Sign In

Ultraschall-Extraktion von Lipid-Biomarkern aus Sediment

Overview

Quelle: Labor von Jeff Salacup - University of Massachusetts Amherst

Das Material, bestehend aus der lebenden "Bio" Anteil an jedem Ökosystem (Blätter, Pilze, Rinde, Gewebe; Abbildung 1) unterscheidet sich grundlegend von dem Material der unbelebten "anorganischen" Aktie (Felsen und ihre konstituierenden Mineralien, Sauerstoff, Wasser, Metalle). Organisches Material enthält Kohlenstoff verbunden zu einer Reihe anderer Kohlenstoff und Wasserstoff Moleküle (Abbildung 2), die sie von anorganischem Material unterscheidet. Carbon ermöglicht breite Valenz (03:56) es, bis zu vier separate kovalente Bindungen mit benachbarten Atomen, in der Regel C, H, O, N, S und P. bilden Es kann bis zu drei kovalente Bindungen auch teilen, mit einem anderen Atom, wie z. B. die Dreifachbindung in der oft giftige Zyanid oder Nitril, Gruppe. Seit 4,6 Milliarden Jahren führte diese Flexibilität zu einer erstaunlichen Vielfalt an chemischen Strukturen, die sich in Größe, Komplexität, Polarität, Form und Funktion unterscheiden. Der wissenschaftlichen Bereich der organische Geochemie befasst sich mit der Identifizierung und Charakterisierung des Gesamtangebots von nachweisbaren organischen Verbindungen, Biomarker, produziert von Leben auf diesem Planeten, sowie andere, durch geologische Zeit genannt.

Figure 1
Abbildung 1. Organisches Material, wie Bäume, Blätter und Moos, unterscheiden sich chemisch und visuell von anorganischem Material wie Pflaster.

Procedure

(1) die notwendigen Materialien zu sammeln.

  1. Proben (Blätter, Schmutz, Pilzen, Rinde, Gewebe), in der Regel eingefroren, gefriergetrocknet, zerkleinert und homogenisiert vor Extraktion, extrahiert in Gruppen um die Effizienz zu maximieren. Drei Proben zu extrahieren.
  2. Abhängig von der Größe der Stichprobe können mit einem Volumen von 4-60 mL Fläschchen verwendet werden. Für dieses Experiment Borosilikat Glasvials (40 mL) und Lösungsmittel sicher Kappen verwendet. Fläschchen, Borosilikatglas P...

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Results

Am Ende der Extraktion zeigt sich ein insgesamt Lipid-Extrakt (TLE) für jede Probe. Jede Durchstechflasche enthält die extrahierbare organische Substanz vom Sediment, Boden oder Pflanzengewebe. Diese TLEs können jetzt analysiert und ihre chemischen Bestandteile identifiziert und quantifiziert.

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Application and Summary

Verschiedene Klassen von Biomarkern vermitteln Informationen über spezifische Aspekte des Systems Erde. Zum Beispiel in den Kinderschuhen, organische Geochemie befasste sich hauptsächlich mit der Bildung, Migration und Veränderung von Erdöl, und viele der chemischen Werkzeuge verwenden organische Geochemiker heute basieren auf dieser ersten Untersuchungen. Es war durch die Untersuchung einer Klasse von Verbindungen genannt Isoprenoids, nachdem ein sich wiederholendes fünf Kohlenstoff-Muster (Abbildung 2

Log in or to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Tags
Sonication ExtractionLipid BiomarkersSedimentPaleoclimatologyOrganic ComponentsUltrasonic WavesSolvent OptimizationLike Dissolves Like RuleApolar SolventsPolar SolventsSolvent MixturesSonication SystemUltrasound Waves

Skip to...

0:00

Overview

0:59

Principles of Lipid Extraction by Sonication

2:35

Sample Collection and Glassware Preparation

3:26

Sonication

5:13

Applications

6:55

Summary

JoVE Logo

Privacy

Terms of Use

Policies

Research

Education

ABOUT JoVE

Copyright © 2025 MyJoVE Corporation. All rights reserved