Epon Gömme Sonrası Korbağıntılı Işık ve Elektron Mikroskobu için Fare Beyin Bölümlerinin Parlak Alan ve Floresan Görüntülerinin Görüntü Analizi

Başlamak için, mScarlet'i ifade eden fare beyin dokusunun Brightfield ve Floresan görüntülerini yakalayın. ImageJ'de farklı görüş alanlarına sahip birkaç Brightfield görüntüsünün gezinme haritasını oluşturmak için ham verileri bulun. Ardından ImageJ'yi açın, eklentiler arasında gezinin, birleştirmeye tıklayın ve ızgara veya koleksiyon birleştirmeyi seçin.

Izgara yılanını sütuna göre yaz'ı tıklatın, yukarı ve sola sırala'yı seçin ve dilim boyutunu ayarla'yı tıklatın. Veri yolunu seçmek için gidin ve dosya adını ayarla'ya tıklayın, ardından ekran füzyonunu kontrol edin. Belirli bir hücrenin sıralı Brightfield görüntülerini içe aktarmak için dosya'yı tıklayın ve içe aktar'ı ve ardından görüntü sırasını seçin.

Bu görüntülerin toplam yoğunluk projeksiyonu için görüntüye gidin, yığınları seçin, Z projeksiyonu'nu tıklatın ve ardından toplam dilimleri'ni tıklatın. Ardından düzenle'yi seçin ve toplam yoğunluk projeksiyon görüntüsünü ters çevirmek ve altın nanoparçacıkların görünürlüğünü artırmak için ters çevir'e tıklayın. Ardından, sıralı Floresan görüntülerini içe aktarın.

Toplam yoğunluk projeksiyon görüntüsü oluşturmak için görüntü'ye tıklayın ve yığınları seçin. Ardından Z projeksiyonuna gidin, dilimleri topla'ya tıklayın ve görüntüleri TIF formatında kaydedin. Hem Brightfield hem de Floresan görüntülerin toplam yoğunluk projeksiyon görüntülerini açın.

Görüntüye gidin, rengi seçin ve Brightfield görüntüsünün toplam yoğunluk projeksiyonunu Floresan görüntüsüyle birleştirmek için kanalları birleştir'i tıklatın. Daha sonra, görüntüyü seçin ve türü tıklayın, ardından kompozit görüntünün biçimini RGB'ye dönüştürmek için RGB rengi. Altın nanopartiküller yeşil görünecek ve floresan protein kırmızı görünecektir.

Ardından görüntüyü bir TIF dosyası olarak kaydedin.