Çoğullanmış canlı hücre görüntüleme kullanarak hastadan türetilen organoidlerde ilaç yanıtını analiz etmek için Gen5 yazılımında görüntü analizi

Başlamak için, Cytation 5 canlı hücre görüntüleme sistemini kullanarak floresan etiketli PDO'ları görüntüleyin. Ardından, Gen5 yazılımını başlatın. Denemeler'e gidin ve Görev Yöneticisi'nde Aç'a tıklayın.

İstediğiniz denemeyi açın ve Plaka'yı ve ardından araç çubuğunda Görüntüle'yi seçin. Ardından, veri açılır menüsünü Z Projeksiyonu olarak değiştirin. Seçilen bir kuyuya çift tıklayın.

Analiz Et'i seçin. Yeni bir görüntü analizi veri azaltma adımı ayarlamak istiyorum'a tıklayın ve Analiz ayarları'OK.In tıklayın, türü Hücresel Analiz ve algılama kanalını Z Projeksiyon dönüştürülmüş TSF Brightfield olarak ayarlayın. Birincil maske ve sayım sayfasını açmak için Seçenekler'i tıklatın.

Eşik kutusunda Otomatik'i işaretleyin ve açılır pencereyi kapatmak için Tamam'ı tıklayın. Nesne Seçimi altında, hücresel kalıntıları veya tek hücreleri filtrelemek için minimum ve maksimum nesne boyutlarını tanımlayın ve diğer özellikleri istediğiniz gibi seçin. Ardından, Uygula'ya tıklayın ve maskelenmiş nesneler vurgulanacaktır.

Hücresel analiz araç çubuğunda bir alt popülasyon analizi ayarlamak için Hesaplanan Metrikler'e tıklayın. Ardından, sağ alt köşedeki İlgilendiğiniz nesne düzeyinde metrikleri seçin veya oluşturun'u tıklayın. Kullanılabilir nesne metrikleri arasından, Dairesellik gibi istediğiniz metrikleri seçin ve Ekle'ye tıklayın.

Onaylamak için Tamam'a tıklayın. Ardından, hücresel analiz araç çubuğunda Alt Popülasyon Analizi'ni seçin ve yeni bir alt popülasyon oluşturmak için Ekle'ye tıklayın. Alt popülasyon için bir ad girin.

Nesne metriklerinde, seçilen bir metriği eklemek için Koşul Ekle'yi tıklayın. Edit Condition (Koşulu Düzenle) penceresine istediğiniz parametreleri girin ve OK (Tamam) düğmesini tıklatın. Pencerenin altındaki tabloda istediğiniz sonuçları seçin ve Tamam'ı ve ardından Uygula'yı tıklayın. Nesne Ayrıntıları'nın altında, maskelemeyi görüntülemek için belirlenmiş alt popülasyonu seçin.

Memnun kalırsanız, Hücresel Analiz penceresinde Tamam'a tıklayın ve analizi tüm kuyucuklara uygulamak için Adım Ekle'ye tıklayın.