Başlamak için görüntü işleme yazılımını başlatın, dosyayı seçin, ardından verileri açın ve daha önce oluşturulmuş mikro CT taranmış görüntüleri nokta BMP formatında seçin. Görüntü okuma parametreleri penceresi açıldığında, parametreleri onaylayın ve doğruysa kabul edin. Ana panelde, nokta BMP dosyasının adıyla oluşturulan yeni bir nesneyi bulmak için proje görünümüne tıklayın.
Oluşturulan nesneye sağ tıklayın ve orto dilimi seçeneğini seçin, ardından oluştur'a tıklayın. Özellikler altında, görmek için yönlendirme düzlemini ve dilim numarasını seçin. Ana panelde başlığın tamamının 3B ciltlerini elde etmek için proje görünümüne gidin, görüntü nesnesini sağ tıklatın, etkileşimli eşikleme seçeneğini belirleyin ve oluştur'u tıklatın.
Özellikler altında, görüntünün hayvanın kafasına karşılık gelen kısmı seçilene kadar minimum eşik RGB ve maksimum eşik RGB değerlerini değiştirin. Ardından uygula'yı seçin. Proje görünümü altında oluşturulan eşik nesnesine sağ tıklayın.
Özellikler'de izoyüzey'i seçin, yüzeyi görselleştirmek için bir eşik seçin ve ardından uygula'ya tıklayın. Yer işaretlerini dijitalleştirmek için proje görünümüne sağ tıklayın, nesne oluştur'u seçin, ardından noktaları ve çizgileri ve ardından yer işaretlerini seçin, ardından oluştur'a tıklayın. Ardından yeni nesne yer işaretlerine sağ tıklayın.
Yer işareti görünümünü seçin ve oluştur'a tıklayın. Boyut altında, punto boyutunu değiştirin. Özelliklere yer işaretleri eklemek için, düzenleme modunda ekle'yi seçin.
Orta beyin korteksi kesişimindeki bir sonraki dönüm noktasına kadar eğrilerin etrafında eşit olarak dağılmış beş noktayı sayısallaştırın, ardından korteksin etrafındaki sekiz yarı yer işaretini sayısallaştırın. Sayısallaştırılmış noktaları kaydetmek için nesne yer işaretlerine sağ tıklayın ve verileri kaydet'i seçin. Beyni bölümlere ayırmak için proje görünümüne sağ tıklayın, ardından nesne oluşturun, görüntüleri ve alanları seçin ve ardından alanı etiketleyin.
Oluştur'a tıklayın. Etiket alanı nesnesini seçin ve özelliklerde segmentasyon düzenleyicisi seçeneğine basın. Malzemeler altında, yeni bir malzeme ekleyin ve beyin olarak yeniden adlandırın.
Seçim altında, her dilimde beyne karşılık gelen dokuyu bölümlere ayırmak için geçerli dilimi seçin. Araçlarda, her dilimdeki beyin dokusunu seçmek için sihirli değnek ve fırçayı kullanın. Ardından seçim altında, ekle tuşuna basın.
Şimdi proje görünümüne dönün, etiket alanına sağ tıklayın ve yüzey oluştur'u seçin, ardından uygula'ya tıklayın. Yüzey elde edildikten sonra, dışa aktarmak için ekstrakt yüzeyi uygulayın. Mikro BT taraması ile yenidoğan fare beyinlerinin küçük boyutlarına rağmen, koku soğancıkları, korteks, orta beyin, beyincik ve arka beyin gibi anatomik yapılar ayırt edilebilir.
Tüm beynin manuel olarak segmentasyonu, yenidoğan beyninin 3D model rekonstrüksiyonu ile sonuçlandı.
