İsviçre Ulusal Bilim Vakfı (n ° 51AU40_125759) tarafından finanse edilen bu araştırma Yetkinlik Araştırma Ulusal Merkezi (NCCR) &quot;Ruh Hastalıkları Synaptic Bazlar SYNAPSY&quot; tarafından desteklendi. Yerel Gyrification Endeksi Geliştirme Dr. Marie Schaer İsviçre Milli Araştırma Fonu (323500-111165) ve Dr. Stephan Eliez (3.200-063.135,00 / 1, 3.232-063.134,00 / 1, PP0033-102.864 ve 32473B hibeleri tarafından desteklenen -121.996) ve Cenevre-Lozan Üniversitelerin Biyomedikal Görüntüleme (CIBM) ​​Merkezi ve EPFL yanı sıra vakıflar Leenaards ve Louis-Jeantet. FreeSurfer yazılım geliştirme için destek Ulusal Araştırma Kaynakları Merkezi (P41-RR14075 ve NCRR BIRN Morfometrik Projesi BIRN002, U24 RR021382), Biyomedikal Görüntüleme ve Biyomühendislik Ulusal Enstitüsü (R01 EB001550, R01EB006758), kısmen sağlanmıştır Ulusal Nörolojik Bozukluklar ve Felç Enstitüsü (R01 NS052585-01) yanı sıra, Ruh Hastalıkları ve Nörobilim Discovery (ZİHİN) Enstitüsü ve Tıbbi Araştırma NIH Yol Haritası, Hibe U54 ile Ulusal Sağlık Enstitüleri tarafından finanse edilen Ulusal Tıbbi Görüntü Computing için İttifak (hemodinamik), bir parçası EB005149. Ek destek Ellison Tıp Vakfı tarafından finanse edilen Otizm ve Disleksi Project tarafından sağlanmıştır.

1. 3D kortikal yüzeyleri yeniden Wiki (açıklandığı gibi protokol Bu standart FreeSurfer boru hattının ilk bölümü <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki">kullanır</a> http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki) . Burada ayrıntılı komutları kortikal yüzey rekonstrüksiyonlar ulaşmanın tek yolu tarif unutmayın, ancak eşdeğer komutları de kullanılıyor olabilir. <ol class="lalpha"><li> FreeSurfer içine çiğ MR DICOM İthalat ve görüntü kalitesini kontrol (yönünü doğru olduğunu örneğin, yeterli kontrast ve görüntüler taşınır). Bu süreç aşağıdaki komutları (&lt;...&gt; (dahil) arasında belirli bir örneğine uygun değerleri ile metni değiştirmek ve &quot;#&quot; yorum gösterir) kullanır: mksubjdirs <subj_id> # FreeSurfer tarafından kullanılan klasör mimarisi oluşturmak CD <subj_id> / Mri # konu mri klasörüne gidin mri_convert-cm <path_to_your_dicom&gt; 001.mgz # # FreeSurfer formatında ham MR dönüştürmek tkmedit <subj_id> 001.mgz # dönüştürülen hacmi görselleştirmek </subj_id></path_to_your_dicom></subj_id></subj_id></li><li> Üç boyutlu kortikal örgü modelleri 8,9 oluşturun. Gömüldü sulkuslar sorunu ile başa çıkmak için, FreeSurfer ilk, ilk gri-beyaz yüzey için bir başlangıç ​​noktası olarak kullanılan bir üniter beyaz cevher hacmi oluşturur . Bu yüzey daha sonra yoğunluk yerel degrade göre optimize edilmiş ve gri-CSF arayüzü daha da genişletilir. Recon Tüm-s <subj_id> # Kortikal yüzey rekonstrüksiyonu başlatmak </subj_id> Beyaz (gri-beyaz bir arayüz) ve pial (gri-CSF arayüzü) yüzey yeniden yapılanma süreci sonunda, iki örgü modelleri için yaklaşık 150.000 puan her yarımkürede oluşan alacak. Tüm yüzeylerin ve hacimlerin izin vererek, doğal boşluk kalması dikkat etmek önemlidir.<html> hacmi, yüzey alanı, kalınlık veya gyrification endeks ölçümü deformasyon olmadan ölçülebilir. </li><li> Bu yeniden inşa yüzeylerin doğruluğunu kontrol edin: tkmedit <subj_id> T1.mgz? H.pial # yeşil beyaz yüzey, üst üste ve kırmızı pial yüzey. </subj_id> h yarımkürede gösterir:? sağ hemisfer, sol hemisfer ve rh.pial lh.pial. Şekil 2 (2 sürümlerinde, film ve statik bir web sitesi için dahil edilecek bir animasyonlu gif görüntü) FreeSurfer paketi ile birlikte dağıtılan &quot;bert&quot; özne için doğru beyaz ve pial yüzeyler rekonstrüksiyonlar bir örnek gösterir . Yeniden yapılanma sürecinin sonucu elle düzeltmek için varsa, (FreeSurfer Wiki bir öğretici bulacaksınız <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/WhiteMatterEdits">http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/WhiteMatterEdits</a> ,</li></ol> 2. Yerel Gyrification Endeksi Compute : Yüzeyler memnun olduğunuzda, komutunu kullanarak yerel Gyrification Endeksi (l GI) hesaplamak Recon Tüm-LGI-s <subj_id></subj_id> Bu komut, genellikle iş istasyonunun gücüne bağlı olarak, bir çalışmada katılımcı iki yarımküresinin yaklaşık 3 saat boyunca çalışır. Şekil l GI sürecin farklı adımları gözden. 1. Bilgisayar morfolojik kapatma işlemini kullanarak bir dış yüzey oluşturulması ile başlar. Bu dış yüzeyi, başlar? H.pial_outer_smoothed, daha Şekil gösterilmiştir. 3. Daha sonra, dairesel bölgelerin ilgi yaklaşık 800 üst üste dış yüzeyi oluşturulur. Bu bölgelerin her biri için, faiz karşılık gelen bir bölge tanımlanırpial yüzey. Tüm hesaplama kortikal yüzeyin her noktası için bir l Gİ değeri (yani ~ 150.000 yarımkürede ortalama değerleri) içeren bireysel bir haritanın oluşturulması ile sona erer. 3. Her yarımkürede l GI hesaplama sonucu kontrol edin tksurfer <subj_id> ? H pial-bindirme <subj_id> / Sörf / h.pial_lgi-fthresh 1 </subj_id></subj_id> L GI değerleri kortikal yüzey üzerinde üst üste. Herhangi bir gri kortikal alanda olmamalıdır: Doğru l olarak GI değerleri genellikle 1 minimum eşik seçeneği fthresh ile hızlı bir kontrol sağlar, 1 ile 5 arasında oluşmaktadır. Şekil doğru bir sonuç bir örnek gösterilmiştir. 4. 4. İstatistiksel grup karşılaştırmalarında Amacı, cinsiyet etkisi kontrol ve kortikal yüzey üzerinde her köşe grup etkisini ölçmek içinyaşı. Her köşe kortikal kalınlık karşılaştırmak istiyorum sanki aynı süreci takip etmek gerekiyor, ama vermek olacak? H.pial_lgi yerine? H.thickness. İki seçenek istatistiksel grup karşılaştırmaları hesaplamak mümkündür: klasik komutları ilk listelenir ve grafik arayüzü (Qdec) kısaca ondan sonra belirtilen. <ol><li> Gruplar arasında l GI sonuçları karşılaştırmak için ilk seçenek aşağıdaki komutları kullanmak; Daha fazla bilgi elde edilebilir <a href="https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/GroupAnalysis">https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/GroupAnalysis</a> . <ol class="lalpha"><li> İlk giriş tüm konuları veren bir çalışma belirli bir şablon oluşturmak için ihtiyacınız olacak: make_average_subject - konular <subj_1><subj_2><subj_3> ... </subj_3></subj_2></subj_1> Komutu yukarıda, &quot;ortalama&quot; adlı bir konu yaratacaktır. Alternatif olarak, söz konusu &quot;fsave kullanabilirsinizöfke &quot;FreeSurfer dağıtımının bir parçası olarak dağıtılır. </li><li> Daha sonra, çalışmada yer alan konular (&quot;FreeSurfer Grup Tanımlayıcısı Dosya&quot;) tanımını içeren bir metin dosyası oluşturun. FSGD.txt bu gibi görünmelidir: GroupDescriptorFile 1 Grup Control_Male Grup Control_Female Grup Patient_Male Grup Patient_Female Değişkenler Yaş Giriş <subj_1> Patient_Male 20 Giriş <subj_2> Control_Female 23 &lt;...&gt; </subj_2></subj_1></li><li> L GI ortalama konunun her yarımkürede için aşağıdaki komutu kullanarak uzayda veri resample: mris_preproc - fsgd FSGD.txt hedef ortalama? hemi saat - ölçüm pial_lgi? dışarı h.lgi.mgh </li><li> Sinyal gürültü azaltmak için kortikal yüzey üzerinde veri Smooth: mri_surf2surf -? hemi h - ler ortalama -? sval h.lgi.mgh - FWHM 10 -? tval h.10.lgi.mgh </li><li> Her köşenin düzeyde grup karşılaştırma hesaplayın. Bunun için, yukarıda açıklanan FSGD.txt durumda kontrast metin dosyasını (örneğin oluşturmanız gerekir, &quot;contrast.txt&quot; değerler &quot;1 1 -1 -1 0&quot; kontrol ve arasındaki fark hesaplamak için içerecektir yaş ve cinsiyet için kontrol) hasta iken. Sonunda karşılaştırma çalıştırın: mri_glmfit - y h.10.lgi.mgh - - fsgd FSGD.txt düşkünler? glmdir h.lgi.glmdir - sörf ortalama h? C contrast.txt </li><li> Tksurfer kullanarak ortalama konuyla ilgili sonuçları gözünüzde canlandırın: tksurfer ortalama? saat şişirilmiş Sonra bindirme klasöründe bulunan sig.mgh dosya olarak yüklenecek? H.lgi.glmdir / contrast.txt / sig.mgh. &quot;Yapılandırmak overlay&quot; seçeneğini kullanarak yanlış keşif hızı 10 ile çoklu karşılaştırmalar için p eşik yanı sıra doğru daha da değiştirebilirsiniz . </li></ol></li><li> Grup com için alternatif bir seçenekparison Qdec FreeSurfer uygulanan bir grafik kullanıcı arabirimi kullanmaktır. Yerel Gyrification Endeksi ile Qdec kullanımı l GI veri öncesi pürüzsüz gelir: Recon Tüm-qcache-tedbir pial_lgi ortalamanın <your_average_subj> -S <subj_id></subj_id></your_average_subj> Qdec ile FreeSurfer Grup Tanımlayıcısı Dosya yaş gibi farklı gruplar ve diğer karıştırıcı değişkenler açıklamasını içerir biraz farklı bir versiyonu, Veri Tablosu (qdec.table.dat) tarafından değiştirilir. Qdec kullanımını ayrıntılı bir açıklaması sağlanmaktadır <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/QdecGroupAnalysis">http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FsTutorial/QdecGroupAnalysis</a> . L GI Qdec bağımlı değişkenler listesinde mevcut değilse, not, size kendi ev dizininde bulunan Qdecrc dosyasına aşağıdaki satırı eklemeniz gerekir: MEASURE1 = pial_lgi </li> &lt;/ Ol&gt; 5. Analiz Alternatif olarak, istatistiksel analizler sonunda FreeSurfer 11 entegre kortikal Parselasyon düzeyinde hesaplanan olabilir. Bu amaçla, ortalama l GI değerleri her yarımkürede 34 giral ilgi bölgeler için ayıklanır, ve bu ölçümlerin daha farklı gruplar arasında mukayese edilebilir. Bu parsel-bilge analizi (yukarıda açıklanan vertex akıllıca analiz karşı) istatistiksel karşılaştırmalar miktarını sınırlar gibi çekici olabilir. Ancak, her noktada l GI bir ilgi giral bölgede ortalama l GI de bir ölçüde ilgi komşu bölgelerde gyrification yansıtır ki, çevresindeki dairesel bir alanda gyrification rakamlarla. Son olarak, bu protokol, Fr sırasında karşılaşılan diğer sorunlar için bir çözüm açıklanan olmasına rağmen en önemli konulardaneeSurfer veya l GI işleme FreeSurfer e-posta listesi (arşivlerinde bulunabilir <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FreeSurferSupport">http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki/FreeSurferSupport</a> ). 6. Temsilcisi Sonuçlar 1c protokol bölümünde de açıklandığı üzere, her zaman dikkatli bir şekilde l GI hesaplama önce kortikal yüzeylerin yeniden doğruluğunu kontrol etmelisiniz. Frontal ve oksipital lob arasında hareket ederken, gemi ve membran pial yüzey dahil olmadığını özellikle dikkat. Beyaz bir yüzeye doğru gri-beyaz arayüzü aşağıdaki kontrol ediniz. Doğru yeniden yapılanma bir örneği (bütün hacmi için animasyonlu gif şekle bakın) Şekil 2&#39;de verilmiştir. L Gİ hesaplama sonunda, ayrıca, her konunun her iki yarımkürede sonucu kontrol etmek olacaktır .1 den küçük bir l GI sonucu herhangi bir kortikal alanı olmamalıdır. Protokol ve bu rakam 4 bölüm 3 l GI hesaplama çıkış doğruysa doğru nasıl kontrol edeceğinizi gösteriyor. <img alt="Şekil 1" src="/files/ftp_upload/3417/3417fig1.jpg" /> Şekil 1: l GI hesaplama Genel Bakış Öncelikle, üç boyutlu kortikal örgü modelleri standart FreeSurfer boru hattı ile ham görüntüleri yeniden inşa edilir. Bu rekonstrüksiyon algoritmaları gömüldü sulkuslar sorunun üstesinden gelmek için başlangıç ​​noktası olarak ikili bir beyaz cevher hacmi kullanın. Kortikal örgü modelleri genellikle yaklaşık 150.000 köşeleri kapsar ve klasik her noktada kortikal kalınlığı hesaplamak için kullanılır. Benzer şekilde, yerel Gyrification Endeksi (l GI) Her köşe hesaplanacaktır. Bu amaçla, bir dış yüzey oluşturulur. Sonra ilgi karşılık gelen dairesel bölgelerin bir dış tespitd kortikal yüzey eşleştirme algoritması kullanarak. Ilgi örtüşen bölgelerde, l GI bireysel haritaların oluşturulması sürecinin sonuçları üreten yaklaşık 800 sonra. Bu haritalar, kolaylıkla yorumlanabilir: 5 araçlarının bir dizin daha kortikal yüzey çevredeki sulkuslar içinde invajine olduğ u 5 kez olduğunu görünür kortikal yüzey miktarı; 1 araçlarının korteks çevresindeki düz olduğunu bir dizin . Son olarak, benzer kortikal kalınlık karşılaştırmalar istatistiksel grup karşılaştırmaları, her köşenin düzeyinde hesaplanır. Şekil 1B l GI bireysel kortikal haritası. Bu küçük film, Şekil gösterildiği gibi ayrı bir kortikal LGI harita 360 derece dönüş gösterir . 1. Utero yaşam sırasında oluşturulan ilk kat daha yüksek l GI değerleri ile kortikal bölgeleri karşılık unutmayın dikkat çekicidir: sylvian fissür, superior temporal sulkus ve<a href="http://www.jove.com/files/ftp_upload/3417/3417fig1B.avi">Film</a> traparietal beynin lateral görünümde sulkus ve beynin medial parieto-oksipital sulkus. <img alt="Şekil 2" src="/files/ftp_upload/3417/3417fig2.jpg" /> Şekil 2. Örnek yeterli kortikal yüzey rekonstrüksiyonu (bir koronal bölümü) yeniden yapılanma süreci sona erdikten sonra, kortikal yüzeylerde doğru tüm beyin hacmi üzerinde doğrulanabilir olmalıdır. Iç kortikal yüzey (beyaz yüzey, görüntü yeşil gösterilir) tam gri-beyaz bir arayüz takip etmelidir. Dış kortikal yüzey, gemi veya membran herhangi bir parça içermemelidir (yani gri-CSF arayüzü, pial yüzey, burada kırmızı ile gösteriliyor). Unutmayın ki, burada sunulan örnek FreeSurfer paketi ile birlikte dağıtılan &quot;bert&quot; özne kullanır. Şekil 2B. Örnek yeterli kortikal yüzey reconstruction (tam ses) Bu animasyonlu gif resmini FreeSurfer ile en oksipital koronal bölümleri için en ön kaydırma tarafından görülen her koronal bölümünde &quot;bert&quot; özne sol hemisfer kortikal yüzey gösterir. <a href="http://www.jove.com/files/ftp_upload/3417/3417fig2B.gif">film göster</a> <img alt="Şekil 3" src="/files/ftp_upload/3417/3417fig3.jpg" /> Şekil 3. L GI işlemi (bir koronal bölümü) bir parçası olarak hesaplanan dış yüzey Örnek l GI hesaplamanın ilk adım yarımkürede saran bir dış yüzeyi yaratılması. Bu yüzey (FreeSurfer olarak gösterilir? H.pial_outer_smoothed) tkmedit kullanılarak kontrol edilebilir. Burada FreeSurfer ile dağıtılan &quot;bert&quot; konu bir örnek olarak kullanılır. Şekil 3B. Bu animasyonlu gif resmini l GI süreci (tam ses) bir parçası olarak hesaplanan dış yüzeyi örneği.<a href="http://www.jove.com/files/ftp_upload/3417/3417fig3B.gif">Profil film</a> FreeSurfer tkmedit ile en oksipital koronal bölümleri için en ön kaydırma tarafından görülen her koronal bölümünde sol hemisfer dış yüzeyi gösterir. <img alt="Şekil 4" src="/files/ftp_upload/3417/3417fig4.jpg" /> Şekil 4. FreeSurfer ile görüntülenebilir doğru l GI çıkış Örnek l GI ile &quot;bert&quot; özne kortikal yüzey Farklı yönlerde kaplanan değerleri. Renk kodu gibi FreeSurfer tksurfer görülen varsayılan &quot;ısı&quot; overlay. En az 1 eşik kullanarak, tüm vertices renkli olmalı ve herhangi bir kortikal alanı ap olmalıdırgri armut. Not, renk kaplama seçeneği tksurfer, minimum ve maksimum değerleri, l GI genel dağıtım histogram yanı sıra aynı zamanda kontrol edilebilir &quot;Overlay Yapılandır&quot; kullanılarak değiştirilebilir .

<ol>
	<li>Schaer, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+surface-based+approach+to+quantify+local+cortical+gyrification.">A surface-based approach to quantify local cortical gyrification.</a> IEEE. Trans. Med. Imaging. 27, 161-170 (2008).</li><li>Mangin, J. F., Jouvent, E., Cachia, A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=In-vivo+measurement+of+cortical+morphology:+means+and+meanings.">In-vivo measurement of cortical morphology: means and meanings.</a> Curr. Opin. Neurol. 23, 359-367 (2010).</li><li>Mangin, J. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+framework+to+study+the+cortical+folding+patterns.">A framework to study the cortical folding patterns.</a> Neuroimage. 23, S129-S138 (2004).</li><li>Luders, E. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+curvature-based+approach+to+estimate+local+gyrification+on+the+cortical+surface.">A curvature-based approach to estimate local gyrification on the cortical surface.</a> Neuroimage. 29, 1224-1230 (2006).</li><li>Zilles, K., Armstrong, E., Schleicher, A., Kretschmann, H. J. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=The+human+pattern+of+gyrification+in+the+cerebral+cortex.">The human pattern of gyrification in the cerebral cortex.</a> Anat. Embryol. (Berl). 179, 173-179 (1988).</li><li>Rakic, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Specification+of+cerebral+cortical+areas.">Specification of cerebral cortical areas.</a> Science. 241, 170-176 (1988).</li><li>Toro, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Brain+size+and+folding+of+the+human+cerebral+cortex.">Brain size and folding of the human cerebral cortex.</a> Cereb. Cortex. 18, 2352-2357 (2008).</li><li>Fischl, B., Sereno, M. I., Dale, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cortical+surface-based+analysis.+II:+Inflation,+flattening,+and+a+surface-based+coordinate+system.">Cortical surface-based analysis. II: Inflation, flattening, and a surface-based coordinate system.</a> Neuroimage. 9, 195-207 (1999).</li><li>Dale, A. M., Fischl, B., Sereno, M. I. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Cortical+surface-based+analysis.+I.+Segmentation+and+surface+reconstruction.">Cortical surface-based analysis. I. Segmentation and surface reconstruction.</a> Neuroimage. 9, 179-194 (1999).</li><li>Genovese, C. R., Lazar, N. A., Nichols, T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thresholding+of+statistical+maps+in+functional+neuroimaging+using+the+false+discovery+rate.">Thresholding of statistical maps in functional neuroimaging using the false discovery rate.</a> Neuroimage. 15, 870-878 (2002).</li><li>Desikan, R. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=An+automated+labeling+system+for+subdividing+the+human+cerebral+cortex+on+MRI+scans+into+gyral+based+regions+of+interest.">An automated labeling system for subdividing the human cerebral cortex on MRI scans into gyral based regions of interest.</a> Neuroimage. 31, 968-980 (2006).</li><li>Schaer, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Congenital+heart+disease+affects+local+gyrification+in+22q11.2+deletion+syndrome.">Congenital heart disease affects local gyrification in 22q11.2 deletion syndrome.</a> Dev. Med. Child. Neurol. 51, 746-753 (2009).</li><li>Palaniyappan, L., Mallikarjun, P., Joseph, V., White, T. P., Liddle, P. F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Folding+of+the+Prefrontal+Cortex+in+Schizophrenia:+Regional+Differences+in+Gyrification.">Folding of the Prefrontal Cortex in Schizophrenia: Regional Differences in Gyrification.</a> Biol. Psychiatry. , (2011).</li><li>Zhang, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Decreased+gyrification+in+major+depressive+disorder.">Decreased gyrification in major depressive disorder.</a> Neuroreport. 20, 378-380 (2009).</li><li>Juranek, J., Salman, M. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Anomalous+development+of+brain+structure+and+function+in+spina+bifida+myelomeningocele.">Anomalous development of brain structure and function in spina bifida myelomeningocele.</a> Dev. Disabil. Res. Rev. 16, 23-30 (2010).</li><li>Zhang, Y. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Reduced+cortical+folding+in+mental+retardation.">Reduced cortical folding in mental retardation.</a> AJNR. Am. J. Neuroradiol. 31, 1063-1067 (2010).</li><li>Kuperberg, G. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regionally+localized+thinning+of+the+cerebral+cortex+in+schizophrenia.">Regionally localized thinning of the cerebral cortex in schizophrenia.</a> Archives of general psychiatry. 60, 878-888 (2003).</li><li>Milad, M. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thickness+of+ventromedial+prefrontal+cortex+in+humans+is+correlated+with+extinction+memory.">Thickness of ventromedial prefrontal cortex in humans is correlated with extinction memory.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 102, 10706-10711 (2005).</li><li>Rauch, S. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=A+magnetic+resonance+imaging+study+of+cortical+thickness+in+animal+phobia.">A magnetic resonance imaging study of cortical thickness in animal phobia.</a> Biol. Psychiatry. 55, 946-952 (2004).</li><li>Fjell, A. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Selective+increase+of+cortical+thickness+in+high-performing+elderly--structural+indices+of+optimal+cognitive+aging.">Selective increase of cortical thickness in high-performing elderly--structural indices of optimal cognitive aging.</a> Neuroimage. 29, 984-994 (2006).</li><li>Walhovd, K. B. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Regional+cortical+thickness+matters+in+recall+after+months+more+than+minutes.">Regional cortical thickness matters in recall after months more than minutes.</a> Neuroimage. 31, 1343-1351 (2006).</li><li>Gold, B. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Differing+neuropsychological+and+neuroanatomical+correlates+of+abnormal+reading+in+early-stage+semantic+dementia+and+dementia+of+the+Alzheimer+type.">Differing neuropsychological and neuroanatomical correlates of abnormal reading in early-stage semantic dementia and dementia of the Alzheimer type.</a> Neuropsychologia. 43, 833-846 (2005).</li><li>Salat, D. H. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Thinning+of+the+cerebral+cortex+in+aging.">Thinning of the cerebral cortex in aging.</a> Cereb. Cortex. 14, 721-730 (2004).</li><li>Schaer, M., Eliez, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Contribution+of+structural+brain+imaging+to+our+understanding+of+cortical+development+process.">Contribution of structural brain imaging to our understanding of cortical development process.</a> European Psychiatry Reviews. 2, 13-16 (2009).</li><li>Shaw, P. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed&cmd=Search&doptcmdl=Citation&defaultField=Title+Word&term=Neurodevelopmental+trajectories+of+the+human+cerebral+cortex.">Neurodevelopmental trajectories of the human cerebral cortex.</a> J. Neurosci. 28, 3586-3594 (2008).</li></ol>

Yazarlar ifşa etmek başka bir şey var.

Yukarıdaki protokol serebral T1-ağırlıklı MRG dayalı yerel Gyrification Endeksi ölçmek ve istatistiksel grup karşılaştırmaları yapmak için nasıl açıklar. Bizim metodumuz, özellikle kortikal genişleme sürecinde erken bozulması lokalize ve özellikle ilgi çekici olan pek çok nörogelişimsel ya da psikiyatrik durumlar gibi dizayn edilmiştir. Grubumuzun 1,12 veya diğerleri 13-16 yayınlarda klinik örneklerde grup karşılaştırmaları örnekleri bulunabilir. Bu süreç iki p...

Malzeme: FreeSurfer yüklü (2GHz veya daha hızlı bir işlemci ve 4GB RAM, minimum bir Unix veya Mac iş istasyonu <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki">http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/fswiki</a> , tercihen en son sürümü, ancak büyük sürüm 4.0.3 &#39;den). Yerel Gyrification Endeksi hesaplamak için, MATLAB (gereklidir <a href="http://www.mathworks.ch/">http://www.mathworks.com/</a> Görüntü İşleme Toolbox ile birlikte). Veri: kaliteli bir örnek (yüksek çözünürlük, yüksek kontrast) serebral MRG T1-ağırlıklı veri kümesi. Denek grubu tercihen yaş ve cinsiyet açısından eşleştirilmiş olmalıdır. Normal beyin morfolojisi arası bireysel değişkenliği göz önüne alındığında, her bir grup denek sayısı, varolan bir grubu fark (- daha iyi) tanımlamak için yeterli olmalıdır. Makul bir minimum örneklem büyüklüğü yaklaşık 20 denek olurdugrup başına (sıkı grupları, cinsiyet ve yaş açısından eşleştirilmiş eğer değişiklik yoğunluğu büyük ve muhtemelen daha az gidebilirsiniz rağmen). <table border="1"><tbody><tr><td> Ekipman Adı </td><td> Şirket </td><td> Katalog numarası </td><td> Yorumlar </td></tr><tr><td> FreeSurfer </td><td> Martinos Biyomedikal Görüntüleme, MGH Merkezi </td><td></td><td> Sürüm 4.0.3 daha yeni </td></tr><tr><td> Matlab </td><td> Mathworks </td><td></td><td> Görüntü İşleme Toolbox </td></tr></tbody></table>

how to measure cortical folding from mr images: a step-by-step tutorial to compute local gyrification index

Kortikal katlama (gyrification) Bu dönemde meydana gelen olumsuz olaylar, herhangi bir yaşta tanımlanabilir olacak izler bırakır ki, yaşamın ilk aylarında belirlenir. Mangin ve arkadaşları 2 gibi son zamanlarda tarafından gözden gyrification farklı özellikleri ölçmek için çeşitli yöntemler mevcuttur. Örneğin, sulkal morfometri 3 asimetri, şekil, derinlik, uzunluk ya da inter-hemisferik endeksleri gibi tanımlayıcılar ölçmek için kullanılabilir. Bu geometrik özellikleri yorumlamak kolay olma avantajına sahiptir. Ancak, sulkal morfometri sıkıca sulkuslar belirli bir set doğru tanımlanmasına dayanır ve bu nedenle gyrification parçalanmış bir açıklama sağlar. Gyrification, daha ince taneli kantifikasyon mutlak ortalama eğrilik genellikle kortikal yüzey 4 üzerinden binlerce puan hesaplanır düzeltti eğrilik tabanlı ölçümleri ile elde edilebilir. Ancak eğrilik straightforwar değildircurvedness ve biyolojik olarak anlamlı kortikal hacim veya yüzey olarak ilişkilidir arasında herhangi bir doğrudan bir ilişki var ise belirsizliğini koruyor d kavramak. Kortikal katlama ölçümü ile ortaya çeşitli konuları ele almak için, daha önce enfes bir uzaysal çözünürlüğü ve basit bir yorumlama yerel gyrification ölçmek için bir algoritma geliştirdi. Bizim metodumuz Gyrification Endeksi 5, karşılaştırmalı nöroanatomi aslında türler genelinde kortikal katlanır farklılıklarını değerlendirmek için kullanılan bir yöntem ilham alıyor. Uygulanması, faiz dairesel bölgelerde görünür korteksin miktarı ile karşılaştırıldığında adı l Öcal Gyrification Endeksi (l GI 1), sulkal kıvrımları içinde gömülü korteks miktarını ölçmek . Korteks öncelikle 6 radyal genleşme üzerinden arttığını göz önüne alındığında, bizim yöntem özellikle erken kortikal gelişim kusurları tespit etmek için dizayn edildi. In thmakale, detay FreeSurfer Yazılım bir parçası (serbestçe dağıtılan yerel Gyrification Endeksi, hesaplama, <a href="http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/">http://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/</a> , Biyomedikal Görüntüleme Martinos Merkezi, Massachusetts Genel Hastanesi) FreeSurfer beynin kortikal yüzeyi yapısal MRG verileri otomatik olarak yeniden yapılanma araçları kümesi sağlar. Alt milimetre doğruluğu görüntüleri yerli uzayda çıkartılan kortikal yüzey daha sonra l GI hesaplanması için bir temel olarak hizmet verecek bir dış yüzey oluşturulması için kullanılır. Ilgi dairesel bir bölge daha sonra dış yüzeyi tarif ve kortikal yüzey faiz karşılık gelen bölge, bizim doğrulama çalışmada 1 açıklandığı gibi bir eşleme algoritması kullanılarak tanımlanır. Bu işlemi art arda gyrification kortikal haritalar, ilgi alanları büyük ölçüde üst üste tekrarlanırr sonraki istatistiksel karşılaştırmalar (Şekil 1). Notu, benzer bir ilham ile yerel gyrification başka bir ölçüm katlama dizin her noktada aynı olan bir disk alanına bölünmüş bir küre bulunan kortikal alan oranı olarak hesaplanır Toro ve arkadaşları 7, tarafından önerilen yarıçapı. Toro ve ark biri bu iki uygulamaları farklıdır. Öklid mesafeler dayanmaktadır ve bu nedenle, bizim sıkı bir jeodezik algoritması kullanır ve kortikal alan açma ilgi dairesel bir bölgede beyin yüzeyinde sadece sürekli yama ise kortikal alanın süreksiz yamalar göz önünde bulundurur.

Watch this Scientific Journal Video about How to Measure Cortical Folding from MR Images: a Step-by-Step Tutorial to Compute Local Gyrification Index at JoVE.com

How to Measure Cortical Folding from MR Images: a Step-by-Step Tutorial to Compute Local Gyrification Index

Ölçüm gyrification (kortikal katlama) herhangi bir yaşta, erken beyin gelişiminde bir pencere temsil eder. Bu nedenle, daha önce yarımkürede üzerinde puan binlerce yerel gyrification ölçmek için bir algoritma geliştirdi<sup&gt; 1</sup&gt;. Bu çalışmada, biz detay bu yerel gyrification indeksi hesaplama.

Yerel Gyrification Endeksi hesapla Adım Adım Öğretici: MR Görüntüleri Kortikal Katlama nasıl ölçülür

Cortical folding (gyrification) is determined during the first months of life, so that adverse events occurring during this period leave traces that will ...

how-to-measure-cortical-folding-from-mr-images-step-step-tutorial-to

Research

JoVE Journal

Medicine

27.7K Görüntüleme.  University of Geneva School of Medicine. Ölçüm gyrification (kortikal katlama) herhangi bir yaşta, erken beyin gelişiminde bir pencere temsil eder. Bu nedenle, daha önce yarımkürede üzerinde puan binlerce yerel gyrification ölçmek için bir algoritma geliştirdi 1. Bu çalışmada, biz detay bu yerel gyrification indeksi hesaplama.

Video: How to Measure Cortical Folding from MR Images: a Step-by-Step Tutorial to Compute Local Gyrification Index

Intrauterine Telemetry to Measure Mouse Contractile Pressure In Vivo

A complex integration of molecular and electrical signals is needed to transform a quiescent uterus into a contractile organ at the end of pregnancy. Despite the discovery of key regulators of uterine contractility, this process is still not fully understood. Transgenic mice provide an ideal model in which to study parturition. Previously, the only method to study uterine contractility in the mouse was ex vivo isometric tension recordings, which are suboptimal for several reasons. The uterus must be removed from its physiological environment, a limited time course of investigation is possible, and the mice must be sacrificed. The recent development of radiometric telemetry has allowed for longitudinal, real-time measurements of in vivo intrauterine pressure in mice. Here, the implantation of an intrauterine telemeter to measure pressure changes in the mouse uterus from mid-pregnancy until delivery is described. By comparing differences in pressures between wild type and transgenic mice, the physiological impact of a gene of interest can be elucidated. This technique should expedite the development of therapeutics used to treat myometrial disorders during pregnancy, including preterm labor.

Intrauterine Telemetry to Measure Mouse Contractile Pressure In Vivo

This manuscript provides a protocol for implanting telemeters in the mouse for the purpose of measuring intrauterine pressures during pregnancy.

Rahim içi Telemetri Fare Kontraktil Basıncını Ölçmek<em&gt; İn Vivo</em

A complex integration of molecular and electrical signals is needed to transform a quiescent uterus into a contractile organ at the end of pregnancy. ...

Tıp

Step By Step: Microsurgical training method combining two nonliving animal models

The learning of microsurgical techniques and the maintenance of microsurgical skills have been traditionally based on the use of living animals, mainly laboratory rats. This method although extremely valuable can be economically demanding both for the surgeon and the sponsoring institution; it also requires special training facilities that may not always be available or accessible. Furthermore ethical concerns can limit the use of living animals for training purposes. Alternative training methods, such as inert tubes and gloves have not gained popularity among surgeons since they do not offer an experience similar to that of a clinical situation. Non-living animal models include the use of chicken thighs and wings; they offer a practice experience that resembles a clinical situation to a considerable extent. This type of training is relatively cheap and easily available. The microscope and instruments required can be acquired over the internet, and the chicken pieces can be bought at the local supermarket.
This approach allows a motivated trainee to rehearse different types of surgical techniques several times at a reasonable expense, helping to develop or maintain his surgical expertise if more complex facilities are not available. On the current manuscript we describe how to setup a small practice station, how to dissect the specimens, and how to practice both with the chicken thighs and with the chicken wings in a progressive fashion. This approach takes advantage on the versatility of the chicken thigh model and the small size of the chicken wing Brachial artery.

Here we describe how to set up a small microsurgical practice station and a simple and inexpensive method for the training of microsurgery with non-living animal models.

Adım Adım: İki cansız hayvan modelleri birleştirerek Mikrocerrahi eğitim yöntemi

The learning of microsurgical techniques and the maintenance of microsurgical skills have been traditionally based on the use of living animals, mainly ...

Assessing Cortical Cerebral Microinfarcts on High Resolution MR Images

Cerebral microinfarcts are frequent findings in the post-mortem human brain, and are related to cognitive decline and dementia. Due to their small sizes it is challenging to study them on clinical MRI scans. It was recently demonstrated that cortical microinfarcts can be depicted with MRI scanners using high magnetic field strengths (7T). Based on this experience, a proportion of these lesions is also visible on lower resolution 3T MRI. These findings were corroborated with ex vivo imaging of post-mortem human brain tissue, accompanied by histopathological verification of possible cortical microinfarcts.
Here an ex vivo imaging protocol is presented, for the purpose of validating MR observed cerebral microvascular pathology with histological evaluation. Furthermore, guidelines are provided for the assessment of cortical microinfarcts on both in vivo 7T and 3T MR images. These guidelines provide researchers with a tool to rate cortical microinfarcts on in vivo images of larger patient samples, to further unravel their clinical relevance in cognitive decline and dementia, and establish these lesions as a novel biomarker of cerebral small vessel disease.

A high resolution ex vivo 7T MR imaging protocol is presented, to perform MR-guided histopathological validation of microvascular pathology in post-mortem human brain tissue. Furthermore, guidelines are provided for the assessment of cortical microinfarcts on in vivo 7T as well as 3T MR images.

Yüksek Çözünürlüklü MR Görüntüleri Kortikal üzerinde Serebral mikroinfarktlarının Değerlendirilmesi

Cerebral microinfarcts are frequent findings in the post-mortem human brain, and are related to cognitive decline and dementia. Due to their small sizes ...

Heterotopic Renal Autotransplantation in a Porcine Model: A Step-by-Step Protocol

Kidney transplantation is the treatment of choice for patients suffering from end-stage renal disease. It offers better life expectancy and higher quality of life when compared to dialysis. Although the last few decades have seen major improvements in patient outcomes following kidney transplantation, the increasing shortage of available organs represents a severe problem worldwide. To expand the donor pool, marginal kidney grafts recovered from extended criteria donors (ECD) or donated after circulatory death (DCD) are now accepted for transplantation. To further improve the postoperative outcome of these marginal grafts, research must focus on new therapeutic approaches such as alternative preservation techniques, immunomodulation, gene transfer, and stem cell administration.
Experimental studies in animal models are the final step before newly developed techniques can be translated into clinical practice. Porcine kidney transplantation is an excellent model of human transplantation and allows investigation of novel approaches. The major advantage of the porcine model is its anatomical and physiological similarity to the human body, which facilitates the rapid translation of new findings to clinical trials. This article offers a surgical step-by-step protocol for an autotransplantation model and highlights key factors to ensure experimental success. Adequate pre- and postoperative housing, attentive anesthesia, and consistent surgical techniques result in favorable postoperative outcomes. Resection of the contralateral native kidney provides the opportunity to assess post-transplant graft function. The placement of venous and urinary catheters and the use of metabolic cages allow further detailed evaluation. For long-term follow-up studies and investigation of alternative graft preservation techniques, autotransplantation models are superior to allotransplantation models, as they avoid the confounding bias posed by rejection and immunosuppressive medication.

Porcine models of organ transplantation provide an important platform to study mechanisms of organ preservation. This article describes a heterotopic porcine renal autotransplantation model, which allows investigating new approaches to improve the outcome of transplantation using marginal kidney grafts.

Bir Domuz Modeli heterotopik Böbrek Ototransplantasyon: Bir Adım-Adım Protokolü

Kidney transplantation is the treatment of choice for patients suffering from end-stage renal disease. It offers better life expectancy and higher quality ...

A Step by Step Protocol for Subretinal Surgery in Rabbits

Age related macular degeneration (AMD), retinitis pigmentosa, and other RPE related diseases are the most common causes for irreversible loss of vision in adults in industrially developed countries. RPE transplantation appears to be a promising therapy, as it may replace dysfunctional RPE, restore its function, and thereby vision.
Here we describe a method for transplanting a cultured RPE monolayer on a scaffold into the subretinal space (SRS) of rabbits. After vitrectomy xenotransplants were delivered into the SRS using a custom made shooter consisting of a 20-gauge metallic nozzle with a polytetrafluoroethylene (PTFE) coated plunger. The current technique evolved in over 150 rabbit surgeries over 6 years. Post-operative follow-up can be obtained using non-invasive and repetitive in vivo imaging such as spectral domain optical coherence tomography (SD-OCT) followed by perfusion-fixed histology.
The method has well-defined steps for easy learning and high success rate. Rabbits are considered a large eye animal model useful in preclinical studies for clinical translation. In this context rabbits are a cost-efficient and perhaps convenient alternative to other large eye animal models.

Retinal pigment epithelium (RPE) replacement strategies and gene-based therapy are considered for several retinal degenerative conditions. For clinical translation, large eye animal models are required to study surgical techniques applicable in patients. Here we present a rabbit model for subretinal surgery geared towards RPE transplantation, which is versatile and cost-efficient.

Tavşanlarda Subretinal Cerrahi Adım Protokolle Bir Adım

Age related macular degeneration (AMD), retinitis pigmentosa, and other RPE related diseases are the most common causes for irreversible loss of vision in ...

A Clinical Trial Assessing the Safety, Efficacy, and Delivery of Olive-Oil-Based Three-Chamber Bags for Parenteral Nutrition

Limited evidence exists to precisely estimate efficacy and safety differences between parenteral nutrition (PN) prepared using olive-oil-based three-chamber bags (3CBs) and soybean-oil-based compounded bags (CoBs) in hospitalized adult patients. We designed a multicenter, randomized, prospective, open-label, noninferiority protocol to compare the efficacy, safety, and distribution of olive-oil-based 3CBs and soybean-oil-based CoB formulations in adult Chinese patients requiring PN during surgical intervention. Subjects were randomized to receive either one of the study treatments using an interactive voice or web-based recognition system in accordance with the randomization code. Randomization was further stratified based on the study site and surgical category. Both treatment groups received similar amounts of calories and protein. In addition, the two study treatments contained a similar composition of the amino-acid component. The only difference between the two PN formulations was the lipid constitution. The duration of administration of study treatments was a minimum of 5 days up to a maximum of 14 days after the surgical procedure. The primary efficacy endpoint was serum prealbumin levels on day 5 of the study. Noninferiority was proved if the anti-log of the lower bound of the 95% confidence interval (CI) of the treatment difference was at least 0.80. Other efficacy measures included treatment preparation time; duration to achieve tolerability of oral nutrition; associated infectious complications; length of hospitalization; and laboratory assessment of markers of nutrition, inflammation, metabolism, and oxidative stress. A total of 458 patients were enrolled in the study. The results showed that olive-oil-based 3CBs were non-inferior to soybean-based CoBs, besides being well tolerated. The infection rate was found to be significantly lower in the olive-oil-based 3CB group. Thus, this study may be used as a reference for future research on lipid emulsion and 3CBs.

Here, we present a protocol for a study comparing the efficacy, safety, and delivery of olive-oil-based 3CB and soybean-oil-based CoB formulations in adults requiring parenteral nutrition. The results revealed that olive-oil-based 3CBs is non-inferior and well tolerated compared to soybean formulations.

Parenteral Beslenme için Zeytinyağı Bazlı Üç Odalı Poşetlerin Güvenliğini, Etkinliğini ve Teslimini Değerlendiren Klinik Bir Çalışma

Limited evidence exists to precisely estimate efficacy and safety differences between parenteral nutrition (PN) prepared using olive-oil-based ...

Obtaining Quality Extended Field-of-View Ultrasound Images of Skeletal Muscle to Measure Muscle Fascicle Length

Muscle fascicle length, which is commonly measured in vivo using traditional ultrasound, is an important parameter defining a muscle&#8217;s force generating capacity. However, over 90% of all upper limb muscles and 85% of all lower limb muscles have optimal fascicle lengths longer than the field-of-view of common traditional ultrasound (T-US) probes. A newer, less frequently adopted method called extended field-of-view ultrasound (EFOV-US) can enable direct measurement of fascicles longer than the field-of-view of a single T-US image. This method, which automatically fits together a sequence of T-US images from a dynamic scan, has been demonstrated to be valid and reliable for obtaining muscle fascicle lengths in vivo. Despite the numerous skeletal muscles with long fascicles and the validity of the EFOV-US method for making measurements of such fascicles, few published studies have utilized this method. In this study, we demonstrate both how to implement the EFOV-US method to obtain high quality musculoskeletal images and how to quantify fascicle lengths from those images. We expect that this demonstration will encourage the use of the EFOV-US method to increase the pool of muscles, both in healthy and impaired populations, for which we have in vivo muscle fascicle length data.

This study describes how to obtain high quality musculoskeletal images using the extended field-of-view ultrasound (EFOV-US) method for the purpose of making muscle fascicle length measures. We apply this method to muscles with fascicles that extend past the field-of-view of common traditional ultrasound (T-US) probes.

Kas Fasikül Uzunluğunu Ölçmek için İskelet Kasının Kaliteli Genişletilmiş Görüş Alanı Ultrason Görüntülerinin Elde Ediliyor

Muscle fascicle length, which is commonly measured in vivo using traditional ultrasound, is an important parameter defining a muscle&#8217;s force ...

Step-by-Step Stapedotomy through Transcanal Exclusive Endoscopic Approach

In recent years there has been an increasing trend in the use of the endoscope to treat a variety of middle ear pathologies, including otosclerosis. Several studies comparing traditional microscopic and endoscopic stapes surgery have reported similar hearing results and an overall low rate of complications. The endoscope has unraveled its full potential in demanding settings of stapes surgery, such as unfavorable anatomy of the oval window niche or revision cases. Reduced manipulation of the chorda tympani and low rate of post-operative dysgeusia are further benefits to mention for endoscopic stapes surgery.
Being a one-handed technique, management of bleeding, positioning, and crimping of the prosthesis may be challenging for novice endoscopic surgeons, so some training in endoscopic ear surgery is recommended before performing endoscopic stapedotomy. The problem of sharing the surgical field between the endoscope and the operating instruments could be easily overcome if proper instruments positioning is understood. One-handed bleeding control in the narrow space of the ear canal may represent an issue during the elevation of the tympano-meatal flap, possibly discouraging the surgeon since the preliminary steps of surgery. Following appropriate technique to raise the flap and the collaboration with the anesthesiology team in keeping the blood pressure low guarantee an adequate bleeding control in most cases.
The aim of this article is to describe the entire surgical procedure of a transcanal exclusive endoscopic stapedotomy, from operating room set up and patient positioning to post-operative care. A step-by-step description of the surgical maneuvers with technical hints is reported, to guide the surgeon across the procedure and allow any ear surgeon to perform stapes surgery endoscopically.

The aim of this article is to provide a step-by-step method for endoscopic stapes surgery from operating room setting and patient positioning to post-operative care. This work would represent a guide for any otologic surgeon who is willing to treat otosclerosis with endoscopic transcanal technique.

Transkanal Özel Endoskopik Yaklaşım ile Adım Adım Stapedotomi

In recent years there has been an increasing trend in the use of the endoscope to treat a variety of middle ear pathologies, including otosclerosis. ...

Improved Renal Denervation Mitigated Hypertension Induced by Angiotensin II Infusion

The benefits of renal sympathetic denervation (RDN) on blood pressure have been proved in a large number of clinical trials in recent years. However, the regulatory mechanism of RDN on hypertension remains elusive. Thus, it&#39;s essential to establish a simpler RDN model in mice. In this study, osmotic mini pumps filled with Angiotensin II were implanted in 14-week-old C57BL/6 mice. One week after the implantation of the mini-osmotic pump, a modified RDN procedure was performed on bilateral renal arteries of the mice using phenol. Age-sex-matched mice were given saline and served as sham group. Blood pressure was measured at baseline and every week subsequently for 21 days. Then, renal artery, abdominal aorta and heart were collected for histological examination using H&#38;E and Masson staining. In this study, we present a simple, practical, repeatable, and standardized RDN model, which can control hypertension and alleviate cardiac hypertrophy. The technique can denervate peripheral renal sympathetic nerves without renal artery damage. Compared to previous models, the modified RDN facilitates the study of the pathobiology and pathophysiology of hypertension.

Here, we present a protocol for renal sympathetic denervation (RDN) in mice with hypertension induced by Angiotensin II infusion. The procedure is repeatable, convenient and allows to study the regulatory mechanisms of RDN on hypertension and cardiac hypertrophy.

Anjiyotensin II İnfüzyonu ile İndüklenen Geliştirilmiş Renal Denervasyon Azaltılmış Hipertansiyon

The benefits of renal sympathetic denervation (RDN) on blood pressure have been proved in a large number of clinical trials in recent years. However, the ...

An Educational Video Demonstration of How to Prone a Critically Ill Intubated Patient

Early in the coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic, it was reported that prone position was beneficial for mechanically ventilated COVID-19 patients with acute respiratory distress syndrome (ARDS). However, for staff in some small and large hospitals, experience with this intervention was low. Select hospitals were able to assemble proning teams; but, as facilities began to experience staffing shortages, they found proning teams unsustainable, and less specialized staff needed to learn how to safely prone patients.
Proning is a high-risk procedure-a lack of a standard approach can result in staff confusion and poor patient outcomes, including unintentional endotracheal tube (ET) loss, vascular access dislodgement, and skin breakdown. Given the acuity and high patient volume, translating a complex procedure into written policy may not be entirely effective. Critical care nurses, respiratory therapists, physical therapists, wound nurses, nurse practitioners, physician assistants, and medical doctors need to be prepared to safely perform this procedure for an acutely ill COVID-19 patient.
Communication, teamwork, and multidisciplinary collaboration are critical for complication avoidance. Interventions to prevent tube and vascular access dislodgement, skin breakdown, and brachial plexus and soft tissue injury must be implemented during the procedure. Repositioning the patient in the prone position, as well as returning the patient to supine positioning, should be components of a comprehensive proning plan.

Proning a critically ill patient with severe acute respiratory distress syndrome (ARDS) is a complex but beneficial procedure. Excellent communication skills, team work, and multidisciplinary collaboration are critical for patient and staff safety. A standard procedure should be utilized when proning ventilated patients with tubes, drains, and vascular access devices.