Идентификация биомаркеров гендерной специфичности болезни Альцгеймера на основе профилей глиального транскриптома

При болезни Альцгеймера (БА) в последнее время было выявлено множество биомаркеров, специфичных для пола; Тем не менее, о глиальных клетках головного мозга сообщалось редко. В этом исследовании было проанализировано 220 095 одноядерных транскриптомов из лобной коры тридцати трех человек с болезнью Альцгеймера в базе данных GEO. Специфичные для пола дифференциально экспрессируемые гены (DEG) были идентифицированы в глиальных клетках, в том числе 243 в астроцитах, 1154 в микроглии и 572 в олигодендроцитах. Анализ функциональных аннотаций Gene Ontology (GO) и анализ обогащения путей Киотской энциклопедии генов и геномов (KEGG) выявили функциональную концентрацию в синаптических, нервных и гормональных путях. Сеть белок-белковых взаимодействий (PPI) идентифицировала MT3, CALM2, DLG2, KCND2, PAKACB, CAMK2D и NLGN4Y в астроцитах, TREM2, FOS, APOE, APP и NLGN4Y в микроглии, а также GRIN2A, ITPR2, GNAS и NLGN4Y в олигодендроцитах в качестве ключевых генов. NLGN4Y был единственным общим геном для трех глий и был идентифицирован как биомаркер гендерной специфичности AD. Корегуляторная сеть ген-фактор транскрипции (TF)-miRNA идентифицировала ключевые регуляторы NLGN4Y и его целевых ТКМ. Были идентифицированы Ecklonia kurome Okam (Kunbu) и Herba Ephedrae (Mahuang), а также было показано влияние активных ингредиентов на AD. Наконец, обогащенный анализ Кунбу и Махуанга показал, что они могут выступать в качестве терапевтических кандидатов на предмет гендерной специфичности болезни Альцгеймера.