farmacologia em rede e conjuntos de dados de expressão gênica omnibus (GEO). Este artigo avaliou a viabilidade, o alvo e o mecanismo do ShiDuGao (SDG) no tratamento do eczema do ânus.

Abstract

O eczema do ânus é uma doença inflamatória crônica e recorrente da pele que afeta a área ao redor do ânus. Embora as lesões ocorram principalmente na pele anal e perianal, elas também podem se estender para o períneo ou genitália. ShiDuGao (SDG) foi encontrado para possuir propriedades reparativas significativas contra prurido anal, controle de exsudação, redução de umidade, e reparação da pele. No entanto, os alvos genéticos e os mecanismos farmacológicos dos ODS no eczema anal ainda precisam ser amplamente elucidados e discutidos. Consequentemente, este estudo empregou uma abordagem farmacológica de rede e utilizou conjuntos de dados de expressão gênica omnibus (GEO) para investigar alvos gênicos. Adicionalmente, uma rede de interação proteína-proteína (IBP) foi estabelecida, resultando na identificação de 149 alvos, dos quais 59 foram considerados genes hub, dentro da rede de interação "droga-alvo-doença".

A função gênica dos ODS no tratamento do eczema perianal foi avaliada através da utilização da análise da Enciclopédia de Genes e Genomas de Kyoto (KEGG) e Ontologia Gênica (GO). Posteriormente, a função antieczema perianal e a potencial via dos ODS, identificadas na análise farmacológica da rede, foram validadas usando a metodologia de acoplamento molecular. Os processos biológicos associados a genes e proteínas alvo dos ODS no tratamento do eczema do ânus englobam principalmente respostas mediadas por citocinas, respostas inflamatórias e respostas ao lipopolissacarídeo, entre outras. Os resultados das análises de enriquecimento de vias e anotação funcional sugerem que o ODS desempenha um papel crucial na prevenção e manejo do eczema anal, regulando as vias de infecção pelo vírus Shigelose e herpes simplex 1. A farmacologia da rede e a análise do banco de dados GEO confirmam a natureza multi-alvo do SDG no tratamento do eczema anal, especificamente modulando TNF, MAPK14 e CASP3, que são alvos centrais cruciais nas vias de sinalização TNF e MAPK. Esses achados fornecem uma direção clara para uma investigação mais aprofundada sobre o mecanismo terapêutico dos ODS para eczema anal, destacando seu potencial como uma abordagem de tratamento eficaz para essa condição debilitante.

Introduction

O eczema anal é uma afecção alérgica da pele que acomete a região e mucosas perianais, apresentando diversas manifestações^clínicas1. Os sintomas característicos incluem eritema anal, pápulas, bolhas, erosão, exsudatos e crostas. Esses sintomas surgem principalmente devido a arranhões, espessamento e rugosidade da área afetada².

O eczema anal, caracterizado por duração prolongada da doença, crises recorrentes e tratamento desafiador, pode ter efeitos adversos na saúde física e mental dos pacientes³. A patogênese do eczema anal ainda não está clara, e a medicina moderna s....

Protocol

Este estudo não se refere à aprovação ética e consentimento para participar. Os dados utilizados neste estudo foram obtidos de bancos de dados genéticos.

1. Predição de alvos de doenças

1. Acesse o banco de dados GeneCards (https://www.genecards.org) e o banco de dados online de herança mendeliana no homem (OMIM, https://www.omim.org), utilizando "eczema do ânus" como termo de busca para alvos de doenças.
2. Faça o download das planilhas dos alvos da.......

Discussion

A dermatite atópica é uma forma específica de eczema que compartilha mecanismos subjacentes com o eczema. Acredita-se que os genes hub estejam relacionados a essa condição são TNF, MAPK14 e CASP3. Os efeitos terapêuticos dos ODS sobre o eczema anal são atribuídos principalmente à sua ação nas vias de sinalização do TNF e MAPK por meio desses três genes^hub17.

O ODS inclui cinco drogas distintas: índigo naturalis, cipreste dourado, gesso calcinado, calamin.......

Materials

Name	Company	Catalog Number	Comments
AutoDockTools	AutoDock	https://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1	Cytoscape	https://cytoscape.org/
GeneCards database	GeneCards	https://www.genecards.org
GEO database	National Center for Biotechnology Information	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool	National Center for Biotechnology Information	https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
Metascape	Metascape	https://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man database	OMIM	https://www.omim.org
RCSB protein database	RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)	http://www.pdb.org/
STRING database	STRING	https://string-db.org/
Swiss ADME database	Swiss Institute of Bioinformatics	http://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)	Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform	http://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1	BioinfoGP	https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html