Sign In

Extraction par sonication de biomarqueurs lipidiques de sédiments

Overview

Source : Laboratoire de Jeff Sanoussi - University of Massachusetts Amherst

Le matériel comprenant la part « bio » vie de l’écosystème (feuilles, champignons, écorce, tissu ; La figure 1) diffère fondamentalement de la matière de la part de « inorganique » non biologiques (roches et leurs constituants minéraux, oxygène, eau, métaux). Matière organique contient du carbone lié à une série d’autres molécules de carbone et d’hydrogène (Figure 2), ce qui le distingue de matières inorganiques. Gamme de large de Valence du carbone (03:56) lui permet de se former jusqu'à quatre liaisons covalentes séparés avec voisins atomes, habituellement C, H, O, N, S et P. Il peut également partager jusqu'à trois liaisons covalentes avec un seul autre atome, comme la triple liaison dans le groupe cyanure ou nitrile, souvent toxique. Durant les dernières années de 4,6 milliards, cette flexibilité a entraîné un extraordinaire éventail de structures chimiques, qui peuvent varier en taille, la complexité, polarité, forme et fonction. Le domaine scientifique de la géochimie organique traite de l’identification et la caractérisation de l’ensemble des composés organiques détectable, appelé biomarqueurs, produites par la vie sur cette planète, ainsi que d’autres, par le biais de temps géologiques.

Figure 1
La figure 1. Les matières organiques, comme les arbres, les feuilles et mousses, sont chimiquement et visuellement distincte de matières inorganiques, tels que de la chaussée.

Procedure

1. rassemblez le matériel nécessaire

  1. Échantillons (feuilles, terre, champignons, écorce, tissus), généralement congelé, lyophilisé, écrasés et homogénéisé avant l’extraction, extraite en groupes afin de maximiser l’efficacité. Extrait de trois échantillons.
  2. Selon la taille de l’échantillon, les flacons avec des volumes allant de 4 à 60 mL peuvent être utilisés. Pour cette expérience, les flacons en verre de borosilicate (40 mL) et solvants sécuritaires casquettes sont util...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

À la fin de l’extraction, un extrait de lipides totaux (TLE) pour chaque échantillon est évident. Chaque flacon contient de la matière organique extractible de sédiment, sol ou des tissus végétaux. Ces DFIT peut désormais être analysés et leurs constituants chimiques identifiés et quantifiés.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

Différentes classes de biomarqueurs communiquer des informations sur des aspects spécifiques du système terrestre. Par exemple, à ses débuts, géochimie organique était essentiellement chargé de la formation, la migration et transformation du pétrole, et plusieurs des outils chimiques organiques géochimistes utilisent aujourd'hui sont basées sur ces enquêtes initiales. C’est grâce à l’enquête d’une classe de composés appelés isoprénoïdes, ayant un motif répétitif de cinq carbone (Figure ...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
Sonication ExtractionLipid BiomarkersSedimentPaleoclimatologyOrganic ComponentsUltrasonic WavesSolvent OptimizationLike Dissolves Like RuleApolar SolventsPolar SolventsSolvent MixturesSonication SystemUltrasound Waves

Skip to...

0:00

Overview

0:59

Principles of Lipid Extraction by Sonication

2:35

Sample Collection and Glassware Preparation

3:26

Sonication

5:13

Applications

6:55

Summary

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved