Başlamak için, özgür yazılım kullanarak 10 ila 23 çekirdekli DNAzyme tabanlı nanomakineler veya DNM tasarlayın. Tasarlanan dizileri ticari kaynaklardan elde edin. Ardından, 200 mikrolitre reaksiyon tamponu ile 0.5 mililitrelik mikrosantrifüj tüpleri alın.
Tüplere DZB-Tile ve Tile-arm3 oligonükleotidleri ekleyin. Yavaşça karıştırın ve çözeltiyi aşağı doğru döndürün. Kapalı tüpün kapağını parafin film ile sarın veya vidalı kapaklı tüpler kullanın.
Tüpü 500 mililitrelik bir beherde iki dakika kaynar su ile inkübe edin. Ardından, ısıtıcıyı kapatın ve sıcaklığın gece boyunca pasif olarak soğumasını bekleyin. Şimdi, verilen reaktifleri kullanarak %12 yerel sayfayı hazırlayın.
Karışımı jel kasetine aktarın ve polimerize olmasına izin verin. Her numunenin bir mikrolitresini bir mikrolitre dört kez yükleme boyası ile karıştırın ve jele yükleyin. Kaseti hazneye yerleştirin.
TBE tamponu ile doldurun ve jeli 82 ila 100 voltta 90 dakika boyunca çalıştırın. Jeli etidyum bromür ile boyayın ve bir jel belgeleme sistemi kullanarak görselleştirin.
