Visualizzazione dei microrganismi del suolo tramite il test su vetrino a contatto e microscopia

Fonte: Laboratori del Dr. Ian Pepper e del Dr. Charles Gerba - Università dell'Arizona
Autore dimostrativo: Bradley Schmitz

Il suolo comprende il sottile strato sulla superficie terrestre, contenente fattori biotici e abiotici che contribuiscono alla vita. La porzione abiotica comprende particelle inorganiche di dimensioni e forma variabili che determinano la consistenza del suolo. La porzione biotica incorpora residui vegetali, radici, materia organica e microrganismi. L'abbondanza e la diversità dei microbi del suolo è espansiva, poiché un grammo di terreno contiene 10^{batteri 7-8, 10 6-8} actinomiceti,^{10 funghi 5-6, 10 3} lieviti,^{10 4-6} protozoi,^{10 3-4} alghe e 5³ nematodi. Insieme, i fattori biotici e abiotici formano architetture attorno alle radici delle piante, note come rizosfera, che forniscono condizioni favorevoli per i microrganismi del suolo.

I fattori biotici e abiotici promuovono la vita nei suoli. Tuttavia, contribuiscono anche a dinamiche stressanti che limitano i microbi. Lo stress biotico comporta la competizione tra la vita per adattarsi e sopravvivere in condizioni ambientali. Ad esempio, i microbi possono secernere sostanze inibitorie o tossiche per danneggiare i microrganismi vicini. Penicillium notatum è un fungo famigerato, in quanto riduce la competizione per i nutrienti producendo un antimicrobico, che gli esseri umani raccolgono per creare la penicillina farmaceutica. Gli stress abiotici derivano da proprietà fisiche o chimiche che limitano la sopravvivenza microbica, come luce, umidità, temperatura, pH, sostanze nutritive e consistenza.