Başlamak için, özgür yazılım kullanarak 10 ila 23 çekirdekli DNAzyme tabanlı nano makineler veya DNM tasarlayın. DNM'yi birleştirin ve yerel sayfaya göre boyutunu ve homojenliğini kontrol edin. Daha sonra reaksiyon tamponunda 160 mikrolitre F-sub hazırlayın.
Reaksiyon tamponunda 160 mikrolitre önceden monte edilmiş DNM, F-sub ve DZA'dan oluşan yedi alikot hazırlayın. Analiti iki ila yedi tüplere ekleyin ve bileşenleri yavaşça karıştırın. Daha sonra tüpleri döndürün ve çözeltileri siyah 96 oyuklu bir plakada 50 mikrolitrelik üç parçaya bölün.
Plakayı optik olarak şeffaf bir filmle kapatın. Plakayı bir saat boyunca 55 santigrat derecede bir su banyosunda inkübe edin. Ardından plakayı aşağı doğru döndürün.
Daha sonra, 480 nanometre uyarma dalga boyunda ve 525 nanometre emisyon dalga boyunda floresan ölçün.