הדמיית מיקרואורגניזמים קרקע באמצעות מצג שקופיות מגע ומיקרוסקופיה

Overview

מקור: מעבדות של ד"ר איאן פפר וד"ר צ'ארלס גרבה - אוניברסיטת אריזונה
מחבר מפגין: בראדלי שמיץ

האדמה כוללת את השכבה הדקה על פני כדור הארץ, המכילה גורמים ביוטיים ואביוטיים התורמים לחיים. החלק האביוטי כולל חלקיקים אנאורגניים הנעים בגודלם ובצורתם הקובעים את מרקם הקרקע. החלק הביוטי משלב שאריות צמחים, שורשים, חומר אורגני ומיקרואורגניזמים. שפע חיידקי הקרקע ומגוון הוא נרחב, כמו גרם אחד של אדמה מכיל 10^7-8 חיידקים, 10^6-8 actinomycetes, 10^5-6 פטריות, 10³ שמרים, 10^4-6 פרוטוזואה, 10^3-4 אצות, ו 5³ נמטודות. יחד, הגורמים הביוטיים והאביוטיים יוצרים ארכיטקטורות סביב שורשי הצמח, המכונה הריזוספירה, המספקות תנאים נוחים למיקרואורגניזמים בקרקע.

גורמים ביוטיים ואביוטיים מקדמים את החיים בקרקעות. עם זאת, הם גם תורמים דינמיקה מלחיצה המגבילה חיידקים. מתח ביוטי כרוך בתחרות בין החיים כדי להסתגל ולשרוד בתנאים סביבתיים. לדוגמה, חיידקים יכולים להפריש חומרים מעכבים או רעילים כדי לפגוע במיקרואורגניזמים שכנים. פניציליום נוטטום הוא פטרייה ידועה לשמצה, כפי שהוא מפחית את התחרות על חומרים מזינים על ידי ייצור מיקרוביאלית, אשר בני אדם לקצור כדי ליצור פניצילין התרופות. לחצים אביוטיים נובעים ממאפיינים פיזיים או כימיים המגבילים את ההישרדות המיקרוביאלית, כגון אור, לחות, טמפרטורה, pH, חומרים מזינים ומרקם.

Procedure

1. הכנת מיקרוקוסמוס של שקופית הקרקע

אוספים אדמת גן מפני השטח (עומק 0-6 אינץ'), ומשקלים 150 גרם אדמה לשתי כוסות נפרדות.
1. אם לקרקע יש צפיפות גבוהה של חומר אורגני, שקול 100 גרם.
תייג אחת טיפול והשני בקרה.
חשב את כמות המים הדרושה לשינוי תכולת הלחות.
1. תכולת הלחות קרובה לעתי?...

Results

פטריות מציגות הייהה עבה, חוטית(איור 2). Actinomycetes להציג hyphae דק, filamentous. חיידקים מציגים צורות קטנות של קוצ'י או מוט. הם נמצאים לעתים קרובות בגושים, על חלקיקי אדמה, או רירית hyphae פטרייתי. חלקיקי קרקע מציגים צורות כהות ולא סדירות(איור 3).

Application and Summary

בדיקת שקופיות המגע, המכונה גם שקופית קבורה, היא טכניקה פשוטה המשמשת להתבוננות איכותית בביוטה הקרקע. בדיקת אסקור זו מראה באופן איכותי את האינטראקציות המרחביות בין hyphae פטרייתי, חוטי actinomycete, חיידקים, וחלקיקי קרקע. יחידים או תעשייה יכולים להשתמש בבחינה זו כדי לאסוף ידע על בריאות האדמה הספציפי...

References

Pepper, I. L., & Gerba, C P. 'Contact Slide Assay.' Environmental Microbiology A Laboratory Manual. 2nd ed. Elsevier 19-25 (2004).
Pepper, I. L., Gerba, C. P., & Gentry, T. J. 'Earth Environments.' Environmental Microbiology. 3rd ed. Elsevier 59-88 (2014).
Rossi, G., Ricardo, S., Gesue, G., Stanganelli, M., and Want, T.K. Direct Microscopic and bacteriological investigations of the soil. Soil Science. 41, 52 – 66 (1936).

Skip to...