Strategier til at forbedre dyrkning af anaerobe bakterier fra mave-tarmkanalen hos kylling

Kyllingens mave-tarmkanal (GIT) er et komplekst økosystem, der rummer billioner af mikrober, der spiller en central rolle i værtens fysiologi, fordøjelse, næringsstofabsorption, modning af immunsystemet og forebyggelse af patogenindtrængen. For optimal dyresundhed og produktivitet er det bydende nødvendigt at karakterisere disse mikroorganismer og forstå deres rolle. Mens GIT af fjerkræ rummer et reservoir af mikroorganismer med potentielle probiotiske anvendelser, forbliver det meste af mangfoldigheden uudforsket. For at forbedre vores forståelse af udyrket mikrobiel mangfoldighed er det nødvendigt med en samordnet indsats for at bringe disse mikroorganismer ind i kulturen. Isolering og dyrkning af GIT-koloniserende mikroorganismer giver reproducerbart materiale, herunder celler, DNA og metabolitter, hvilket giver ny indsigt i metaboliske processer i miljøet. Uden dyrkning forbliver disse organismers rolle i deres naturlige omgivelser uklar og begrænset til et beskrivende niveau. Vores mål er at implementere dyrkningsstrategier, der sigter mod at forbedre isoleringen af en bred vifte af anaerobe mikrober fra kyllingens GIT, ved at udnytte tværfaglig viden fra dyrefysiologi, dyreernæring, metagenomik, foderbiokemi og moderne dyrkningsstrategier. Derudover sigter vi mod at implementere brugen af korrekt praksis for prøveudtagning, transport og medieforberedelse, som er kendt for at påvirke isolationssucces. Passende metoder bør sikre et ensartet iltfrit miljø, optimale atmosfæriske forhold, passende værtsinkubationstemperatur og tilvejebringelse af specifikke ernæringsmæssige behov i overensstemmelse med deres særlige behov. Ved at følge disse metoder vil dyrkning ikke kun give reproducerbare resultater for isolering, men vil også lette isolationsprocedurer og dermed fremme en omfattende forståelse af det indviklede mikrobielle økosystem i kyllingens mave-tarm.