Tohumlar döllenmiş çiçeklerden gelişir. Spesifik olarak, tohumlar, çift gübreleme adı verilen bir işlemle çiçeğin yumurtalığında bulunan yumurtalardan gelişir. Bu işlem sırasında, bir sperm yumurtayı döller ve bir sperm iki polar çekirdeği döller, bu da bir sporofit embriyosuna ve bir endosperme (besin deposu) neden olur.

Sporofit embriyosu, bir haploid yumurtanın bir haploid sperm tarafından döllenmesiyle oluşturulan, her bir ebeveynden bir set olmak üzere çift bir kromozom setine sahiptir. Embriyo, saplar ve kökler için öncü dokudan ve kotiledon adı verilen bir veya daha fazla embriyonik yapraktan oluşur. Embriyo, bir endosperm, kotiledonlar veya her ikisi şeklinde bir gıda rezervi ile çevrilidir ve bir tohum oluşturmak için koruyucu bir tohum tabakası içine konulmuştur.

Bitkiler genellikle tohumlarındaki kotiledon sayısına bağlı olarak tek çenekli veya çift çenekli olarak sınıflandırılır. Tipik olarak, tek çenekli tohumlar scutellum (kalkansı pul) adı verilen tek bir büyük kotiledona sahiptir. Çimlenme sırasında, scutellum (kalkansı pul) enzimatik olarak salınan gıda maddelerini endospermden emer ve bunları gelişmekte olan embriyoya taşır.

Aksine, çift çenekli tohumların iki etli kotiledonu vardır. Birçok olgun çift çenekli tohumunda endosperm bulunmaz ve gıda maddesi kotiledonlarda saklı tutulur. Bununla birlikte, bazı çift çenekliler, çoğu tek çeneklide olduğu gibi, besin depolayan endospermli tohumlara sahiptir.

Tek ve çift tohumlularının embriyonik ekseni, plumula (tomurcuk), radikula (kökçük) ve hipokotilden (gövde bölgesi) oluşur. Tüm bu yapılar tohum çimlenmesine ve fidenin veya sporofitin erken gelişimine katılır. Çimlenme sırasında, tohum kabuğu kopar ve genç sporofitin ilk organı olan radiküle yol açar.

Işığa yanıt olarak kotiledonlar ayrılır, hipokotil düzleşir ve epikotil genişler ve ilk gerçek yapraklarını oluşturur. Yiyecek rezervleri tükendiğinde kotiledonlar solar. Sonunda, yeni yapraklar genişler ve yiyeceklerini fotosentez yoluyla sentezlemeye başlar.