Terminal transferaz-aracılı dUTP kullanarak Nick uç-etiketleme (tünel) ve Caspase 3/7 deneyleri için ölçü Epidermal hücre ölümünde kurbağalar Chytridiomycosis ile

Özet

İki yöntem kullanarak chytridiomycosis ile kurbağa epidermal hücre ölümü ölçmek. Öncelikle, terminal dUTP transferaz-aracılı nick son etiketleme (tünel) situ Histoloji klinik olarak bulaşmış ve bulaşmamış hayvanlar arasındaki farkları belirlemek için kullanabilirsiniz. İkinci olarak, biz bir caspase 3/7 protein analizi ile enfeksiyon üzerinde apoptosis bir zaman serisi analizi kuralları.

Özet

Hem suda hem genel olarak biyolojik çeşitlilik içinde büyük bir kayıp yaşandığı ve bulaşıcı hastalık chytridiomycosis en önemli nedenlerinden biridir. Bu hastalığı mantar patojen bozar ve kurbağa epidermis bozan Batrachochytrium dendrobatidis (Bd), tarafından neden olur; Ancak, patolojik değişiklikler açık olarak nitelendirmiştir değil. Apoptozis (programlanmış hücre ölümü) patojenlerin ana bilgisayar dokusuna zarar için kullanılabilir ama aynı zamanda hastalık direnci patojen kaldırma için bir ana mekanizma olabilir. Bu çalışmada, biz iki farklı deneyleri kullanarak bulaşmış ve bulaşmamış hayvanların epidermal hücre ölümü ölçmek: terminal dUTP transferaz-aracılı nick uç-etiketleme (tünel) ve caspase 3/7. Ventral, sırt ve uyluk deri dokusu tünel assay olarak, biz gözlemlemek kullanarak klinik olarak enfekte hayvanların in situ epidermal hücre ölümünde hücre ve hücre ölümü floresan mikroskopisi kullanılarak bulaşmamış hayvanlarla karşılaştırın. Epidermis seviyelerinde apoptosis enfeksiyon boyunca nasıl değiştiğini belirlemek için iki haftada bir 8 haftalık süre içinde ayak ucu örnekleri kaldırmak ve caspase 3/7 tahlil etkinlik örnekleri içinde ölçmek için ayıklanan proteinler ile kullanın. Biz o zaman caspase 3/7 etkinlik enfeksiyon yük ile aralarındaki ilişkileri belirlemektir. Tünel tahlil hücre ölüm situyerelleştirme için yararlıdır, ancak pahalı ve zaman örnek başına sahiptir. Caspase 3/7 tahlil örneklerin boyutu büyük ve zaman için verimli ders deneyler. Ancak, kurbağa ayak ucu biyopsisi küçüğüz çünkü mevcuttur sınırlı özü Bradford tahlil gibi protein miktar yöntemleri ile örnek standardizasyon. Bu nedenle, biz deri yüzey alanı örnek standardizasyon sırasında özleri tüketen önlemek için ayak biyopsi fotoğraf analizi ile tahmin öneririz.

Giriş

Hem suda hem şu anda herhangi bir omurgalı takson¹küresel çeşitliliğin en büyük kayıp birini yaşıyorsunuz demektir. Bu düşüşler bir büyük mantar patojen Batrachochytrium dendrobatidis, Bd²tarafından neden ölümcül cilt hastalığı chytridiomycosis nedeni. Patojen yüzeysel deri işlevi şiddetli elektrolit kaybı, kalp krizi ve ölüm³bozulmasına yol açabilir epidermis bozar. Bd karşı çeşitli olası ana bilgisayar bağışıklık mekanizmaları şu anda, antimikrobiyal peptidler^4,5, Kutanöz bakteriyel flora⁶, bağışıklık hücre reseptörleri^7,8gibi incelendiği, ve lenfosit aktivite^9,10. Ancak, epidermal Apoptozis ve hücre ölümü bu ölümcül patojen karşı bir bağışıklık mekanizması olup birkaç çalışmalar keşfedin.

Hücre ölümü, Apoptozis (programlanmış hücre ölümü) veya nekroz (unprogrammed ölüm), epidermis ile bir patoloji Bd enfeksiyon olabilir. Önceki araştırma hücre içi kavşak çalışmasının ne zaman cilt explants zoospore supernatants vitro¹¹' e. maruz kalır görülmektedir çünkü Bd enfeksiyon apoptosis neden olabilir gösteriyor Ayrıca, Bdepidermal dejeneratif değişiklikler-virüslü kurbağalar gözlenen elektron mikroskobu^12,13kullanarak. Transcriptomic analizleri apoptosis yolları upregulated enfekte cilt¹⁴, ve onlar Bd supernatants vitro¹⁵' e maruz kaldığında apoptosis amfibi splenocytes tabi gösterir. Büyüyen birimin Bd tetikleyebilir öneriyor kanıt rağmen hücre Apoptozis ve ana bilgisayar ölüm vitro, keşfetmek veya mekanizmalar yoluyla enfeksiyon ilerleme eksik olan Apoptozis ölçmek in vivo çalışmalar. Ayrıca, ana Bd enfeksiyon mücadele için bir savunma bağışıklık strateji olarak apoptosis kullanıyorsa veya apoptosis bir patoloji hastalık ise bilinmemektedir.

Bu çalışmada, epidermal hücre ölümü ve Apoptozis iki yöntem kullanarak enfekte hayvan in vivo algılamaya yönelik: caspase 3/7 protein tahlil ve terminal dUTP transferaz-aracılı nick (tünel) in situ tahlil son etiketleme. Her tahlil hücre ölüm¹⁶farklı yönlerini algılarken, birlikte bu yöntemlerin hücre ölümüyle mekanizmaları tam bir anlayış sağlamak ve etkisi doğru bir ölçü olun. Caspase 3/7 tahlil miktar içsel ve dışsal apoptosis yollar sağlayan efektör caspases 3 ve 7, etkinlik quantifies. Buna ek olarak, tünel tahlil apoptosis, nekroz ve pyroptosis¹⁷de dahil olmak üzere hücre ölümü mekanizmaları tarafından neden olduğu DNA fragmantasyonu algılar. Tünel tahlil hücre ölümü üç farklı cilt bölümleri kullanarak hem klinik olarak bulaşmış ve bulaşmamış hayvanların epidermiste konumunu araştırmak için kullanıyoruz: patolojisi, venter ve Pseudophryne corroboreeuyluk. Bu yöntem anatomik site konumu belirli epidermal katmanlar içinde ayrım yanı sıra, hücre ölümü tanımlar. Daha sonra caspase 3/7 tahlil apoptosis Magno16 verreauxii alpinabir 8 haftalık enfeksiyonunda boyunca, bir saat serisi miktar yapmak için kullanın. Biz ayak ucu örnekleri iki haftada aynı hayvanlardan almak ve patojen bulaşma yük caspase 3/7 aktivite ile ilişkilendirmek edebiliyoruz.

Protokol

James Cook Üniversitesi L. v. alpinauygulamalarda A1875 P. corroboree ve A1897 ve A2171 için hayvan etik onayladı.

1. hayvancılık ve izleme

1. Hayvan besleme ve zamanlama temizlik uygun bir su ile türler için uygun bir ortamda tek tek, ev. Hayvanlar her gün kontrol edin.
   1. Kritik tehlike altında Pseudophryne corroboree yetişkin bireylerin (tünel tahlil için Bölüm 4) kullanın ve tehdit Magno16 verreauxii alpina (Caspase 3/7 tahlil için Bölüm 5), bağışlanan esir İmkanları ıslahı. 15-18 ° C'de hayvanlar üzerinde bir yosun korumak ve substrat çakıl, onları günlük ters osmoz su ile sis ve 3 kez haftalık yüklü gut cırcır ile beslemek.
2. Veri üzerinde tek tek her bir kez haftalık toplamak. Bireyler için Bd adım 2.1 içinde açıklandığı gibi temizle. Her hayvan için bir ölçek kullanarak neared 0.1 g tartmak ve arama destekleri kullanarak en yakın 0,01 mm uzunluğa (SVL) havalandırma için onların burun ölçün.
3. (Bölüm 3 açıklandığı gibi) aşı sonra hayvanlar hayvan etik kuralları ile uyumlu (düzensiz cilt slough, inappetence, bacak kızarıklık, uyuşukluk veya gecikmeli iyileştiren refleks) enfeksiyonunun klinik belirtiler için her gün kontrol edin. Klinik belirtiler ve morbidite varsa hayvanlara ötenazi.
   1. Tricaine methanesulfonate (MS222) aşırı dozda ötenazi (% 0,1 w/v-MS222 pH 6-7 yaşında musluk suyu sodyum bikarbonat ile). Hayvanlar MS222 içinde 10 dk sonra hareket durur ve uyaranlara yanıt görüntülemek için tutun.

2. test Bd enfeksiyon için

1. Bd için ev temizliği
   1. Her hayvan yeni bir steril Rayonu bez (hayvan başına bir çubukla) ile temizle. Aşağıdaki swabbing yöntemini kullanın: beş kez venter, beş kez her uyluk, yan ve bacak. Toplam 45 vuruşları bu.
   2. Yavaşça çubukla sırasında ve DNA'ın etkili yakalama sağlamak için vuruş arasında döndürün. 1.5 mL microcentrifuge tüpler içine çubukla ucunu kesiyorum ve ayıklama kadar-20 ° C'de depolayın.
2. DNA ekstraksiyon ve qPCR tahlil
   1. Genomik DNA bezlerden piyasada bulunan bir DNA ekstraksiyon reaktif 50 µL 30-40 mg 0,5 mm silis boncuk ile ekleyerek ayıklayın. Boncuk boncuk çırpıcı hücre bölücü 2 min için maksimum hızda örnekleri yendi. Boncuk çırpıcı adım 2.000 x g 1 dk. için de örnekler santrifüj kapasitesi.
   2. Örnekleri 10 dk 100 ° C'de kuluçkaya ve soğumasını bekleyin. 5000 x g 3 dk de örnekler santrifüj kapasitesi ve sonra süpernatant bireysel 1,5 mL mikro santrifüj tüpleri için aktarın ve qPCR kadar-20 ° C'de depolayın.
   3. Kantitatif PCR (qPCR) Boyle vd. aşağıdaki kullanın 2004¹⁸ enfeksiyon yük çözümlenecek. Aşağıdaki değişiklikler kullanın:
      1. DNA ekstraksiyon örnekleri 6:100 Çift Kişilik deiyonize suyla seyreltik. Sığır serum albumin (BSA) 0.7 µL PCR inhibisyon önlemeye yardımcı olmak için her şey için ekleyin. Her örnek içinde singlicate çalıştırın. Her plaka üzerinde bir negatif (şablon yok) ve olumlu bir denetimi seyreltme standartlar bir dizi zoospore (enfeksiyon) yük tahmin etmek için kullanın.

3. aşı

1. Kültür Bd
   1. Kültür tryptone 16 g, 2 g jelatin hidrolizat ve laktoz (TGHL) 4 g 1 litre deiyonize su ekleyerek suyu hazırlayın. Otoklav (121 ° C 40 dk) ve suyu soğutmak izin verir.
   2. Bu durumda (New South Wales ayrı tut, AbercrombieR-L.booroologensis-2009-LB1, geçiş--dan 11 numaralı izole,) BD izole aşılamak bir TGHL et suyu içinde ve 23 ° c 7 d için büyümek, sonra et suyu kültür TGHL Ağar kaplamalar için transfer.
   3. Levha yapmak için 1 litre deiyonize su ve basınçlı kap (121 ° C 40 dk) tryptone 16 g, 2 g jelatin hidrolizat, laktoz (TGHL), 4 g ve bakteriyolojik agar 10 g ekleyin. Öylesine onlar are karışımı dokunmak serin olduğunda, ancak önce bu katılaşır, TGHL agar 92 mm çap kültür plakaları dökmek bir sınıf II biyolojik güvenlik kabin 1/4-1/3 tam.
   4. Ne zaman agar katılaşmış ve tamamen soğutmalı, Bd sıvı suyu üzerinden 0.5 mL ile her plaka aşılamak ve eşit yayılmış. Yaklaşık 1 h için plaka üzerinde kuru ve ardından plastik parafin film ile plakalarının Bd suyu karışım izin verin. 23 ° c 5-7 d için aşağı plakaları agar yan kuluçkaya.
2. Kaplamalar, zoospore aşı çözüm için sel
   1. Zoospore motilite her gün önce aşı canlılığı sağlamak için bir ters ışık mikroskobu altında kontrol edin. Zoospore yayın birçok zoospores dışında sporangia yüzme ile yüksek, kültür aşı için hazır olduğunda.
   2. Yaşlı musluk suyu veya yapay göl suyu, 3 mL ile her tabak tabak su dökme ve suya serbest bırakmak zoospores izin vermek 10 dakika oda sıcaklığında kuluçka tarafından sel. Kuluçka dönemi sonra zoospore süspansiyon yeni bir steril konteyner içine dikkatle boşaltmak.
   3. Zoospore toplama bir haemocytometer kullanarak üreticisinin yönergeleri izleyerek tahmin ediyoruz. Zoospore süspansiyon konsantrasyon bilinen sonra 1 x 10⁶ zoospores yaşında musluk suyu ile 3 mL başına bir konsantrasyon için süspansiyon oranında seyreltin.
3. Hayvanlar aşılamak
   1. Her hayvan inoculum karışımı dökerek 3 mL tarafından bireysel 50 mL kaplarda onun venter¹⁹ üzerinde aşılamak. Aşı konteyner üsse doğru toplamak fazla inoculum izin verir. Her hayvan enfeksiyon sağlamak 24 h için bireysel aşılama kapsayıcısında ayrılıp 24 h aşı sonra her birey için dezenfekte terrarium dönmek.
      1. Terraria % 13 birim/birim (v/v) ticari çamaşır suyu çözüm²⁰kullanarak dezenfekte, en az iki kez su ile durulayın, sonra en az 24 saat kurumasını sağlar.
   2. Bdiçin-negatif denetimleri, sahte olduğu gibi 3.2-3.3, aynı yöntemlerle hayvanları aşılamak ama Bdsel-ücretsiz Ağar kaplamalar 5 mL de yaşlı musluk suyu ile bunun yerine Bd Ağar kaplamalar aşılandı.

4. tünel tahlil

1. Adım 1.3.1 ve Bdeşit sayıda bölümünde açıklandığı gibi chytridiomycosis, klinik belirtileri gösteren hayvanlar ötenazi-negatif kontrol hayvanlar.
2. Cilt teşrih (dorsal, ventral ve uyluk) her hayvan örnekleri. Deri örnekleri için 2 h % 4 v/v tamponlanmış fosfat formaldehit düzeltmek. Kısa ve tutarlı zaman sabitleme tam olarak düzeltilmesi, doku sağlar ama aynı zamanda etkili ve doğru immünhistokimya boyama için sağlar. O zaman % 80 etanol için kesit için gömme kadar transferi.
3. Cilt parafin standart yöntemleri²¹histolojik hazırlık için göm. Kısaca, iletişim kuralı aşağıdaki gibidir:
   1. Etanol kademeli bir dizi dokularda kurutmak ve etanol Ksilen ile temizleyin. Doku parafin balmumu katıştırmak ve her bireyin bir parafin blok için tüm üç deri örnekleri yerleştirin.
4. Standart histolojik hazırlık²¹takip bir microtome kullanarak bölümü cilt. Doku seri olarak 5 mikron, bölüm ve hidrofilik cam slaytlara yapıştırmayın. Dört seri histosections slayt başına cilt tipine yerleştirin. Seri deri bölümleri ile birey başına üç slayt yapmak, her slayt yapıştırılmış her doku dört bölümü vardır unutmayın.
5. Aşağıdaki sırada slaytlar leke:
   1. İlk slayt Hematoksilen Eozin (H & E) counterstaining tarafından takip ile leke. Bu slayt Bd sporangia cilt içinde konumunu görselleştirmek etmektir.
   2. Piyasada bulunan bir tünel tahlil histolojik hazırlık için aşağıdaki ikinci slayt leke ve aşağıda açıklanan üreticisinin yönergelerini izleyin.
      1. İlk olarak, Ksilen yıkama başına 5 min için üç değişikliklerle slaytlar yıkayarak coplin kavanoz doku bölümlerde deparaffinize ve 5 min için % 100 etanol iki değişiklik ile her yıkama izleyin. PBS bir yıkama 5 min için ile % 95 etanol 3 dakika ve sonra % 70 etanol 3 dk. bitirmek için bir yıkama ile izleyin.
      2. Taze seyreltilmiş protein sindiren enzimi (İndinavir K 20 μg/mL PBS içinde seyreltilmiş bir konsantrasyon,) ile doku pretreat ve doğrudan slayda ekleyin. PBS için 2 dk coplin kavanozda iki değişiklik ile 15 dk. yıkama için kuluçkaya olanak sağlar.
      3. Aşırı sıvı dokunun ve %3.0 hidrojen peroksit PBS için oda sıcaklığında 2 dk coplin kavanozda gidermek. İki kez PBS ile beş dakikalığına her yıkama durulama.
      4. Aşırı sıvı ve ardından slayt üzerinde 75 µL/5 cm² doğrudan doku üzerine denge tamponunun geçerli. Bölümün çevresinde aşırı sıvı dışında 10 s. dokunun için kuluçkaya ve terminal deoksinükleotidil tranferase (TdT) enzim çalışma 55 µL/5 cm² uygulayın. 37 ° C'de 1 h için oksijen odasında kuluçkaya
      5. Slayt çalışma gücü stop/yıkama arabellek, bir coplin kavanoza koyup TdT kuluçka sonra 15 için kışkırtmak s ve oda sıcaklığında 10 dakika için kuluçkaya. Slayt yıkama başına 1 dk. için PBS üç değişiklikler ile yıkayın. Aşırı sıvı dokunun.
      6. Doku, 65 µL/5 cm²oda sıcaklığına için sıcak anti-digoxigenin eşlenik (rodamine) uygulanır. Oda sıcaklığında 30 dakika oksijen odasında kuluçkaya ve ışığa maruz kalma önlemek. PBS dört değişiklikleri yıkama başına 2 dakika yıkayın. Aşırı sıvı dokunun.
      7. Bitiş tarafından ekleyerek 15 µL 0,5 - 1 µg/mL DAPI (4', 6-diamidino-2-phenylindole) bir sayaç leke davranan slayt, slayt montaj orta. Bir kapak notu ile kapak ve tırnak cilası veya kauçuk çimento ile mühür. Slaytlar tahlil ışığa duyarlı olduğu gibi karanlıkta kurumasını sağlar.
   3. Leke üçüncü slayt kullanarak tünel tahlil ve DAPI counterstain lekeli bir pozitif ve negatif kontrol her örnek için kullanır
      Not: Denetim slaytlara 4 histosections ilk 2 pozitif kontrol çoğaltır ve son 2 negatif kontrol çoğaltır.
      1. Adım 4.5.2.2, yerine olumlu denetimler için doku DN arabelleği (30 mM trizma temel, pH 7.2, 4 mM MgCl₂, 0,1 mM DDT) ile önceden tedavi ve oda sıcaklığında 5 dakikalığına kuluçkaya izin. O zaman ı DN 0.1ug son bir konsantrasyon için arabellek Dnaz dağıtılması / mL ve slayta doğrudan uygulayın. Oda sıcaklığında 15 dakika kuluçkaya.  Sonra slayt dH₂O 5 yıkama ile her yıkama için 3 dakika yıkayın. Aşırı sıvı leke. Sonra tünel tahlil 4.5.2.3 bölümünde belirtilen şekilde devam.
      2. Negatif kontrol için terminal deoksinükleotidil tranferase (TdT) enzim örnekleri için (4.5.2.4 bölümünde anlatıldığı gibi) ekleme.
6. Tünel slaytlar tahlil tamamlanmasından hemen sonra gözlemlemek.
   1. Almak fotoğraf rasgele aralıklarla apoptotik hücreler ortaya çıkarır ve kırmızı ve tüm çekirdek ortaya çıkarır ve mavi DAPI, her iki rodamine leke için filtreleri kullanarak bir floresan mikroskop kullanarak X 200 her cilt bölüm boyunca böylece ilişkin bir bindirme hücre-ebilmek var olmak oluşturmak. En az 100 hücreleri cilt bölüm örnek başına başına fotoğraflandı emin olun. -20 ° C'de karanlık mikroskop kutusunda slaytları depolama
   2. Hücreleri (mavi DAPI lekeli) başına görüntü saymak. En az 100 hücreleri cilt bölüm başına sayılır emin olun. 100 hücreleri ulaşmak için resmin içinde tüm hücreleri saymak. Daha az sonra 100 hücreleri bir görüntü varsa, en az 100 hücreleri cilt bölüm hayvan başına başına ulaşana kadar başka bir görüntü saymak.
   3. Daha sonra tünel pozitif hücrelerinin aynı görüntüleri (kırmızı rodamine lekeli) saymak. Apoptozis ve değil nekroz veya arka plan gösterir, tünel pozitif hücrelerinin (membran yok lysis ile olduğu gibi) Açik Hücre kenarları ile tek hücrelerdir. Bazen hücreleri formu apoptotik organları için küçültmek.
   4. Tünel assay olarak sayılan alanlarda bulun ve H & E histosections lekeli karşılık gelen bölgeler analiz. H & E bölümleri lekeli Bdsağlar Bd enfeksiyon sitelere karşılık geldiğini onaylayın-virüslü siteler tünel tahlil apoptotik hücrelerde sayım sırasında kullanılır.

5. Caspase 3/7 tahlil

1. Her hayvandan ( Bdmaruz - ve Bd- negatif) ayak parmağı ipuçları toplamak bir kez hafta 3 sonrası aşılama yoluyla haftalık ve iki haftada sonuna kadar bağımsız başına 8 ayak parmakları kadar deneme.
   1. Ayak ucunu ikinci parmağını alev steril makasla kesip bir 1.5 mL microtube yerleştirin ve hemen-80 ° C'de dondurmak
2. Proteinler donmuş ayak örnekten ayıklayın.
   1. Örnekleri örnek arabelleği (25 mM HEPES pH 7, 5 mM MgCl₂) iki paslanmaz çelik boncuklar (3.2 mm) 1,5 mL vidalı kapak microtube ile 100 µL yerleştirin. 1dk boncuk buza 3 min tarafından takip maksimum hızda (içinde aynı boncuk çırpıcı kullanılan adım 1.2.1 olarak) yenerek 4 döngüleri tarafından örnekleri parçalayıcı. Lizis sonra santrifüj kapasitesi 12.000 g x ve 4 ° C 5 dk. toplamak süpernatant assay olarak kullanmak için örnekleri.
3. Bradford tahlil kullanarak örnek başına protein konsantrasyonu ölçmek.
   1. 384 iyi plaka 10 µL protein özü Bradford reaktifi 10 µL ile karıştırın ve oda sıcaklığında 2 min için kuluçkaya. Her örnek içinde yinelenen gerçekleştirmek, 5 serisi ile birlikte BSA seyreltme standartları katlayın. 595 Absorbans okumak nm bir Absorbans plaka okuyucu üzerinde.
4. Ayak ucu örnekleri (protein konsantrasyonu en düşük fiyat kimden adım 4.3.1 Bradford tahlil belirlenen veya örnek kurbağalar 3 g toplam ağırlığı ise standarttır) çok küçük ise, alternatif olarak, örnekleri cilt yüzeyi hesaplanıyor tarafından standardize alan fotoğrafları, Bradford tahlil yerine kullanıyor.
   1. Proteinler caspase tahlil için örnek önce ayıklarken, her ayak bir ters ışık mikroskop kullanarak 40 X büyütme, fotoğraf.
   2. Disk görüntüsü oluşturma yazılımı, ayak parmak alan hesaplanıyor tarafından bir bilgisayar kullanarak ayak örneğini analiz. Bunu ayak küçük kenarı etrafında bir çizgi çizerek ve görüntüleme yazılımı tahmini alanını şeklin içinde var. O bölgede hangi 3-dimentional deri örneği yüzey alanı yaklaşık pi (3.14), çarpma (uzunluk x kesit alanı olarak (pi x çapı) bir tüp dış yüzey alanı verir).
5. Caspase 3/7 tahlil gerçekleştirin.
   1. 384 iyi ışıldama tabak içinde 10 µL piyasada bulunan caspase 3/7 reaktif ve protein ekstresinin 10 µL ekleyin. Her örnek nüsha çalıştırın.
   2. Reaktifleri plaka yavaş yavaş için 15 s. Incubate sallayarak 30 dakika oda sıcaklığında ışıktan uzak plaka karıştırın. Işıksaçan plaka okuyucu kullanarak ışıldama ölçmek.

Sonuçlar

Tünel tahlil

Vardı daha fazla tünel pozitif hücrelerinin virüslü hayvanlarda hastalık bulaşmamış tek denetim hayvanlarda. Tünel içinde hücreleri farklılık olumlu in situ konumunu enfekte ve hayvan kontrol. Denetim hayvanlarda vardı Tünel boyunca dermal ve epidermal hücre katmanları (bkz: şekil 1A) düşük seviyelerde cilt ama virüslü hayvanlarda tünel poziti...

Tartışmalar

Epidermal Apoptozis ve hücre ölümü ölümcül hastalık chytridiomycosis patoloji veya bir mekanizma hastalık direnci Bd duyarlı türlerin potansiyel bir mekanizma olarak araştırılmalıdır. Biz hücre ölümü epidermis, in situ epidermal hücre ölüm analizi için tünel tahlil ve epidermal hücre ölümü boyunca enfeksiyon ilerlemesini izlemek için caspase 3/7 tahlil değerlendirilmesi için iki yöntem kullanılır. Hücre ölümü ve Apoptozis enfeksiyon yük ile correlated ve hücre ö...

Malzemeler

Name	Company	Catalog Number	Comments
POLARstar Omega	BMG Labtech		Luminescent plate reader
384 well flat clear bottom plate	Corning	3707
384 well low flange white flat bottom plate	Corning	3570
Agar Bacteriological (Oxoid)	Fisher	OXLP0011B
Formal-Fixx 10% Neutral Buffered Formalin	Fisher	6764254
Lactose Broth (Oxoid)	Fisher	OXCM0137B
Sodium Bicarbonate	Fisher	BP328-500
Tricane-S (MS-222)	Fisher	NC0872873
Tryptone	Fisher	BP1421-500
Bovine Serum Albumin	Invitrogen	15561020
Sterile rayon swab	Medical Wire & Equipment	MW-113
ApopTag Red In Situ Apoptosis Detection Kit	Merck Millipore	S7165
Coomassie Bradford reagent	Pierce	23200
Caspase Glo  3/7	Promega	G8090
HEPES buffer	Sigma Aldrich	H0887-20ML
Magnesium chloride	Sigma Aldrich	1374248-1G
Gelatin hydrolysate Enzymatic	Sigma-Aldrich	G0262
PBS (Phosphate Buffered Saline), pH 7.2 (1X)	Thermo/Life	20-012-043
Prepman	Thermo/Life	4318930
TaqMan Fast Advanced Master Mix	ThermoFisher	4444556
Parafilm	Bemis	PM996
Clorox bleach	Clorox
Ethanol, 200 Proof, Molecular Grade	Fisher	BP2818500
ZEISS Axio Scan florescent miscroscope	Carl Zeiss		Florescent microscope
3.2mm stainless steel beads	BioSpec	11079132SS
Primer ITSI-3 Chytr (5′-CCTTGAT ATAATACAGTGTGCCATATGTC-3′)	Taqman		Individual design for primers and probe
Primer 5.8S Chytr (5′-TCGGTT CTCTAGGCAACAGTTT-3′)	Taqman		Individual design for primers and probe
Minor groove binder probe Chytr MGB2(5′-CGAGTCGAAC-3′)	Taqman		Individual design for primers and probe
Rotor-Gene qPCR Instruments	Qiagen		qPCR machine
Microcentrifuge tubes 1.5ml	Fisher	02-681-372
Cell culture petri plates	Nunc	263991
Mini-beadBeater Zircornia-Silicate Beads, 0.5mm	BioSpec	11079105Z