Rizosfer Örneklerinden Çok Türlü Biyofilm Mikrobiyotanın Dizilenmesi ve Tanımlanması

Başlamak için, çok türlü bir rizosfer biyofilmi oluşturun ve mikrobiyota hücre süspansiyonunu elde edin. Triptik soya suyu ortamını minimum tuzlar, gliserol glutamat ortamı ile bire bir oranında karıştırın. Bakterileri aktive etmek için hücre süspansiyonunu gece boyunca 30 santigrat derecede ortamda inkübe edin.

100 mikrometre naylon hücre filtrelerini 24 oyuklu bir plakaya yerleştirin. Bakteriyel süspansiyonu üç kopya halinde aşılayın ve pelikül biyofilmini 30 santigrat derecede 36 saat boyunca yetiştirin. Pelikül biyofilmini içeren filtreyi çıkarın ve yeni bir 24 oyuklu hücre plakasına iki mililitre PBSS tamponu ekleyin.

Biyofilmi yıkamak ve serbest hücreleri çıkarmak için filtreyi plakaya yerleştirin. Biyofilmdeki ana beş türün tanımlanması ve yetiştirilmesinden sonra, ortamdaki 31 sentetik topluluk kombinasyonunu inkübe edin. Söz konusu prosedürü takiben, salatalık rizosfer toprak mikrobiyotasından biyofilm oluşturma kapasitesinde önemli gradyanlar gözlenmiştir.

Biyofilm amplikon dizilimi, pelikülde çeşitli türlerin varlığını doğruladı.