Başlamak için, taşınabilir bir stoma görüntüleme cihazını görüntü alma yazılımı ile donatılmış bir bilgisayara bağlayın. Arabidopsis thaliana bitkisinin Pseudomonas şırınga ile aşılanmış yapraklarından su damlacıklarını dikkatlice çıkarmak için bir parça kağıt kullanın. Şimdi cihazın üst kapağını açın, kanadı sahneye yerleştirin ve kapağı kapatın.
Ayar vidasını kullanarak odağı ayarlayın ve görüntüyü yakalamak için Görüntüyü bilgisayarda kaydet'e tıklayın. Stoma açıklığının otomatik ölçümünü gerçekleştirmek için Google Colaboratory not defterini açın. Google Drive'da yerel bir kopya oluşturmak için Dosya'yı ve ardından Drive'a bir kopyasını kaydet'i tıklayın.
Yeni bir sekme açıldığında, özgün not defterinin sekmesini kapatın. Hücre bloklarını açmadan gerekli kitaplıkları içeri aktarmak için not defterindeki Ortam ayarları bölümünün altındaki Yürüt düğmesine basın. Dizin ayarları bölümünde, analiz için Google Drive'da üç klasör oluşturun.
Elde edilen görüntüleri example_result klasörüne taşıyın ve son grafik oluşturma için işleme veya örneğe göre kategorilere ayırın. Zenodo'dan eğitilen modellerin ONNX dosyalarını indirmek için Eğitilen modelleri indir'e tıklayın. İndirilen dosyaları model dizinine yerleştirin.
Tek tek görüntülerden stoma açıklığını ölçmek için not defterinin stoma açıklığı bölümünün çıkarımını ve ölçümünü çalıştırın. Ortaya çıkan görüntüler, üst üste bindirilmiş çıkarım ve example_result. CSV dosyası inference_results dizinine aktarılacaktır.
Stoma açıklık oranı hakkında bir grafik oluşturmak için Grafik oluşturma bölümünü yürütün. Bu grafiği inference_results dizinine aktarın. Aşılamadan bir saat sonra Pto aşılanmış bitkilerde sahte aşılanmış bitkilere kıyasla stoma açıklığında bir azalma gözlenmiştir.
Enfeksiyondan üç saat sonra, hem Pto ile aşılanmış bitkilerde hem de sahte aşılanmış bitkilerde stoma açıklığı hemen hemen aynıydı. Stoma açıklığının otomatik ölçümü, bir görüntünün işlenmesi için yaklaşık beş saniye sürdü ve bu da ölçüm süresinde %95'lik bir azalma sağladı.
