Başlamak için, temiz kavanoza 150 mililitre temiz beş milimetre cam boncuk ekleyin ve kapağı kapatın. Kapalı kavanozu, kapağı kavanoz bağlantısına gizleyecek kadar alüminyum folyo ile kapatın ve 121 santigrat derecede 20 dakika otoklavlayın. Fideler steril tezgahta kavanoza aktarılmaya hazır olduğunda, kavanozun alüminyum folyosunu ve kapağını çıkarın.
Kavanoza 35 mililitre yarı güçlü Murashige ve pH 5.7 ila 5.9 arasında Skoog ortamı ekleyin ve boncukları ortamla eşit şekilde kaplamak için karıştırın. Kök sistemlerinin cam boncuklar arasına yerleştirildiğinden emin olarak kavanoza üç ila beş fide koyun. Kökleri örtmek ve yaprakları ortamdan kaldırmak için boncukları steril forseps veya kaşıklarla ayarlayın.
Kavanozun üst kısmına iki şerit 1.25 santimetre mikro gözenekli bant sabitleyin ve kapağı yavaşça üstüne yerleştirin. Hava değişimine izin verirken steriliteyi korumak için kapak ve kavanoz arasındaki boşluğu 2,5 santimetre mikro gözenekli bantla kapatın ve kavanozu bir büyüme odasına yerleştirin. Bitkiler istenen yaşa ulaştığında, mikro gözenekli bandı ve kapağı kavanozdan çıkarın.
Sterilite testi için LB Agar Plate'e 20 mikrolitre büyüme ortamı ekleyin. 25 mililitrelik hacimsel bir pipet kullanarak, köklere zarar vermeden mümkün olduğunca fazla büyüme ortamını çıkarın. Yaprakların ıslanmasını önlemek için kavanoz duvarı boyunca 50 mililitre toplama ortamı ekleyin.
Kavanozu bir kapakla kapatın ve steril koşullarda iki saat inkübe edin. İnkübasyondan sonra, istenen miktarda toplama ortamını tüplere çıkarın. Kökün ağırlığını ölçün ve kök eksüdalarını bitki ağırlığına göre normalleştirmek için bitkiden bir kavanozda ateş edin.
Arabidopsis thaliana bitkileri iki farklı laboratuvarda sağlıklı görünüyordu. Cam kavanoz sisteminin çeşitli bitki türleri ve gelişim aşamaları için uyarlanabilir olduğu kanıtlanmıştır. Buğday en yüksek oluk ağırlığına sahipti, onu sorgum ve domates izledi.
Sorgum en yüksek kök ağırlığına sahipken, onu buğday ve Medicago truncatola izledi. Arabidopsis thaliana'nın kommensal bakterilerle aşılanması bitki fenotipini değiştirmedi ve aşılanan bakteriler, koloni oluşturan birimlerde hafif bir artışla sistemde en az 12 gün kaldı.
