Glial transcriptome profiles를 기반으로 한 Alzheimer's disease의 성별 특이성에 대한 바이오마커 식별

최근 알츠하이머병(Alzheimer's disease, AD)에서 많은 성별 특이적 바이오마커가 밝혀졌습니다. 그러나 대뇌신경교세포(cerebral glial cell)는 거의 보고되지 않았다. 이 연구는 GEO 데이터베이스에서 33 명의 AD 개인의 전두엽 피질에서 220,095 개의 단일 핵 전사체를 분석했습니다. 성교세포에서 성별 특이적 차등 발현 유전자(DG)가 확인되었으며, 성상교세포에서 243개, 미세아교세포에서 1,154개, 희소돌기아교세포에서 572개가 확인되었습니다. 유전자 온톨로지(GO) 기능 주석 분석과 KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) 경로 농축 분석은 시냅스, 신경 및 호르몬 관련 경로에서 기능적 농도를 밝혀냈습니다. 단백질-단백질 상호작용 네트워크(PPI)는 성상교세포에서 MT3, CALM2, DLG2, KCND2, PAKACB, CAMK2D 및 NLGN4Y, 미세아교세포에서 TREM2, FOS, APOE, APP 및 NLGN4Y, 희소돌기아교세포에서 GRIN2A, ITPR2, GNAS 및 NLGN4Y를 주요 유전자로 식별했습니다. NLGN4Y는 3개의 신경교세포가 공유하는 유일한 유전자로, 알츠하이머병의 성별 특이성에 대한 바이오마커로 확인되었습니다. 유전자-전사인자(Gene-transcription factor, TF)-miRNA 공동조절 네트워크는 NLGN4Y와 그 표적 TCM에 대한 주요 조절인자를 식별했습니다. Ecklonia kurome Okam(Kunbu)과 Herba Ephedrae(Mahuang)를 확인하고 활성 성분이 AD에 미치는 영향을 표시했습니다. 마지막으로, 쿤부(Kunbu)와 마황(Mahuang)에 대한 농축 분석(enrichment analysis)은 이들이 알츠하이머병의 성별 특이성에 대한 치료 후보로 작용할 수 있음을 시사했다.