Sign In

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

In This Article

  • Summary
  • Abstract
  • Introduction
  • Protocol
  • Representative Results
  • Discussion
  • Disclosures
  • Acknowledgements
  • Materials
  • References
  • Reprints and Permissions

Summary

Это исследование было направлено на выяснение механизма местного введения лекарств с использованием синергетической интеграции сетевых наборов данных по фармакологии и экспрессии генов (GEO). В этой статье оценивалась осуществимость, цель и механизм ShiDuGao (SDG) в лечении экземы ануса.

Abstract

Экзема заднего прохода – это хроническое и рецидивирующее воспалительное заболевание кожи, поражающее область вокруг ануса. В то время как поражения в основном возникают в анальной и перианальной коже, они также могут распространяться на промежность или гениталии. Было обнаружено, что ShiDuGao (SDG) обладает значительными репаративными свойствами против анального зуда, контроля экссудации, уменьшения влажности и восстановления кожи. Тем не менее, генетические мишени и фармакологические механизмы ЦУР при анальной экземе еще предстоит всесторонне выяснить и обсудить. Следовательно, в этом исследовании использовался сетевой фармакологический подход и использовались наборы данных экспрессии генов (GEO) для изучения генов-мишеней. Кроме того, была создана сеть белок-белковых взаимодействий (ИПП), в результате чего было идентифицировано 149 мишеней, из которых 59 считались генами-концентраторами, в сети взаимодействия «лекарство-мишень-заболевание».

Генная функция ЦУР в лечении перианальной экземы оценивалась с помощью Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG) и анализа генной онтологии (GO). Впоследствии функция антиперианальной экземы и потенциальный путь достижения ЦУР, выявленные в ходе сетевого фармакологического анализа, были валидированы с использованием методологии молекулярного докинга. Биологические процессы, связанные с генами и белками, нацеленными на достижение ЦУР, при лечении экземы заднего прохода в первую очередь охватывают, среди прочего, цитокин-опосредованные реакции, воспалительные реакции и ответы на липополисахариды. Результаты анализа обогащения путей и функциональной аннотации свидетельствуют о том, что ЦУР играет решающую роль в профилактике и лечении анальной экземы, регулируя пути инфицирования шигеллезом и вирусом простого герпеса 1. Анализ базы данных сетевой фармакологии и GEO подтверждает многоцелевой характер ЦУР в лечении анальной экземы, в частности, путем модуляции TNF, MAPK14 и CASP3, которые являются важнейшими мишенями-концентраторами в сигнальных путях TNF и MAPK. Эти результаты дают четкое направление для дальнейшего изучения терапевтического механизма ЦУР при анальной экземе, подчеркивая при этом его потенциал в качестве эффективного подхода к лечению этого изнурительного состояния.

Introduction

Анальная экзема — это аллергическое заболевание кожи, которое поражает перианальную область и слизистую оболочку и проявляется различными клиническими проявлениями1. Характерные симптомы включают эритему заднего прохода, папулы, волдыри, эрозию, экссудат и образование корочек. Эти симптомы в основном возникают из-за расчесывания, утолщения и шероховатости пораженного участка2.

Анальная экзема, характеризующаяся длительным течением заболевания, рецидивирующими приступами и сложным лечением, может оказывать неблагоприятное воздействие на физическое и психическое здоровье пациентов

Protocol

В этом исследовании не говорится об этическом одобрении и согласии на участие. Данные, использованные в данном исследовании, были получены из генетических баз данных.

1. Прогнозирование мишеней заболевания

  1. Получите доступ к базе данных GeneCards (https://www.genecards.org).......

Representative Results

Гены, связанные с анусовой экземой, гены-мишени ЦУР и общие мишени
В общей сложности 958 потенциальных кандидатов в гены были проверены в Genecards и 634 в базах данных OIM, в то время как дубликаты были исключены. Чтобы получить всестороннее представление о генах, связанных с анальной .......

Discussion

Атопический дерматит – это специфическая форма экземы, которая имеет общие механизмы с экземой. Считается, что гены-концентраторы связаны с этим состоянием: TNF, MAPK14 и CASP3. Терапевтическое воздействие ЦУР на анальную экзему в основном объясняется его действием на сигнальные пути TNF и MAPK ч.......

Disclosures

Авторам нечего раскрывать.

Acknowledgements

Никакой.

....

Materials

NameCompanyCatalog NumberComments
AutoDockToolsAutoDockhttps://autodocksuite.scripps.edu/adt/
Cytoscape 3.9.1 Cytoscapehttps://cytoscape.org/
GeneCards database GeneCardshttps://www.genecards.org
GEO databaseNational Center for Biotechnology Informationhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/
GEO2R tool National Center for Biotechnology Informationhttps://ncbi.nlm.nih.gov/geo/geo2r/
MetascapeMetascapehttps://metascape.org/
Online Mendelian inheritance in man databaseOMIMhttps://www.omim.org
RCSB protein database RCSB Protein Data Bank (RCSB PDB)http://www.pdb.org/
STRING database STRINGhttps://string-db.org/
Swiss ADME database Swiss Institute of Bioinformaticshttp://www.swissadme.ch/index.php
Traditional Chinese Medicine system's pharmacology database (TCMSP)Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platformhttp://tcmspw.com/tcmsp.php
Venny2.1BioinfoGPhttps://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

References

  1. Ma, M., Lu, H., Yang, Z., Chen, L., Li, Y., Zhang, X. Differences in microbiota between acute and chronic perianal eczema. Medicine. 100 (16), e25623 (2021).
  2. Dietrich, C. F., Hoch, F. Anal eczema. Revue Therapeutique. 78 (9), ....

Reprints and Permissions

Request permission to reuse the text or figures of this JoVE article

Request Permission

Explore More Articles

JoVE203ShiDuGaoTNFMAPKGEO

This article has been published

Video Coming Soon

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved