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Abstract

Neuroscience

グリアトランスクリプトームプロファイルに基づくアルツハイマー病の性別特異性のためのバイオマーカー同定

Published: May 20th, 2024

DOI:

10.3791/66552

1Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, 2Chengdu Shuangliu Hospital of Traditional Chinese Medicine, 3Department of Automation, Tsinghua University, 4Affiliated Reproductive & Women-Children Hospital, Chengdu University of Traditional Chinese Medicine, 5Department of Neurology, Dalian Municipal Central Hospital, Central Hospital of Dalian University of Technology

* These authors contributed equally

Abstract

最近、アルツハイマー病(AD)において多くの性特異的バイオマーカーが明らかになりました。しかし、脳グリア細胞はほとんど報告されていませんでした。この研究では、GEOデータベースに登録されているADの33人の前頭皮質から得られた220,095の単一核トランスクリプトームを分析しました。性特異的差次的発現遺伝子(DEG)は、アストロサイトに243個、ミクログリアに1,154個、オリゴデンドロサイトに572個を含むグリア細胞で同定されました。Gene Ontology(GO)の機能アノテーション解析と京都遺伝子・ゲノム大百科事典(KEGG)のパスウェイエンリッチメント解析により、シナプス、神経、ホルモン関連パスの機能的集中が明らかになりました。タンパク質間相互作用ネットワーク(PPI)は、アストロサイトにおけるMT3、CALM2、DLG2、KCND2、PAKACB、CAMK2D、およびNLGN4Y、ミクログリアにおけるTREM2、FOS、APOE、APP、およびNLGN4Y、およびオリゴデンドロサイトにおけるGRIN2A、ITPR2、GNAS、およびNLGN4Yを主要な遺伝子として同定しました。NLGN4Yは、3つのグリアが共有する唯一の遺伝子であり、ADの性別特異性のバイオマーカーとして同定されました。遺伝子転写因子(TF)-miRNA共調節ネットワークは、NLGN4Yとその標的TCMの主要な調節因子を特定しました。Ecklonia kurome Okam(Kunbu)とHerba Ephedrae(Mahuang)が同定され、ADに対する有効成分の影響が示されました。最後に、KunbuとMahuangの濃縮分析は、彼らがADの性別特異性の治療候補として作用する可能性があることを示唆しました。

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